Molecular genetic analysis in hazelnut (Corylus avellana)
Fındıkta (Corylus avellana) moleküler genetik analizler
- Tez No: 482475
- Danışmanlar: PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Biyoteknoloji, Biyoloji, Genetics, Biotechnology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Avrupa, Anadolu ve ABD'yi de içeren dünyanın çeşitli yerlerinde yetişen Avrupa fındığı (Corylus avellana L.), yüksek mineral, oleik asit, amino asit ve fenolik bileşik içeriği ve hoş lezzeti nedeniyle ekonomik açıdan önemli bir fındık ürünüdür. Bu çalışmada, hem Sloven hem de Türk fındığının moleküler genetik çeşitliliği ve populasyon yapısı incelenmiştir. Çalışmanın ilk bölümünde Sloven ulusal fındık koleksiyonundan 54 yabani aksesyonun ve 48 çeşidin genetik çeşitliliği ve populasyon yapısı çoğaltılmış fragment uzunluğu polimorfizmi (AFLP) ve basit dizi tekrarı (SSR) işaretleyicileri kullanılarak incelenmiştir. Aksesyonlar ayrıca on meyve ve yedi çekirdek özelliği açısından karakterize edilmiştir ve bazı yabani aksesyonların ıslah potansiyeline sahip olduğu gösterildi. 64 fındık çeşidinden ve yabani aksesyonlardan oluşan bir ilişkilendirme haritası paneli, meyve ve çekirdek kalite özellikleri açısından önemli farklılıklara sahiptir. Morfolojik ve moleküler veriler, özellikleri kontrol eden markörleri tanımlamak için ilişkilendirilmiştir. Toplamda 49 SSR markörü, meyve ve çekirdek özellikleriyle anlamlı derecede bulunmuştur [P <0.0001 ve LD değeri (r2) = 0.15-0.50]. Bu çalışma, fındıkta ilişkilendirme haritalamasının ilk kullanımı olup, bu önemli sert kabuklu bitkide önemli kalite parametreleriyle ilişkili moleküler markörler tespit edilmiştir. Çalışmanın ikinci bölümünde toplam 402 Türk fındığı aksesyonu, 30 SSR markörü ile taranmıştır. Bu çalışmadan elde edilen veriler, fındık için ulusal bir çekirdek koleksiyonunun seçimini sağlamıştır. Bu çekirdek koleksiyon az sayıda bireyde maksimum genetik çeşitliliğin olduğunu göstermiştir. Türk çeşidi 'Tombul', yeni nesil dizileme tekniği kullanılarak dizilendi ve yeni SSR işaretleri geliştirildi ve bunlardan yedi tanesi Türk fındık çeşitlerini birbirinden ayırmak için yeterliydi. Bu çalışma, fındıkta markör yardımlı seçim için moleküler bilgi sağlamaktadır ve fındık germplazmlarının genetik potansiyelini keşfetmek için yeni bilgiler vermektedir.
Özet (Çeviri)
European hazelnut (Corylus avellana L.), cultivated in several areas of the world including Europe, Anatolia, and the USA, is an economically important nut crop due to its high mineral, oleic acid, amino acid, and phenolic compound content and pleasant flavor. This study examined molecular genetic diversity and population structure of both Slovenian and Turkish hazelnuts. In the first part of the work, genetic diversity of 54 wild accessions and 48 cultivars from the Slovenian national hazelnut collection was determined using amplified fragment length polymorphism (AFLP) and simple sequence repeat (SSR) markers. The accessions were also characterized for ten nut and seven kernel traits and some wild accessions were shown to have breeding potential. An association mapping panel composed of 64 hazelnut cultivars and wild accessions had considerable variation for the nut and kernel quality traits. Morphological and molecular data were associated to identify markers controlling the traits. In all, 49 SSR markers were significantly associated with nut and kernel traits [P < 0.0001 and LD value (r2) = 0.15–0.50]. This work is the first use of association mapping in hazelnut and has identified molecular markers associated with important quality parameters in this important nut crop. In the second part of the work, 402 Turkish hazelnut accessions were screened with 30 SSR markers. The data obtained from this screen allowed selection of a national core collection of hazelnut. This core collection represents a maximum of genetic diversity in a minimum number of individuals. Turkish cultivar 'Tombul' was sequenced using next generation sequencing technology and new SSR markers were developed. It was found that seven SSR markers were sufficient to discriminate Turkish hazelnut cultivars from each other. This study provides molecular information for marker-assisted selection in hazelnut and gives new insight to discover the genetic potential of hazelnut germplasm.
Benzer Tezler
- Identification of powdery mildew disease and genetic improvements in hazelnut
Fındıkta külleme hastalığının tanımlanması ve genetik olarak iyileştirilmesi
İPEK BİLGE
Doktora
İngilizce
2020
GenetikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SELİM ÇETİNER
- Development of single nucleotide polymorphism markers using genotyping by sequencing technique for determination of genetic diversity and population structure in hazelnut
Fındıkta genetik çeşitlilik ve popülasyon yapısının belirlenmesi için dizileme ile genotipleme tekniği kullanılarak tek nükleotid polimorfizm markörlerinin geliştirilmesi
ERTUĞRUL GAZİ YANAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Artvin'de yayılış gösteren fındık ağaçlarına zarar veren afit türlerinin tespiti ve moleküler karakterizasyonu
Identification and molecular characterization of aphid species damaging hazelnut trees distributed in Artvin
DİDEM TUNALI
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
BiyolojiArtvin Çoruh ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HAYAL AKYILDIRIM BEĞEN
- Hazelnut genome and transcriptome analysis under biotic and abiotic stress
Biyotik ve abiyotik stres koşulları altında fındık genom ve transkriptom analizleri
KADRİYE KAHRAMAN
Doktora
İngilizce
2020
BiyolojiSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT ÖZTÜRK
DR. ÖĞR. ÜYESİ STUART JAMES LUCAS
- Fındıkta bakteriyel yanıklık etmeni Xanthomonas arboricola pv. corylina'nın bitki dokularından DNA'ya dayalı tespiti
DNA-based detection of the bacterial blight agent in hazelnut, Xanthomonas arboricola pv corylina from plant tissues
FATİH TEKİN
Doktora
Türkçe
2025
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖKSEL ÖZER