Kolon kanseri ve tükürük mikrobiyom ilişkisi
Association of colon cancer and saliva microbiome
- Tez No: 508832
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖMER DİZDAR
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Onkoloji, Microbiology, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Ağız florası, Gastrointestinal mikrobiyom, Kolon neoplazmları, Kolorektal neoplazmlar, Mikrobiyota, Neoplazmlar, Tükürük, Mouth flora, Gastrointestinal microbiome, Colonic neoplasms, Colorectal neoplasms, Microbiota, Neoplasms, Saliva
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Medikal Onkoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu araştırmada kolorektal kanser (KRK) hastalarının tükürük örneklerinde Fusobacterium nucleatum (Fn), Porphyromonas Gingivalis (Pg) ve Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus (Sg) varlığı ve miktarının incelenmesi ve sağlıklı kontrollerle karşılaştırılması amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya KRK tanısı yeni konmuş olup henüz herhangi bir tedavi almamış hastalar dahil edildi. Elli yaş üzeri, kanser öyküsü olmayan bireyler kontrol grubuna dahil edildi. Fn, Sg ve Pg suşlarının saptanması ve kantifikasyonu için 16S rRNA ile polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) analizleri yapıldı ve elde edilen veriler hastalar ve kontrol grubunda karşılaştırıldı. Bakteri miktarları log10 kopya/ml birimi ile raporlandı. Bulgular: Çalışmaya 71 hasta 77 kontrol olmak üzere toplam 148 kişi dahil edilerek tükürük örneği alındı. Hasta ve kontrol grubunun mikrobiyolojik ve klinik verileri analiz edildi. Hasta ve kontrol grubundan elde edilen tükürük örneklerinde total bakteri miktarı benzerdi (7,51±0,50 vs 7,45±0,62 log10 kopya/ml, p=0,549), iki grupta Fn (%97,2 vs %96,1 p>0,99), Sg (%31 vs %27,3 p=0,619) ve Pg (%76,1 vs %75,3 p=0,917) saptanma oranları benzerdi. Kantitatif analizde ise hastaların tükürük örneklerinde Fn ve Sg miktarı kontrol grubundan daha yüksek bulundu. Ortalama Fn miktarı hastaların tükürük örneklerinde 6,89±1,07 log10 kopya/ml, kontrollerde ise 6,35±0,78 log10 kopya/ml idi (p=0,001). Ortalama Sg miktarı hastaların tükürük örneklerinde 4,12±0,99 log10 kopya/ml, kontrollerde ise 3,15±0,58 log10 kopya/ml idi (p<0,001). Tükürük Pg miktarı iki grupta benzerdi. Tümörün yerleşimi (sağ vs sol kolon) ve evresine (Evre 1-2-3 vs evre 4) göre yapılan karşılaştırmalarda Fn, Sg ve Pg saptanma oranları ve miktarı benzerdi. Mikrosatellit instabilite (MSİ) (+) olan grupta Fn ve Sg miktarının MSİ (-) gruba göre anlamlı derecede daha düşük olduğu görüldü [Fn için sırasıyla 6,15 (4,35-7,96) vs 7,03 (5,18-8,97) log10 kopya/ml p=0,036; Sg için sırasıyla 3,44 (3,18-3,92) vs 4,13 (3,48-7,44) log10 kopya/ml, p=0,022]. ROC eğrisi analizi ile yapılan değerlendirmede, tükürük Sg miktarının KRK'yi öngörmede tanısal değeri olduğu görüldü (AUC: 0,84 %95 GA 0,72-0,96 p<0,001). Sınır değer 3,32 log10 kopya/ml olarak belirlendiğinde, bunun üzerinde Sg miktarının KRK için %82 duyarlılık ve %76 özgüllüğü olduğu görüldü Sonuç: Araştırmamızda, kolorektal kanser hastalarının tükürük örneklerinde Fn ve Sg miktarı kontrol grubundan daha yüksek bulundu. Bu bulgu KRK'nin etiyo-patogenezi, KRK açısından yüksek riskli grupların belirlenmesi, tarama çalışmaları ve KRK'yi önlemeye yönelik ağız ve diş eti sağlığına yönelik çalışmalar için önemli olabilir.