Context dependent mutation biases in the human genome
İnsan genomunda çevre nükleotitlere bağlı mutasyon eğilimleri
- Tez No: 474849
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET SOMEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoistatistik, Biyoloji, Genetik, Biostatistics, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
Değişik mutasyon tipleri genomda farklı hızlarda ortaya çıkar ve yayılır. Örneğin CpG bölgelerindeki C->T dönüşümleri, memeli genomlarında en sık rastlanan mutasyon tipidir. Bunun aksine, GC eğilimli gen çevirimleri A ya da T bazlarının G ya da C bazlarına dönüştüğü mutasyonların, populasyonlarda hızla yayılmasına ve sabitlenmesine neden olmaktadır. Bu sabitlenme eğilimleri, şimdiye kadar çevre nükleotit dizilerinin etkisi dikkate alınarak incelenmemiştir. 1000 Genom Projesinden insan populasyon genomiği verileri ve diğer primatların karşılaştırmalı genomik verileri kullanılarak, insan genomundaki olası sabitlenme eğilimleri, ortadaki baz mutasyona uğramış olmak üzere 5erli baz çiftleri düzeyinde incelenecektir.
Özet (Çeviri)
Different types of mutations occur and spread in the genome at varying rates. For instance, C->T transitions at CpG sites are the most frequent mutation in mammalian genomes. In contrast, GC-biased gene conversion causes A or T->G or C mutations to spread and fix rapidly in populations. Such fixation biases have not yet been investigated taking neighbouring sequence context into account. Using human population genomic data from the 1000 Genomes Project and comparative genomic data from other primates, possible fixation biases in the human genome at the level of quintuplets (5 bp sequences where the middle base is mutated) will be investigated.
Benzer Tezler
- Farklı sentetik polimerler ile kaplanan manyetik demir oksit (manyetit) nanopartiküllerinin sitotoksik ve genotoksik etkilerinin araştırılması
Investigation of cytotoxic and genotoxic effects of magnetic iron oxide (magnetite) nanoparticles coated with different synthetic polymers
BURÇİN YALÇIN
- Akciğer kanserinde miRNA transfeksiyon etkinliğinin PLGA tabanlı nanopartiküller ile arttırılması'
Enhancement of mirna transfection efficiency in lung cancer with PLGA-based nanoparticles
SÜREYYA ERTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaSelçuk ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERDAR KARAKURT
DR. ÖĞR. ÜYESİ DENİZ SEZLEV BİLECEN
- Establishment of Cas9 endonuclease technology in rye
Çavdarda Cas9 endonükleaz teknolojisinin kullanilmasi
MUHAMMAD ARSLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
ZiraatEge ÜniversitesiTohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EVREN KOBAN BAŞTANLAR
DR. SAMEH SELİM
- Genetic and environmental interventions altering the course of brain aging: Evidence from the zebrafish (danio rerio) model
Beyin yaşlanmasını değiştiren genetik ve çevresel müdahaleler: Zebrabalığı (danio rerio) modelinden bulgular
ELİF TUĞCE KAROĞLU ERAVŞAR
Doktora
İngilizce
2021
Nörolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiNörobilim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MICHELLE MARIE ADAMS
- Engineering CRISPR-based DNA transversion editing technologies
CRISPR-temelli DNA transversiyon editleme teknolojilerinin mühendisliği
İBRAHİM ÇAĞRI KURT
Doktora
İngilizce
2021
BiyomühendislikHarvard UniversityBiyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı
DR. J. KEITH JOUNG