İç Anadolu bölgesinde yayılış gösteren Nannospalax xanthodon Satunin, 1898 (Mammalia:Rodentia)'un 2n = 54 ve 2n = 60 sitotiplerinin ISSR tekniği kullanılarak moleküler filogenisi
Molecular phylogeny of the 2n=54 and 2n=60 cytotypes of Nannospalax xanthodon Satunin, 1898 (Mammalia:Rodentia) from Central Anatolia by ISSR marker technique
- Tez No: 472873
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. TUBA YAĞCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 50
Özet
İç Anadolu bölgesinde yayılış gösteren Nannospalax xanthodon' un 2n = 54 ve 2n = 60 sitotiplerine ait toplam 36 örnek ISSR-PCR (Inter Simple Sequence Repeat-Polymerase Chain Reaction) tekniği kullanılarak analiz edildi. Optimizasyonu sağlanan 7 ISSR primerinden ((AG)8T, (GGAGA)5, (GACA)4, (TG)8A, (CAG)5GC, (CAG)4AC ve (GA)8AC) 101'i polimorfik olmak üzere 112 bant üretildi. Bu primerlerden (AG)8T ve (GA)8AC primerleri 2n = 54 ve 2n = 60 sitotiplerine özgü bantlar üreterek, sitotipleri ayırt edebilmek için en bilgilendirici oldu. En iyi optimizasyonun sağlandığı markörler aracılığıyla belirlenen polimorfizm oranları kullanılarak 'Genetik mesafe matriksi' hesaplandı. Jaccard katsayısına dayalı olarak hesaplanan UPGMA (Unweighted Pair Group Mean Average) analizinde iki sitotipin belirgin olarak ayrıldığı tespit edildi.
Özet (Çeviri)
A total of 36 samples of 2n = 54 and 2n = 60 cytotypes of Nannospalax xanthodon, spreading in the Central Anatolia region, were analysed by using ISSR-PCR (Inter-Simple Sequence Repeat-Polymerase Chain Reaction) technique. 112 bands were produced, 101 of which were polymorphic, from optimised 7 ISSR primers ((AG)8T, (GGAGA)5, (GACA)4, (TG)8A, (CAG)5GC, (CAG)4AC and (GA)8AC). (AG)8T and (GA)8AC primers which were from these primers were most informative to distinguish cytotypes by producing bands specific for 2n = 54 and 2n = 60 cytotypes. The genetic distance matrix was calculated using the polymorphism rates determined by the markers provided with the best optimisation. It was determined that the two cytotypes were distinctly separated in the UPGMA (Unweighted Pair Group Mean Average) analysis calculated based on the Jaccard coefficient.
Benzer Tezler
- Nannospalax xanthodon (Rrodentıa:Spalacidae)'un farklı kromozom soylarında mitokondriyal DNA'nın 16S rRNA geni kullanılarak genetik varyasyon düzeylerinin belirlenmesi
Determining the levels of genetic variation using 16S rRNA of mtDNA in different chromosome races of Nannospalax xanthodon (Rodentia: Spalacidae)
HABİBE DİDEM ÇELİKBİLEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
ZoolojiNiğde ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TEOMAN KANKILIÇ
- İç Anadolu Bölgesi Nannospalax leucodon (Nordmann, 1840)' un G-bantlama ve allozim varyasyonları (Mammalia:Rodentia)
G-banding and allozyme variations Of Nannospalax leucodon (Nordmann, 1840) In Central Anatolia (Mammalia: Rodentia)
TUBA YAĞCI
Doktora
Türkçe
2010
BiyolojiKırıkkale ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞÜKRAN ÇAKIR
YRD. DOÇ. DR. NURSEL AŞAN BAYDEMİR
- İç Anadolu bölgesinde yayılış gösteren Mus L. 1758 (Mammalia: Rodentia) cinsinin morfolojik analizi
Morphological analysis of genus Mus L. 1758 (Mammalia: Rodentia) in Central Anatolia
NESİBE ÖZSU
- İç Anadolu bölgesinde yayılış gösteren ev faresi Mus musculus (Linnaeus,1758)'un bağırsak florasını oluşturan aerobik ve anaerobik bakterilerin belirlenmesi
Determination of aerobic and anaerobic bacteria in intestinal flora of house mice Mus musculus (Linnaeus, 1758) distributed in Central Anatolia
ELİF KAŞKA ÇALIŞKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiKırıkkale ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURSEL AŞAN BAYDEMİR
- İç Anadolu Bölgesinde yetişen Isatis Glauca'nın genetik çeşitliliğinin moleküler işaretleyicilerle karakterizasyonu
Characterization of genetic diversity of Isatis Glauca cultivated in Central Anatolia Region based on molecular markers
ELÇİN GÖRGÜLÜ