Molecular genetic analysis in hazelnut (Corylus avellana)
Fındıkta (Corylus avellana) moleküler genetik analizler
- Tez No: 482475
- Danışmanlar: PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 168
Özet
Avrupa, Anadolu ve ABD'yi de içeren dünyanın çeşitli yerlerinde yetişen Avrupa fındığı (Corylus avellana L.), yüksek mineral, oleik asit, amino asit ve fenolik bileşik içeriği ve hoş lezzeti nedeniyle ekonomik açıdan önemli bir fındık ürünüdür. Bu çalışmada, hem Sloven hem de Türk fındığının moleküler genetik çeşitliliği ve populasyon yapısı incelenmiştir. Çalışmanın ilk bölümünde Sloven ulusal fındık koleksiyonundan 54 yabani aksesyonun ve 48 çeşidin genetik çeşitliliği ve populasyon yapısı çoğaltılmış fragment uzunluğu polimorfizmi (AFLP) ve basit dizi tekrarı (SSR) işaretleyicileri kullanılarak incelenmiştir. Aksesyonlar ayrıca on meyve ve yedi çekirdek özelliği açısından karakterize edilmiştir ve bazı yabani aksesyonların ıslah potansiyeline sahip olduğu gösterildi. 64 fındık çeşidinden ve yabani aksesyonlardan oluşan bir ilişkilendirme haritası paneli, meyve ve çekirdek kalite özellikleri açısından önemli farklılıklara sahiptir. Morfolojik ve moleküler veriler, özellikleri kontrol eden markörleri tanımlamak için ilişkilendirilmiştir. Toplamda 49 SSR markörü, meyve ve çekirdek özellikleriyle anlamlı derecede bulunmuştur [P
Özet (Çeviri)
European hazelnut (Corylus avellana L.), cultivated in several areas of the world including Europe, Anatolia, and the USA, is an economically important nut crop due to its high mineral, oleic acid, amino acid, and phenolic compound content and pleasant flavor. This study examined molecular genetic diversity and population structure of both Slovenian and Turkish hazelnuts. In the first part of the work, genetic diversity of 54 wild accessions and 48 cultivars from the Slovenian national hazelnut collection was determined using amplified fragment length polymorphism (AFLP) and simple sequence repeat (SSR) markers. The accessions were also characterized for ten nut and seven kernel traits and some wild accessions were shown to have breeding potential. An association mapping panel composed of 64 hazelnut cultivars and wild accessions had considerable variation for the nut and kernel quality traits. Morphological and molecular data were associated to identify markers controlling the traits. In all, 49 SSR markers were significantly associated with nut and kernel traits [P < 0.0001 and LD value (r2) = 0.15–0.50]. This work is the first use of association mapping in hazelnut and has identified molecular markers associated with important quality parameters in this important nut crop. In the second part of the work, 402 Turkish hazelnut accessions were screened with 30 SSR markers. The data obtained from this screen allowed selection of a national core collection of hazelnut. This core collection represents a maximum of genetic diversity in a minimum number of individuals. Turkish cultivar 'Tombul' was sequenced using next generation sequencing technology and new SSR markers were developed. It was found that seven SSR markers were sufficient to discriminate Turkish hazelnut cultivars from each other. This study provides molecular information for marker-assisted selection in hazelnut and gives new insight to discover the genetic potential of hazelnut germplasm.
Benzer Tezler
- Hazelnut genome and transcriptome analysis under biotic and abiotic stress
Biyotik ve abiyotik stres koşulları altında fındık genom ve transkriptom analizleri
KADRİYE KAHRAMAN
Doktora
İngilizce
2020
BiyolojiSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT ÖZTÜRK
DR. ÖĞR. ÜYESİ STUART JAMES LUCAS
- Antikanser taksanların fındık (Corylus avellana) hücre kültürlerinde biyoteknolojik üretimi
Biotechnologically production of anticancer taxanes in hazelnut (Corylus avellana) cell cultures
İLAYDA GÖKTEPE
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Biyoteknolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞULE ARI
- Association mapping for oil and protein content in hazelnut (corylus avellana l.)
Fındıkta (corylus avellana l.) yağ ve protein içeriği için ilişkilendirme haritalaması
FATMANUR SÖYLEMEZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Development of single nucleotide polymorphism markers using genotyping by sequencing technique for determination of genetic diversity and population structure in hazelnut
Fındıkta genetik çeşitlilik ve popülasyon yapısının belirlenmesi için dizileme ile genotipleme tekniği kullanılarak tek nükleotid polimorfizm markörlerinin geliştirilmesi
ERTUĞRUL GAZİ YANAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Identification of powdery mildew disease and genetic improvements in hazelnut
Fındıkta külleme hastalığının tanımlanması ve genetik olarak iyileştirilmesi
İPEK BİLGE
Doktora
İngilizce
2020
BiyomühendislikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SELİM ÇETİNER