Geri Dön

Determination of Saccharomyces cerevisiae resistant to PCM obtained by inverse metabolic strategy and trans-effect of its metabolites on PC3

Ters metabolizma yöntemi ile PCM'e dirençli Saccharomyces cerevisiae elde edilmesi ve metabolitlerinin PC3 üzerindeki etkisi

PDF İndir

  1. Tez No: 492684
  2. Yazar: MUSA TARTIK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ÇİFTCİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Bingöl Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Kanser, kaotik bir rahatsızlıktır, çünkü hücre çeşitliliği ve hücre içindeki yolakların çokluğu, basit ve kesin bir çözüm bulmayı zorlaştırır. Dahası, kansere karşı kesin bir çare bulmak için, metabolizmanın tamamını ayrıntılı olarak bilmek gerekiyor, ancak mevcut bilgi ve teknoloji seviyesi bunun için yeterli değil. Bu nedenle kanser benzeri hastalıklarla mücadele için alternatif yaklaşımlar gereklidir. Bu çalışmada amacımız doğal bir strateji olan evrimsel mühendislik yöntemi ile prostat kanser hücrelerinin kültürlendiği ortamda, kolayca büyüyebilen S. cerevisiae mutant suşu elde etmektir. Buna ek olarak, elde edilen mutant ve WT (doğal şuş) mayalar, DMEM ortamında kültürlenerek fermente besiyerileri elde edildi. Böylece bu fermente DMEM'lerin PC3 hücreleri üzerindeki karşı etkileri oksidatif hasar, hücre göçü, gen ifadesi ve hücre büyümesi gibi birkaç moleküler yöntemle değerlendirildi. Evrimsel mühendislik yaklaşımı, PCM ortamında (PC3 hücreleriyle kültürlenmiş DMEM) iyi büyüyemeyen WT maya popülasyonuna uygulanmıştır. Başlangıç popülasyonunda çeşitlilik oluşturmak için bir kimyasal mutajen olan EMS (Etil metansülfonat) rastgele mutasyon oluşturmak için kullanıldı. Genetik kararlık testleri kullanılarak, PCM'ye dirençli fenotip gösteren en iyi bireysel mutantlar belirlendi. Daha sonra, seçilen mutantlar ve WT, mayalanmış bir ortam elde etmek için logaritmik faza kadar ayrı ayrı DMEM'de büyütüldü. MY2, MP2 ve WT ile mayalanmış DMEM'lerin (WT-DM, MP-DM and MY-DM), PC3 hücreleri üzerindeki etkisini anlamak için oksidatif hasar, apoptotik indeks, hücre göçü ve gen ekspresyon testleri uygulandı. Mevcut çalışmaya göre, evrimsel mühendislikle elde edilen mutant mayaların PCM içindeki büyüme becerisi, WT'ye kıyasla, bariz olarak arttı. Bu çalışma ayrıca, WT-DM, MP-DM ve MY-DM'nin PC3 hücre kültüründe apoptozu indükleyerek hücre büyümesini önemli ölçüde azalttığını göstermiştir. Bununla birlikte, MY-DM; WT-DM ve MP-DM'den farklı olarak, PC3 hücrelerinde apoptozu teşvik etmek için birçok moleküler yolu aynı anda aktive etti. Örneğin artan ROS üretimi, azalan hücre göçü ve apoptotik gen ifadelerinin artan regülasyonu. Diğer yandan ise, MP-DM apoptotik indeksi artırırken, apoptotik gen ekspresyonunu azaltmıştır. Sonuç olarak, mevcut çalışmada PCM'de kısıtlı büyüyen WT yerine, MY2 ve MP2 mutantları başarılı bir şekilde elde edilmiştir. Ayrıca, WT-DM ve MP-DM, MY-DM'nin PC3 hücrelerinde apoptozu uyaran çeşitli etkili metabolitleri içerdiğini de gösterdi.

