Integration of microfluidic chip with a microcontrol system for stabilization of the temperature for diagnosis of tuberculosis by loop mediated isothermal amplification
LAMP yöntemiyle tüberküloz teşhisinde kullanılmak üzere üretilen mikroakışkan çipin sıcaklık kontrolü için mikrokontrol devresiyle entegrasyonu
- Tez No: 496482
- Danışmanlar: PROF. DR. LEVENT TRABZON
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Nanoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Projenin amacı, hastadan alınan balgamdan izole edilen DNA'nın sıcaklık kontrolü entegre bir mikrokontrol devresiyle sağlanan mikroakışkan çipte sabit sıcaklıkta LAMP reaksiyonuyla çoğaltılması ve başarılı olunması halinde hazırlanan mikroakışkan çipin ticarileştirilmesidir. Belirtilen proje beş ana aşamadan oluşmaktadır: Isıtıcı ve sıcaklık sensöründen oluşan bir ısıtma elemanı ile reaksiyonun gerçekleşeceği reaksiyon haznesini içeren bir mikroakışkan çip tasarımı, üretimi ve karakterizasyonu, sıcaklık kontrolünü sağlamak için mikroakışkan çipe entegre edilecek bir mikrokontrol devresini tasarlanması, karakterizasyonu ve entegrasyonu, reaksiyon haznesine yüklenecek biyolojik madde karışımının hazırlanması ve optimizasyonu, üretilen prototipe hazırlanan biyolojik karışımın yüklenmesi ve alınan sonuçlara göre prototipin optimizasyonu ve prototipin raf ömrünün belirlenmesi. Bu tezde, hem mikroakışkan çipin hem de mikrokontrol devresinin tasarım, modelleme, üretim ve karakterizasyon aşamaları incelenmiş, hem de karakterizasyon işlemlerinden alınan sonuçlar yorumlanmıştır.
Özet (Çeviri)
This Master thesis was supported by TUBITAK with project code of 115R002. Aim of this project is to reproduce isolated DNA from patient's phelgm by LAMP method with stabilized temperature by microcontroller on microfluidic chip and in case od success, this prepared microchip is aimed to be commercilized. This project has 5 main progresses: design, production and characterization of microfluidic chip with heating element and reaction chamber where reaction is occured, circuit of microcontroller design to control temperature, characterization and integration, preparation of biological mixture to fill reaction reservoir and optimization, filling prepared biological solution to the reaction reservoir in prototype and optimization of prototype according to data obtained and determination of shelf life of the prototype. In this thesis not only for microfluidic chip but also for microcontroller: production, design, modelling and characterization were done also analysis of the data obtained was interpreted.
Benzer Tezler
- Design and simulation of a microfluidic biochip for optic detection with derivatized microbeads and the biochemistry of learning
Türevlendirilmiş mikro küreler ile optik biyosensörü ve öğrenme biyokimyası için mikroakışkan biyoçipin tasarımı ve sımülasyonu
TUĞÇE TÜYSÜZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ONUR ALPTÜRK
DOÇ. DR. YILDIZ ULUDAĞ
- Enrichment of MCF7 breast cancer cells from leukocytes through continuous flow dielectrophoresis
Dielektroforez yöntemi ile sürekli akış altında MCF7 meme kanseri hücrelerinin akyuvar hücrelerinden zenginleştirilmesi
ZEYNEP ÇAĞLAYAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyomühendislikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK KÜLAH
- Development of novel aflatoxin B1 biosensors by carbon nanotube integrated microfluidic systems
Karbon nanotüp entegre edilmiş mikroakışkan sistemlerin kullanımıyla yeni aflatoksin B1 biyosensörlerinin geliştirilmesi
NAGİHAN OKUTAN ARSLAN
Doktora
İngilizce
2024
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT TRABZON
- Implementation of strong light-matter interaction for fabrication and light management of thin crystal silicon solar cells
İnce kristal silisyum güneş hücrelerinde üretim ve ışık yönetimi için yoğun ışık-madde etkileşimi uygulaması
MONA ZOLFAGHARI BORRA
Doktora
İngilizce
2021
Fizik ve Fizik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMikro ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPAN BEK
- Microfluidic chip-based systems for monitoring cancer therapy
Kanser tedavisinin izlenmesi için mikro akışkan çip tabanlı sistemler
EYLÜL GÜLŞEN YILMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FATİH İNCİ