Bolu-Gölcük Tabiat Parkının aktinobakteri biyoçeşitliliğinin belirlenmesi
Determination of actinobacteria biodiversity of Bolu-Gölcük Natural Park
- Tez No: 468172
- Danışmanlar: PROF. DR. NEVZAT ŞAHİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: 16S rRNA geni, Actinobacteria, Biyoçeşitlilik, Gölcük, 16S rRNA gene, Actinobacteria, Biodiversity, Gölcük
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 151
Özet
Bu çalışmada, Bolu-Gölcük Tabiat Parkının Aktinobakteri biyoçeşitliliğinin belirlenmesi ve olası yeni türlerin literatüre kazandırılması hedeflendi. Bolu-Gölcük Tabiat Parkından alınan sediment örneklerinden aktinomiset izolasyonu dilüsyon plak yöntemi ile gerçekleştirildi. Seçici izolasyon besiyeri olarak SM1, SM2, SM3, Marine, M1, HV, Nocardia, NBRC, R2A ve Nişasta-Kazein agar kullanıldı. Farklı koloni morfolojileri dikkate alınarak seçilen izolatlar numaralandırılıp saflaştırılarak stoklandı. Genomik DNA'ları izole edilen 50 izolatın 16S rRNA gen bölgesi PCR amplifikasyonları 27f ve 1525r evrensel primerleri ile gerçekleştirildi. Filogenetik ağaçlar MEGA 7.0 yazılımı kullanılarak Neighbour-Joining algoritması ile gerçekleştirildi. Filogenetik verilere göre 21 izolat Streptomyces, 9 izolat Nocardia, 7 izolat Micromonospora, 5 izolat Actinomadura, 4 izolat Nonomuraea, 1 izolat Saccharopolyspora, 1 izolat Mycobacterium, 1 izolat Pseudonocardia ve 1 izolat ise Proteobacteria filumunun ait Enhydrobacter cinsinin üyesi olarak belirlendi. 16S rRNA gen bölgesi nükleotit dizi analizlerine göre nükleotit farklılığı yüksek olan izolatların ilgili tip türleri ile DNA-DNA hibridizasyon testi yapılarak yeni bir tür oldukları kesinleştirildikten sonra fenotipik ve kemotaksonomik karakterizasyonları sonucunda literatüre kazandırılabilmesi oldukça mümkündür.
Özet (Çeviri)
The purpose of this study was to identify the biodiversity of actinobacteria at Bolu-Gölcük natural park and to add possible novel species to the literature. Dilution plate assay was used for isolation of Actinomycetes from sediments collected from different locations of Bolu-Gölcük natural park. SM1, SM2, SM3, Marine, M1, HV, Nocardia, NBRC, R2A and Starch-Casein agar were used to prepare selective isolation media. Based on colony morphologies, 50 isolates were selected from isolation plates, which were then purified and stored. PCR-mediated amplification of the 16S rRNA gene locus of the isolates were done using 27F and 1525R universal primers. Phylogenetic trees were generated by Neighbour-Joining Algorithm using MEGA 7 software. Regarding phylogenetic data, 21 Streptomyces, 9 Nocardia, 7 Micromonospora, 5 Actinomadura, 4 Nonomuraea, 1 Saccharopolyspora, 1 Mycobacterium 1 Pseudonocardia and 1 was identified as the genus Enhydrobacter of the Proteobacteria phylum were identified from those isolates. It is quite possible that the isolates with high nucleotide differences according to the 16S rRNA gene sequence analysis can be integrated into the literature as a result of phenotypic and chemotaxonomic characterization after being confirmed as a new species by carrying out DNA-DNA hybridization tests with related species of isolates.
Benzer Tezler
- Gölcük göleti balıklarının deri ve kas dokularında PAH seviyelerinin belirlenmesi
Determination of PAHs levels in the skin and muscle tissues of Gölcük lake fish
GAMZE GÜLTOPU
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Çevre MühendisliğiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DURAN KARAKAŞ
- Rekreasyonel aktivitelerin Gölcük tabiat parkına etkilerinin araştırılması
Investigation of effects of recreational activities on the Gölcük national park
MELİKE BÜŞRA BAYRAMOĞLU KARŞI
Doktora
Türkçe
2017
Çevre MühendisliğiAbant İzzet Baysal ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DURAN KARAKAŞ
- Mangallı piknik aktivitelerinden kaynaklanan partikül ve gaz formlarındaki polisiklik aromatik hidrokarbon (PAH) bileşiklerinin seviyelerinin belirlenmesi
Determination of levels of particulate and gaseous PAH compounds emitted from barbeque activities
ESLEM ÇINAR EROL
Doktora
Türkçe
2024
Çevre MühendisliğiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DURAN KARAKAŞ
- Yüzey toprakları, göl dip çamuru ve göl balıkları örneklerinde mangallı piknik emisyonlarından kaynaklanan toplam civa seviyelerinin belirlenmesi
Determination of total mercury levels from barbecue picnic emissions in surface soils, lake bottom mud and lake fish samples
BERNA DURMUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Çevre MühendisliğiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DURAN KARAKAŞ
- Kur'an'da deprem
Earthquake in Qur'an
MUTLU SAYLIK
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
DinYüzüncü Yıl ÜniversitesiTemel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELAHATTİN SÖNMEZSOY