Geri Dön

Investigation of the therapeutic effect of sodium butyrate in Caco2 colon cancer cell line by using ATR-FTIR spectroscopy

Sodyum büteratın CAco2 kolon kanseri hücreleri üzerinde terapatik etkisinin ATR-FTIR spektroskopisi kullanılarak incelenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 489468
  2. Yazar: BUKET ÇELİK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ALPAN BEK, DR. NİHAL ŞİMŞEK ÖZEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biophysics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikro ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Sodyum Büterat, HDACi'lerin bir çeşidi olup çoğalma, diferansiyasyon, hücre siklusu arresti, anjiyojenez engellemesi, metaztaz ve gen ekspresyonunu indüklemektedir. Şu zamana kadar, terapatik etkileri ile ilgili çeşitli çalışmalar var olup, moleküler düzeyde etki mekanizması bilinmemektedir. Bu tezin amacı aksiyon/terapatik potensiyel mekanizmasını Caco2 kanser hücreleri üzerinde ATR- FTIR spektroskopisi kullarak spektral ve kemometrik analizler ile göstermektir. 3mM, 6mM ve 9 mM dozlerında sodyum büterat 12s, 24s ve 48s etki süreleri ile Caco2 hücrelerine uygulanmıştır. Aldığımız sonuçlara göre NaBt tedavisi doymamış yağların yoğunluğunda artışa sebep olup, bunun sebebi olarak da yağ peroksidasyonu gösterilmiştir. Buna ek olarak, doymuş yağlardaki, hücre zarı akışkanlığı/dinamiği, ester ve trigliseritte kontrol grubuna göre tedavi edilmiş grup artış göstermiştir. Bununla birlikte, NaBt Reaktif Oksijen Türleri (ROS) oluşumunu indüklemiş ve zamana bağlı olarakprotein ve nükleik asitlerin azalmasına yol açmıştır. HCA ve PCA sonuçları tüm çalışılan gruplarda net bir ayrımın gözlemlendiğini belirlemiştir. Bu sonuçlar ile NaBt'ın kanser hücrelerinin yapısal ve fonksiyonel tekrar modellemesi için kullanılabileceği söylenebilir.

Özet (Çeviri)

Sodium butyrate (NaBt), as one of the HDACi, has been demonstrated that it induces apoptosis, cell cycle arrest, the inhibition of angiogenesis, metastasis and gene expression changes. To date, there are several studies perfomed to investigate its therapeutic effect; however, theexact mechanism at molecular level is not clear yet. Therefore, the current thesis was aimed to clarify the action/theurapeutic potential mechanisms of sodium butyrate in Caco2 colon cancer cell line at molecular level using ATR-FTIR spectroscopy, quantitative spectral and chemometric analyses. 3mM, 6mM and 9mM doses of sodium butyrate were applied to Caco2 cell line line for 12h, 24h and 48 h. According to the results, NaBt treatment caused an increase in the unsaturated lipids, impying elevated lipid peroxiation. Moreover increased saturated lipids, membrane fluidity/dynamics and esters and triacylglycerols were obtained in NaBt-treated groups with respect to the control ones. However, NaBt induced a degradation of proteins and nucleic acids. HCA and PCA results indicated that in all studied doses, there was a clear distinction between studied groups in a time dependent manner. The results of the current study implied that sodium butyrate may have therapeutic potential by structural and functional remodelling of cancer cells.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    313724

    Investigation of the effect of sodium butyrate induced differentiation on inflammatory pathways in colon cancer cells

    Kolon kanser hücre hatlarında sodyum bütiratla indüklenmiş farklılaşmanın enflamasyon yolaklarına etkisinin incelenmesi

    MÜMİNE KÜÇÜKDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SREEPARNA BANERJEE

  2. Tez No

    194397

    Spinal müsküler atrofi’de RNA işlenme hatasının ve tedavinin araştırılması

    The investigation of RNA splicing defects and treatment of spinal muscular atrophy

    DİDEM DAYANGAÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Tıbbi BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HAYAT ERDEM YURTER

  3. Tez No

    195998

    Forbol miristat asetat ve selektif v1a reseptör antagonisti SR49059'un aquaporin-4 ve beyin ödemi rezolüsyonu üzerine etkilerinin incelenmesi

    The effect of aquaporin supression on resolution of brain edema in intracerebral infusion model in rats.

    PINAR AKDEMİR ÖZIŞIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyokimyaHacettepe Üniversitesi

    Nöroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEJAT AKALAN

  4. Tez No

    338092

    Sıçanlarda kolit tedavisinde ağızdan verilen canlı ve enkapsüle edilmiş Pediococcus pentosaceus ozf suşunun etkisinin araştırılması

    Investigation of the effect of oral administrations of live and encapsulated Pediococcus pentosaceus ozf strain on treatment of colitis in rats

    ZHANATGUL SAKYP

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU

  5. Tez No

    795516

    Gümüşdüğme (Tanacetum parthenium) bitkisinin aktif bileşeni olan partenolid'in sıçanlarda paklitaksel ile oluşturulan nöropatik ağrı üzerine tedavi edici etkisinin gen ve protein seviyelerinde araştırılması

    Investigation of the therapeutic effects of parthenolide, the active component of gümüşdüğme (Tanacetum parthenium) on neuropathic pain caused by paclitaxel in rats, on gene and protein levels

    EMİNE TORAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikAtatürk Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HARUN BUDAK

Geri Dön