Geri Dön

Escherichia coli ve klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenem direnci ve dirençten sorumlu enzimlerin araştırılması

Investigation of carbapenem resistance and responsible enzymes in escherichia coli and klebsiella pneumoniae isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 503985
  2. Yazar: ÖZLEM ALBAYRAK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BEYTULLAH KENAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Karbapenemler çoklu ilaç direncine sahip Gram negatif bakterilerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde önemli bir yere sahiptirler. Fakat günümüzde karbapenemleri hidroliz eden enzimlerin ortaya çıkmasıyla birlikte karbapenemlerin de antimikrobiyal etkinliklerinin de azalmasına sebep olmuştur. Karbapenemazlar en güçlü hidrolitik aktiviteye sahip bete-laktamazlardır. Enterobacteriaceae ailesi için karbapenem direncinden en sık OXA-48, OXA-58, KPC karbapenemazları ve IMP, NDM, VIM gibi beta-laktamazların sorumlu tutulduğu bilinmektedir. Bu çalışmada enfeksiyon etkeni olarak en sık izole edilen 2 Enterobacteriaceae üyesinde karbapenemaz gen bölgelerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışma Ocak-Aralık 2017 tarihleri arasında Afyon Kocatepe Üniversitesi Hastanesi'nde gerçekleştirilmiştir. Çalışma süresince, çeşitli klinik örneklerden izole edilen, 207 Klebsiella pneumoniae, 57 Escherichia coli olmak üzere Enterobacteriaceae üyesi toplam 264 ait suş çalışmaya dahil edilmiştir. Karbapenemlerden herhangi birine direnç ya da azalmış duyarlılık gösteren klinik izolatlarında sorumlu gen bölgeleri araştırılmıştır. Bakteri tanımlanması ve antibiyotik testleri, geleneksel yöntemler ve otomatize sistemler (Vitek 2, BioMerieux, USA) gerçekleştirilmiştir. IMP, NDM, OXA-58, OXA-48, KPC ve VIM, karbapenemazlarını kodlayan gen bölgeleri Polimeraz zincir reaksiyon yöntemi (PZR) kullanılarak araştırılması yapılmıştır. Suşların çoğu Anestezi yoğun bakım ünitesi başta olmak üzere cerrahi tıp birimlerinde yatarak tedavi gören hastalardan (% 65,5) ve idrar (% 47,3), kan (% 19,3), yara (% 11,7), trakeal aspirat (% 10,6), balgam (% 6,8) ve diğer örnekler (% 4,3) olmak üzere izole edilmişlerdir. İzolatların % 43'ünde (102 K. pneumoniae, 12 E. coli) imipenem, ertapenem ve meropenemden en az birine direnç veya azalmış duyarlılık tespit edilmiştir. Karbapenem dirençli izolatların % 88'inde, karbapenemaz kodlayan gen bölgelerinden en az birinin varlığı saptanmıştır. Karbapenemaz kodlayan genlerden en sık OXA-48 gözlenmiştir (63 K. pneumoniae, 5 E. coli). Bunu takip eden diğer genler IMP (12 K. pneumoniae) ve VIM (45 K. pneumoniae), NDM-1 (27 K. pneumoniae) şeklinde belirlenmiştir. 264 Enterobacteriaceae Suşlarının hiçbirinde KPC ve OXA-58 genleri saptanmamıştır. Karbapenemaz üreten Enterobacteriaceae üyelerinin dünya çapındaki yayılımı, bu suşlarla oluşan enfeksiyonlarda tedavi seçeneklerinin oldukça sınırlı olması nedeniyle evrensel boyutta önemli bir sağlık sorununu oluşturmaktadır. Bu çalışmanın sonuçlarına bakıldığında karbapenem direncinin özellikle K. pneumoniae suşlarında daha yüksek olduğu ve karbapenem direncinden sorumlu primer enzimin OXA-48 olduğu fakat metallo-beta-laktamazlarında oldukça sık saptandığını göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Carbapenems have an important role in thetreatment of infections caused by Gram-negative bacteria with multiple drug resistance. However, with the emergence of enzymes that hydrolyze carbapenems cause decrease of the antimicrobial activity of carbapenems recently. Carbapenemases are beta-lactamases with the strongest hydrolytic activity. For the Enterobacteriaceae family carbapenemases like OXA-48, OXA-58, KPC and beta-lactamases such as IMP, NDM, VIM are mostly responsible for carbapenem resistance. In the study, it was aimed to investigate the carbapenemase gene regions of two the most frequently isolated infection agent of Enterobacteriaceae family. The study was carried out between January and December 2017 at Afyon Kocatepe University Hospital. During the study period, 264 Enterobacteriaceae strains including 207 Klebsiella pneumoniae and 57 Escherichia coli which were isolated from various clinical specimens included in the study. Genetic regions of clinical isolates responsible showing resistance or reduced susceptibility to any of the carbapenems have been investigated. Bacterial identification and antimicrobial susceptibility testing was carried out with conventional and otomated systems (Vitek 2, bioMerieux, USA). Gene regions coding for carbapenemases such as IMP, NDM, OXA-58, OXA-48, KPC and VIM have been investigated using the polymerase chain reaction method (PCR). Most of the strains isolated from anesthesi aintensive care unit and hospitalised surgical medicine unit patient and sample like urine (47,3 %), blood (19,3 %), wound (11,7 %), tracheal aspirate (10,6 %), sputum (6,8 %) and other samples (4,3%). In 43 % of isolates (102 K. pneumoniae, 12 E. coli) were detected at least one resistance or decreased susceptibility from imipenem, ertapenem and meropenem. In 88 % of carbapenem resistant isolates, the presence of at least one of the genes encoding carbapenemase was detected. OXA-48 was most frequently observed in carbapenemase-encoding genes (63 K. pneumoniae, 5 E. coli). Other following genes were identified as IMP (12 K. pneumoniae) and VIM (45 K. pneumoniae), NDM-1 (27 K. pneumoniae). No KPC and OXA-58 genes were detected in any of the 264 Enterobacteriaceae strains. The global spread of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae constitutes an important health problem on a universal scale due to the very limited treatment options available for infections with these strains. The results of this study show that carbapenem resistance is higher in K. Pneumoniae strains and that the primary enzyme responsible for carbapenem resistance is OXA-48 but is found frequently in metallo-beta-lactamases.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    559394