Özet (Çeviri)

Kanser, kaotik bir rahatsızlıktır, çünkü hücre çeşitliliği ve hücre içindeki yolakların çokluğu, basit ve kesin bir çözüm bulmayı zorlaştırır. Dahası, kansere karşı kesin bir çare bulmak için, metabolizmanın tamamını ayrıntılı olarak bilmek gerekiyor, ancak mevcut bilgi ve teknoloji seviyesi bunun için yeterli değil. Bu nedenle kanser benzeri hastalıklarla mücadele için alternatif yaklaşımlar gereklidir. Bu çalışmada amacımız doğal bir strateji olan evrimsel mühendislik yöntemi ile prostat kanser hücrelerinin kültürlendiği ortamda, kolayca büyüyebilen S. cerevisiae mutant suşu elde etmektir. Buna ek olarak, elde edilen mutant ve WT (doğal şuş) mayalar, DMEM ortamında kültürlenerek fermente besiyerileri elde edildi. Böylece bu fermente DMEM'lerin PC3 hücreleri üzerindeki karşı etkileri oksidatif hasar, hücre göçü, gen ifadesi ve hücre büyümesi gibi birkaç moleküler yöntemle değerlendirildi. Evrimsel mühendislik yaklaşımı, PCM ortamında (PC3 hücreleriyle kültürlenmiş DMEM) iyi büyüyemeyen WT maya popülasyonuna uygulanmıştır. Başlangıç popülasyonunda çeşitlilik oluşturmak için bir kimyasal mutajen olan EMS (Etil metansülfonat) rastgele mutasyon oluşturmak için kullanıldı. Genetik kararlık testleri kullanılarak, PCM'ye dirençli fenotip gösteren en iyi bireysel mutantlar belirlendi. Daha sonra, seçilen mutantlar ve WT, mayalanmış bir ortam elde etmek için logaritmik faza kadar ayrı ayrı DMEM'de büyütüldü. MY2, MP2 ve WT ile mayalanmış DMEM'lerin (WT-DM, MP-DM and MY-DM), PC3 hücreleri üzerindeki etkisini anlamak için oksidatif hasar, apoptotik indeks, hücre göçü ve gen ekspresyon testleri uygulandı. Mevcut çalışmaya göre, evrimsel mühendislikle elde edilen mutant mayaların PCM içindeki büyüme becerisi, WT'ye kıyasla, bariz olarak arttı. Bu çalışma ayrıca, WT-DM, MP-DM ve MY-DM'nin PC3 hücre kültüründe apoptozu indükleyerek hücre büyümesini önemli ölçüde azalttığını göstermiştir. Bununla birlikte, MY-DM; WT-DM ve MP-DM'den farklı olarak, PC3 hücrelerinde apoptozu teşvik etmek için birçok moleküler yolu aynı anda aktive etti. Örneğin artan ROS üretimi, azalan hücre göçü ve apoptotik gen ifadelerinin artan regülasyonu. Diğer yandan ise, MP-DM apoptotik indeksi artırırken, apoptotik gen ekspresyonunu azaltmıştır. Sonuç olarak, mevcut çalışmada PCM'de kısıtlı büyüyen WT yerine, MY2 ve MP2 mutantları başarılı bir şekilde elde edilmiştir. Ayrıca, WT-DM ve MP-DM, MY-DM'nin PC3 hücrelerinde apoptozu uyaran çeşitli etkili metabolitleri içerdiğini de gösterdi.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    682855

    Çeşitli ticari kaynaklardan izole edilen saccharomyces cerevisiae var. boulardii'nin probiyotik özelliklerinin belirlenmesi ve dondurma üretiminde kullanımı

    Determination of probiotic properties of saccharomyces cerevisiae var. boulardii isolated from various commercial sources and its use in ice cream production

    HAMZA GÖKTAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Gıda MühendisliğiYıldız Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN SAĞDIÇ

    DOÇ. DR. ENES DERTLİ

  2. Tez No

    878667

    Genomic analysis of freeze-thaw stress-resistant Saccharomyces cerevisiae

    Donma-erime stresine dirençli Saccharomyces cerevisiae'nin genomik analizi

    ÇAĞLA GÜNEY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR

  3. Tez No

    525185

    Üzüm posasından biyoetanol üretiminin araştırılması

    Investigation of bioethanol production from grape pomace

    TUĞBA YAVUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyomühendislikFırat Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET KALENDER

  4. Tez No

    472378

    Probiyotik özellik gösteren bazı maya suşları ve laktik asit bakterilerinin etkileşimlerinin araştırılması

    Investigation of the interaction between probiotic yeasts and lactic acid bacteria

    HATİCE YILDIRAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYNUR GÜL KARAHAN

    DOÇ. DR. GÜLDEN BAŞYİĞİT KILIÇ

  5. Tez No

    553327

    Senecio vernalis Waldst. & Kit. bitkisinin doğal bileşenlerinin ekstraksiyonu ve biyolojik aktivitelerinin saptanması

    Determination of the biological activities and extraction of natural components of Senecio vernalis Waldst. & Kit.

    HAVVA KURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiMuş Alparslan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEDAT BOZARI

Geri Dön