Glioblastoma multiforme (GBM) tümör hücrelerinin ısıng modeli kullanılarak creutz cellular automaton ile simülasyonu
Simulation of glioblastoma multiforme (GBM) tumor cells using ising model on the creutz cellular automaton
- Tez No: 507485
- Danışmanlar: PROF. DR. ZİYA MERDAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 64
Özet
Tümör için yapılan bilgisayar modellemeleri, tümörün karmaşık doğası ve bilgisayarların kapasitelerinden dolayı zorluklara sahiptirler; fakat bu modeller tümör ile tümörün mikro çevresi arasındaki etkileşimini anlamak için farklı bakış açısı sağlamaktadır. Ayrıca bilgisayar modellemeleri, kanserin özelleştirilmiş tedavileri için stratejiler geliştirmektedir. Bu çalışmada bir beyin tümörü olan glioblastoma multiforme (GBM) tümör hücrelerinin iki boyutta Ising modeli kullanılarak Creutz Cellular Automaton ile simülasyonu yapılmıştır. Bu çalışmanın amacı, damarlanmanın olmadığı durumda, kanser hücreleri ile sağlıklı hücreler arasındaki etkileşimler sonucunda kanser hücrelerinin yarıçapa göre gelişimini zamanın bir fonksiyonu olarak incelemektir. CCA algoritması üzerinde kullanılan Ising model, tümör gelişimini zamanın bir fonksiyonu olarak gözlemek için konum uzayındaki lokal etkileşimleri ve kesikli zaman basamakları ile deterministik yaklaşım sağlamaktadır. Simülasyon sonuçları sabitlenmiş tümör yarıçapları için verilmiştir ve sonuçlar teorik ve klinik datalar ile uyumludur.
Özet (Çeviri)
Computational models for tumors have difficulties due to complexity of tumor nature and capacities of computational tools, however, these models provide different visions to understand interactions between tumor and its micro environment. Moreover computational models have been progressed to improve individualized treatments strategies for cancer. In this study, cells of glioblastoma multiforme (GBM) which is one of the brain tumor types are simulated by using two dimensional Ising model with Creutz cellular automata. The aim of this study is to investigate avascular cancer cells growth which is as a result of interaction between healthy cells cancer cells with respect to radius of tumor and as a function of time. Ising model on CCA algorithm provides a deterministic approach with discrete time steps and local interactions in position space to view tumor growth as a function of time. Simulation results are given for fixed tumor radius and they are compatible with theoretical and clinic data
Benzer Tezler
- Temozolomid (TMZ) dirençli ve normal Glioblastoma Multiforme (GBM) hücre hatlarında donafenib ve radyoterapi uygulamasının hücre sağkalımı açısından değerlendirilmesi
Evaluation of donafenib and radiotherapy application in temozolomide (TMZ) resistant and normal Glioblastoma Multiforme (GBM) cell lines in terms of cell survival
EMİNE YAZICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GAMZE TANRIÖVER
- The development of the 3D micropatterned ECM (extracellular matrix) models of glioma-astrocyte co-culture: Investigating glioma migration and astrocyte reactivity
Glioma-astrosit ko-kültürünün 3B mikrodesenli ECM (ekstraselülar matriks) modellerinin geliştirilmesi: Glioma migrasyonu ve astrosit reaktivitesinin incelenmesi
NİLUFAR ISMAYİLZADA
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyomühendislikKoç ÜniversitesiBiyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞADİYE EMEL SOKULLU
- Identifying epigenetic modifiers of glioblastoma multiforme apoptosis resistance
Glioblastoma multiforme 'de apoptoz direncini regüle eden epigenetik faktörlerin belirlenmesi
EZGİ ÖZYERLİ GÖKNAR
Doktora
İngilizce
2019
Moleküler TıpKoç ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUĞBA BAĞCI ÖNDER
- Radyasyona maruz bırakılan insan glioblastoma multiforme hücre kültürlerinde (U-87 MG VE T98G) trabectedin aracılı zenginleştirilmiş sitotoksik etkide dna tamir mekanizmalarının rolü
The role of dna repair mechanisms in trabectedin mediated enhanced cytotoxic effect in radiation treated human glioblastoma multiforme cell cultures (U-87 MG AND T98G)
EMİR BOZKURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiCelal Bayar ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELİM UZUNOĞLU
- Glioblastoma kanser kök hücrelerinde integrin ve adezyon gen profillerinin belirlenmesi
Profiling integrin and adhesion genes in glioblastoma cancer stem cells
ŞEYMA ÖZKANCA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Tıbbi BiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN SUNGUROĞLU