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this study was to examine the presence and amount of Fusobacterium nucleatum (Fn), Porphyromonas gingivalis (Pg) and Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus (Sg) in saliva samples of colorectal cancer (CRC) patients in comparison with healthy controls. Material and Method: Patients with newly diagnosed CRC who have not yet received any treatment were included in the study. Control group consisted of individuals over 50 years of age without a prior diagnosis of malignancy. Polymerase chain reaction (PCR) analyzes were performed with 16S rRNA for identification and quantification of Fn, Sg and Pg strains. Bacterial quantities were reported in log10 copies/ml saliva units. Results: A total of 148 subjects including 71 patients and 77 controls were included in the study. The total amount of bacteria in the saliva samples from the patient and control group were similar (7,51±0,50 vs 7,45±0,62 log10 copies/ml, p=0,549). Detection rates of Fn (97,2% vs 96,1% p>0,99), Sg (31% vs 27,3% p=0,619) and Pg (76,1% vs 75,3% p=0,917) were similar in two groups. Mean Fn amount was higher in patient saliva samples compared with controls (6,89±1,07 vs 6,35±0,78 log10 copies/ml, p=0,001). Mean Sg amount was higher in patient saliva samples (4,12±0,99 vs 3,15±0,58 log10 copies/ml, p<0,001). Saliva Pg amount was similar in two groups. The frequency and amount of Fn, Sg, and Pg were similar in the comparison of tumor localization (right vs left colon) and stage (stage 1-2-3 vs stage 4). Fusobacterium nucleatum and Streptococcus gallolyticus subspecies gallolyticus were found to be significantly lower in the microsatellite insability (MSI) (+) group than in the MSI (-) group [6,15 (4,35-7,96) vs 7,03 (5,18-8,97) log10 copies/ml p=0,036 for Fn; 3,44 (3,18-3,92) vs 4,13 (3,48-7,44) log10 copies/ml, p=0,022 for Sg, respectively]. Evaluation of the salivary Sg amount by ROC curve analysis found to have diagnostic value for CRC (AUC: 0,84 %95 GA 0,72-0,96 p<0,001). Quantity of Sg above 3,32 log10 copy/ml was the best predictor cutoff value for CRC with 82% sensitivity and 76% specificity. Conclusion: In this study, the salivary samples of colorectal cancer patients had higher amounts of Fn and Sg than the control group. This finding may be important for etiopathogenesis of CRC, identification of high-risk groups for CRC, screening of CRC and studies of oral and gingival health for CRC prevention.
Benzer Tezler
- Streptococcus salivarius M18 hücresiz süpernatantinin, patojen bakterilerde anti-bakteriyel ve kolon kanseri hücrelerinde anti-kanser etkilerinin araştırılması
The cell-free supernatant of Streptococcus salivarius M18,investigation of anti-bacterial effects on pathogenic bacteria and anti-cancer effects on colon cancer cells
SEVİNÇ KARAÇAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiBilecik Şeyh Edebali ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNEM TUNÇER GURBANOV
DR. ÖĞR. ÜYESİ RAFIG GURBANOV
- Biyoteknolojik transformasyon ile alerjen molekül içeriği azaltılmış propolisin kanser hücrelerinde apopitozis ve anjiogenez üzerine etkisi
The effect of allergen molecule-reduced propolis with biotechnological transformation on apoptosis and angiogenesis in cancer cells
HIKMAT MAMMADOV
Doktora
Türkçe
2019
BiyokimyaEge ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESER YILDIRIM SÖZMEN
- Biyoalgılamaya yönelik elektrokimyasal sensörlerin geliştirilmesi
Development of electrochemical sensors for biorecognition
ECE EKŞİN
Doktora
Türkçe
2019
BiyokimyaEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADRİYE ARZUM ERDEM GÜRSAN
- Ratlarda ionize radyasyon ile indüklenen tükürük bezi disfonksiyonuna karşı berberin'in radyoprotektif etkisinin araştırılması
The investigation of radioprotective effect of berberine on the salivary gland disfunction which were induced with ionize radiation in the rats
HASAN YILDIRIM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Kulak Burun ve BoğazAtatürk ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED SEDAT SAKAT
- Insan pankreas kanserinin biyoinformatik araçlar ile genom boyu ifade analizi
Genome wide expression analysis of human pancreatic cancer with bioinformatics tools
LÜTFİYE KADIOĞLU DALKILIÇ