CEREBRA: A 3-D visualization and processing tool for brain network extracted from fMRI data
CEREBRA: fMRG verisinden elde edilen beyin ağlarını 3-B görselleme ve işleme aracı
- Tez No: 475048
- Danışmanlar: PROF. DR. FATOŞ TUNAY YARMAN VURAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme (fMRG) verisinden elde edilen 3 boyutlu insan beyni çizgesini görselleyebilen yeni bir yazılımı, CEREBRA'yı sunuyoruz. CEREBRA, küçük hacim birimlerini (voksel), ağın düğümleri olarak görsellerken; bu düğümler arasındaki kenarlar da düğümlerin zaman içindeki ilişkilerinin bir dizi doğrusal regresyon yöntemleri ile yakınsanması olarak modellenmiştir. Bu sayede araştırmacılar beyin üzerinde daha aktif çalışan bölgeleri ve bölgeler arasındaki ilişkiyi, kenar ağırlıklarına ve düğüm derece dağılımına bakarak inceleyebileceklerdir. Geliştirilen araç, basit bir arayüze sahip olmakla birlikte beyindeki detayları daha kolay inceleyebilmek amacıyla basit görüntüleme seçenekleri sunmaktadır. Sahip olduğu çizge sadeleştirme algoritmaları ile beyin ağının farklı özelliklerini sade bir şekilde gösterebilmektedir. Çizge sadeleştirme algoritmaları basit filtreleme methodlarından, daha karmaşık çizge sadeleştirme ölçütlerine kadar geniş bir yelpazeye yayılmaktadır. Ayrıca, geliştirilen araç, beyin ağını voksellerin ve kenarların zaman içindeki değişimlerini renk kodu olarak değiştirebilmektedir. Bu da fMRG deneyi sırasında beyinde gerçekleşen bilişsel süreçleri gözlemleme imkanı sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, we introduce a new tool, CEREBRA, for visualizing 3D network of human brain, extracted from the functional magnetic resonance imaging (fMRI) data. The tool aims to visualize the selected voxels as the nodes of the network and the edge weights are estimated by modeling the relationships among the voxel time series as a set of linear regression equations. This way, researchers can analyze the active brain regions/voxels and observe the interactions among them by analyzing the edge weights and node degree distributions of the brain network, for the underlying brain state(s). CEREBRA provides an easy to use interactive interface with basic display options for users to examine the details of the brain network. CEREBRA simplifies the network by built-in processors of graph reduction algorithms to display various properties of the network. The reduction algorithms vary from basic filtering methods to more complex graph sparsifier metrics. The toolbox is, also, capable of space-time representation of the dynamically changing voxel intensity and edge strength values, by animating the 3D voxel time series.
Benzer Tezler
- Limbik sistem mikroanatomisi: Ak madde diseksiyonu ve difüzyon tensör görüntüleme eşliğinde 3 boyutlu incelenmesi
Microanatomy of the limbic system: A three-dimensional examination using white matter dissection and diffusion tensor imaging
UFUK TEMTEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
NöroşirürjiAtatürk ÜniversitesiNöroşirürji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN HADİ KADIOĞLU
DOÇ. DR. METE ZEYNAL
- İnfantil serebral parezide risk faktörleri
Başlık çevirisi yok
MÜGE F. BİLSEL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiGelişim Psikolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELÇUK APAK
- Beyin özürlü (Cerebral palsy) çocuklarda epilepsi ile zeka düzeyi arasında istatistiksel ilişkiler
Başlık çevirisi yok
EMEL BUYURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiAile Sağlığı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HIFZI ÖZCAN
- Hipoksik ve hiperoksik koşullarda serebral kan akımı değişimlerinin ventilasyon parametrelerine etkisi
Başlık çevirisi yok
NAZAN FIRAT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1988
Fizyolojiİstanbul ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELİHA TERZİOĞLU