    Kan kültüründen izole edilen karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae ve Escherichia coli suşlarında karbapenemaz varlığının fenotipik ve moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of the presence of carbapenemase in K. pneumoniae and E.coli strains isolated from blood culture by phenotypic and molecular methods

    ASİYE BIÇAKÇIGİL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BANU SANCAK

  2. Tez No

    361584

    Enterobacteriaceae üyelerinde karbapenem direnci ve dirençten sorumlu enzimlerin varlığının araştırılması

    Investigation of carbapenem resistance in enterobacteriaceae species and the presence of the enzymes responsible from resistance

    ASLI BULUT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÜLŞAH AŞIK

  3. Tez No

    765944

    Karaciğer nakli yapılan hastaların kan kültüründe üreyen karbapenem dirençli enterobacteriacea suşlarında fosfomisin duyarlılığı ve fosfomisin direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of phosphomycin sensitivity and phosphomycin resistance genes in carbapenem-resistant enterobacteriacea strains in the blood culture of liver transplant patients

    YAKUP GEZER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİnönü Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR BAYINDIR

  4. Tez No

    656983

    Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella SPP. izolatlarının ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosilin'e fenotipik duyarlılığının belirlenmesi ve direnç genlerinin in house PCR yöntemiyle araştırılması

    Determination of phenotypic susceptibility to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin, fosfomycin and temocillin in which producing extended spectrum beta-lactamase isolates of eschericha coli and klebsiella spp. and investigation of resistance genes by in house pcr method

    ARZU TANRIVERDİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiAdıyaman Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLNUR TARHAN

  5. Tez No

    261026

    Üroloji kliniğinde üriner infeksiyon etkeni olan Klebsiella spp ve Escherichia coli izolatlarında antibiyotik direnci ve klonal yayılımın araştırılması

    Antibiotic sensitivities and clonality of Klebsiella spp and Escherichia coli isolated from urinary system infections in urology clinic

    EMEL DERİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKHAN AYGÜN

Geri Dön