Geri Dön

Akım sitometri tekniği ile yeni doğan fare beyninden bölgesel olarak izole edilmiş spesifik hücrelerin protein profillerinin incelenmesi

Identification of protein profiles of regionally isolated specific cells from newborn mice brain by flow cytometry

PDF İndir

  1. Tez No: 471611
  2. Yazar: EMRE VATANDAŞLAR
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. DENİZ DURALI, PROF. DR. ERTUĞRUL KILIÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Medipol Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 80

Özet

Memeli santral sinir sistemi (SSS) yapısal ve işlevsel organizasyonu ile yaşayan organizmalar arasında en karmaşık yapıya sahip olan sistemdir. Bu kompleks sistemin işleyiş mekanizması ise ancak beyni oluşturan hücrelerin, uzaysal ve zamansal konumları ile birlikte ele alınmasıyla anlaşılabilir. Çalışmamızda bu hücrelerin protein profillerinin çıkarılarak tanımlanması amaçlanmıştır. Bu amaçla; öncelikle yenidoğan farelerdeki hipokampüs ve korteks bölgelerine ait hücreler antikorlar ile işaretlenerek akım sitometri cihazı ile analiz edilmiştir. Analiz sonucu tespit edilen astrositler ile negatif seçilim yöntemi ile analize dâhil edilen nöronlar Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS) tekniği ile ayrıştırılarak saflaştırılmıştır. Hipokampüs ve korteks bölgelerinden izole ettiğimiz nöron ve astrositlerdeki proteinlerin tanımlanması ve ekspresyonlarının belirlenmesi için kütle spektrometresi tabanlı protemik teknolojisi kullanılmıştır. Yenidoğan fare hipokampüsünden toplam 67, korteksten ise 107 protein tanımlanmıştır. Bu proteinlerden 45 tanesi hipokampüste, 85 tanesi kortekste bulunurken 22 tanesi her iki bölgede de tespit edilmiştir. Bunlara ek olarak, biyoinformatik yazılımlar kullanılarak tanımlanan proteinlerin sınıfları ve fonksiyonları incelenmiştir. Sonuç olarak bu çalışmada tanımlanan 22 ortak protein arasından 5 proteinin hipokampüs bölgesinde astrositlerde, korteks bölgesinde ise nöronlarda daha çok eksprese edildiği gözlenmiştir. Bu 5 proteinden 3'ünün özellikle migrasyon, bölünme ve maturasyon sürecinde rol oynadıkları belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Central nervous system (CNS) of mammalians constitutes the most complex architecture among other living organisms in terms of structural and functional organization. The operation mechanism of this complex system could solely be deciphered by addressing the spatial and time-wise state of cells that compose brain. In our study, we aimed comprising protein profiles of these cells, along with obtaining their fulfilled identification. For this purpose, hippocampus and cortex cells of newborn mice were tagged with antibodies and analyzed by flow cytometry. Astrocytes that were detected by the analysis and neurons that were included in the analysis by negative selection method were both separated and purified by Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS). In order to identify the proteins of neurons and astrocytes isolated from hippocampus and cortex regions and define their expression levels, mass spectrometry based proteomic technology was used. Total of 67 proteins from hippocampus and 107 proteins from cortex of newborn mice were identified. Among these proteins, 45 of them were detected in hippocampus, 85 of them were found in cortex and 22 of them were observed in both regions. In addition, identified proteins were screened in terms of their classes and functions by bioinformatics software. In conclusion, among 22 mutual proteins identified in this study, 5 were expressed densely in astrocytes in hippocampus and neurons in cortex. 3 of these 5 proteins were found to play crucial role in migration, division and maturation process.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    557722

    Mezenkimal kök hücrelerin ın vıtro koşullarda testis mikroçevresi ve spermatogonyal kök hücre havuzunun korunmasına etkisinin araştırılması

    Researching the effect of mesenchymal stem cells on the testicular microenvironment and the spermatogonial stem cell pool under in vitro conditions

    SELİN ÖNEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Histoloji ve EmbriyolojiHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. PETEK KORKUSUZ

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEVİL KÖSE

  2. Tez No

    352438

    A study on the localization of alternative MEFV transcripts in neutrophil-like cells

    MEFV alternatif transkriptlerinin nötrofil benzeri hücrelerde lokalizasyon çalışması

    ŞULE ERDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EDA TAHİR TURANLI

  3. Tez No

    523223

    Karadeniz alabalığında (Salmo trutta Labrax) bazı kromozom manipülasyon çalışmaları

    Some chromosomal manipulation studies on Black Sea trout (Salmo trutta Labrax)

    RAHMİ CAN ÖZDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Su Ürünleriİstanbul Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYGÜL EKİCİ

  4. Tez No

    619133

    Differentiation of vessel wall cells from umbilical cord blood mesenchymal cells for vascular tissue engineering

    Damar doku mühendisliği amacıyla kordon kanı mezenkimal hücrelerinden damar duvarı endotel hücre farklılaşması

    PINAR HÜNER OMAY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAKAN BERMEK

  5. Tez No

    21836

    On the point vortex dynamics

    Noktasal girdap dinamiği üzerine

    AHMET KUTSİ NİRCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1992

    Gemi Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    YRD. DOÇ. DR. ALİ RANA ATILGAN

Geri Dön