Patateste miRNA aracılığıyla kuraklığa toleransın düzenlenmesi
miRNA mediated regulation of drought tolerance in potato
- Tez No: 490440
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. UFUK DEMİREL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Kısa ardışık hedef taklidi, stu-miRNA398 azaltılması, kurağa tolerans, Short Tandem Target Mimicry, stu-miRNA398down-regulation, drought tolerance
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Patates dünya genelinde tarımda en çok kullanılan bitkilerden birisidir. Bununla birlikte yetişme süresince patates birçok biyotik ve abiyotik stres faktörleri ile karşılaşmaktadır. Tüm bu stresler bitkinin normal büyüme fonksiyonlarını bozabilmekte ve sonunda yumru veriminin düşmesine neden olabilmektedirler. Bitkiler stres etmenlerine karşı moleküler düzeyde çeşitli savunma mekanizmaları geliştirmişlerdir. Bu savunma mekanizmalarında birisi de gen ifadelerinde meyda gelen değişikliklerdir. miRNA'lar hedef genin mRNA'larına bağlanarak ya mRNA'ların endonükleaz enzimler tarafından parçalanmasına ya da ribozomların mRNA üzerinde ilerlemesini engelleyerek translasyonun durmasına neden olmaktadırlar. Böylece miRNA'lar transkripsiyon sonrasında gen ifadesinin düzenlenmesinde, dolayısıyla abiyotik strese tolerans mekanizmasında önemli rol oynamaktadırlar. Önceki çalışmalarda, stu-miRNA398'in patatesin kurağa toleransında rol alan Cu/Zn SOD genini hedef aldığı biyoinformatik yöntemlerle tahmin edilmiş ve deneysel olarak da bu yönde ön bulgular elde edilmiştir. Bu çalışmada, Kısa Ardışık Hedef Taklidi (STTM) yöntemiyle patateste stu-miR398 baskılanmış ve bunun sonucunda Cu/Zn SOD geninin ifadesinin arttığı belirlenmişitr. Böylece, stu-miR398'in hedef geninin Cu/Zn SOD olduğu deneysel olarak doğrulanmıştır. Bununla birlikte, miR398'in işlevsel olarak patatesin kurağa tolerans mekanizmasında yer aldığı belirlenmiştir. Bu sonuçların, miRNA aracılığıyla patateste kurağa toleransın artırılmasına yönelik çalışmalara katkı sağlanılacağı beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
In the world, potato is one of the most used crop in agriculture. Unfortunately, potatoes encounter many biotic and abiotic stress factors during the growing season. All of these stresses might affect the normal growth functions of the plant and ultimately cause reduction in potato yield. The plants developed various defense mechanisms at the molecular level against the stress factors. One of these defense mechanisms is the change in gene expression. miRNAs bind to the target gene's mRNAs, either causing the mRNAs to break down by endonuclease enzymes or preventing translation of the ribosomes onto the mRNA, thus stopping translation. During abiotic stress tolerance mechanism, miRNAs play an important role in the regulation of gene expression during transcription. In previous studies, stu-miRNA398 was predicted by bioinformatic analysis targeting the Cu / Zn SOD gene, which plays an important role in drought tolerance of potato and experimentally obtained preliminary findings in this direction. In this study, stu-miR398 was suppressed by the Sort Tandem Target Mimicry (STTM) method, as a result, the expression of the Cu / Zn SOD gene was increased. Thus, the first important finding was that target gene of stu-miR398 was Cu / Zn SOD. However, it has been determined that miR398 is functionally involved in the tolerance mechanism of potato crop. Therefore, we expect that drought tolerance in potato can be enhanced by mediating miRNA pathway.
Benzer Tezler
- Patatesin kuraklık toleransının düzenlenmesinde rol alan MiRNA'ların belirlenmesi
Identification of miRNAs regulating drouht tolerance in potato
İLKNUR TINDAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoteknolojiNiğde ÜniversitesiTarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. UFUK DEMİREL
- Α-chaconine ve α-solanine'in antikanserojen etkilerinin RL95-2 hücrelerinde araştırılması
Investigation of anticarcinogenic effects of α-chaconine and α-solanine in RL95-2 cells
AYŞE KÜBRA KARABOĞA ARSLAN
Doktora
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiErciyes ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MÜKERREM BETÜL AYCAN
- Patateste kuraklık ve yüksek sıcaklık streslerine tepkide rol oynayan mirna'ların yeni nesil dizileme yöntemi ile belirlenmesi
Identification of mirnas in response to drought and heat stresses in potato using new generation sequencing
ESRA KAPLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ZiraatNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZAHİDE NESLİHAN ÖZTÜRK GÖKÇE
- Investigation of potential of mir160 in sustainable agriculture through overexpression in potato cultivars
Patates çeşitlerinde anlatımını arttırarak mır160'ın sürdürülebilir tarımda kullanılabilme potansiyelinin değerlendirilmesi
BEYAZIT ABDURRAHMAN ŞANLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyoteknolojiNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZAHİDE NESLİHAN ÖZTÜRK GÖKÇE
- Agrobacterium aracılı transformasyon tekniği ile patlıcanda glikoalkaloid içeriğinin genetik modifikasyonu
Genetic modifications of glycoalkaloid content in eggplant by Agrobacterium-mediated transformation technique
HELİN GÜLTEKİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ANNE FRARY