Investigation and molecular characterization of barley yellow dwarf viruses in wheat fields (Triticum aestivum L.) of Diyarbakir province by multiplex RT-PCR
Diyarbakır ili buğday (Triticum aestivum L.) tarlalarında arpa sarı cücelik virüslerinin multipleks RT-PCR ile araştırılması ve moleküler karakterizasyonu
- Tez No: 503402
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA USTA, PROF. DR. EMAD M. AL- MAAROOF
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Diyarbakır ili buğday alanlarında Arpa sarı cücelik virüslerini (Barley/Cereal yellow dwarf viruses: BYDV-PAV, MAV, SGV, RMV ve CYDV-RPV) belirlemek amacı ile 2016 yılında survey çalışmaları yürütülmüştür. BYDV (PAV, MAV, SGV, RMV) ve CYDV-RPV'nin varlığını araştırmak için multipleks RT-PCR ve RT-PCR yöntemleri kullanılmıştır. Diyarbakır ilinde varlığı tespit edilen virüslerde BYDVPAV'ın kılıf protein geninin moleküler karakterizasyonuda da gerçekleştirilmiştir. Bölgedeki buğday tarlalarından rastgele 365 adet buğday yaprak örneği toplanmıştır. Testlenen 365 buğday örneğinden 13' ünün BYDV-PAV (% 3.5), 9'unun BYDV-SGV (% 2.4), 5'inin CYDV-RPV (% 1.3) ile bulaşık oldukları tespit edilmiştir. Tespit edilen BYDV-PAV virüs türünden bir izolat rasgele seçilerek kılıf protein geni karakterize edilmiştir. BYDV-PAV (Gen bankası Ulaşım No. KX774424) virüsünün kılıf protein geninin tamamı klonlanarak üniversal primerler ile DNA dizilemesi gerçekleştirilmiştir. BYDV-PAV Diyarbakır izolatının dünyadaki 21 farklı izolatın nükleik asitleri ile % 81.43-98.2 % arasında değişen oranlarda benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Bu çalışma ile BYDV-PAV, BYDV-SGV, CYDV-RPV virüsleri Diyarbakır ilindeki buğday alanlarında ilk defa rapor edilmiştir
Özet (Çeviri)
In order to ascertain the presence of Barley/Cereal yellow dwarf viruses (BYDV-PAV, MAV, SGV, RMV, and CYDV-RPV), in wheat fields, a survey was conducted in the year of 2016 in Diyarbakir province. Presence of BYDV viruses (PAV, MAV, SGV, RMV, and CYDV-RPV) was investigated by using multiplex RT-PCR and RT-PCR methods. A total of 365 wheat leaf samples were randomly collected from wheat fields of Diyarbakir province. As a result of tests the wheat samples were found to be infected by BYDV-PAV, BYDV-SGV and CYDV-RPV with the percentage of (3.5 %), (2.4 %) and (1.3 %), respectively. Detected mix infections of BYDVPAV+BYDV-SGV, BYDV-PAV+ CYDV-RPV, BYDV-SGV+ CYDV–RPV, and BYDV-PAV+ BYDV-SGV+ CYDV-RPV were 2.2 %, 0.8 %, 0.8 %, and 0.8 % respectively. A virus isolate was selected randomly and its coat protein gene was characterized. Complete coat protein gene of BYDV-PAV virus (Genbank accession no. KX774424) was cloned and sequenced with the universal primers. BYDV-PAV Diyarbakir isolate was compared with 21 isolates from other regions in the world. The nucleotide sequence of BYDV-PAV Diyarbakir isolate was showed 81.43 % - 98.3 % similarities with the world isolates. The present study is the first report for documentation of BYDV-PAV, BYDVSGV and CYDV-RPV viruses in wheat fields in Diyarbakir province in Turkey
Benzer Tezler
- Mardin ili buğday üretim alanlarındaki arpa sarı cücelik virüs (Barley yellow dwarf viruses; BYDVs)'lerinin multipleks rt-pcr yöntemi ile araştırılması ve bazı virüs izolatlarının moleküler karakterizasyonları
Molecular characterizations of some virus isolates and investigation of Barley yellow dwarf viruses (BYDVs) in the wheat production areas in Mardin province by multiplex rt-pcr
ABDULSELAM KARAOZAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA USTA
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
- Kuyruk modelleri ve analizi üzerine bir uygulama
Başlık çevirisi yok
DİDEM ÖZPULAT
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
İstatistikEge ÜniversitesiBilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİKRET İKİZ
- Samsun ve çevresinde tarla sarmaşığı (conuolvulus arvensis L.)'na karşı biyolojik savaşa esas olacak fauna tespiti
Investigations on the insect fauna of the field binweed (Conuolvulus arvensis L.) related to its biological control in Samsun Province
YASEMİN UFUK GERMAN
- Gebelik ve doğum olgularında prolaktin düzeylerinin değerlendirilmesi
The Evaluation of prolactin values during pregnancy labour and in deliveries
TÜLİN AKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MÜLAZIM YILDIRIM