Geri Dön

Characterization of adipokinetic hormone receptor in stick insect, Carausius morosus

Değnek böceği Carausius morosus'ta adipokinetik hormon reseptörünün karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 512513
  2. Yazar: MERVE GİZEM SINMAZ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NECLA BİRGÜL İYİSON
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biyoloji, Biophysics, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 76

Özet

Adipokinetik hormone (AKH) bir böcek nöropeptiti olup, insanlardaki gonadotropin-salgılayan hormonun ortoloğu olarak da bilinir. Corpora cardiaca'dan salgılanır ve enerji mobilizasyonu için genellikle depo lipitleri üzerinde etkisini gösterir. Kan hemolenfindeki trehaloz seviyesinin, kalp atışı sıklığının ve protein sentezinin artması gibi birçok çeşitli fizyolojik fonksiyonlarda da yer alırlar. Ayrıca bazı böcek türlerinde yağ asitlerinin ve RNA sentezinin inhibe edilmesinde de görev yaparlar. Kendilerine karşılık gelen adipokinetik hormone reseptörü (AKHR) olarak isimlendirilen G-protein kenetli reseptörleri (GPCR) aktive ederler. Şimdiye kadar birçok AKHR çalışılmış, ancak değnek böceği C.morosus'takiler çalışılmamıştır. Değnek böceğinin transkriptom verisini kullanılarak, bu böceğe ait adipokinetik hormone reseptör (CamAKHR) ve adipokinetik hormon (CamAKH) tanımlanmıştır. Değnek böceğine ait AKHR'nin homoloji modellemesi, kenetlenme analizi ve moleküler dinamik yöntemleri ile karakterize edilmesi ve bu sayede yeni bir nöropeptit-esaslı yeni-jenerasyon pestisit üretimine katkı sağlaması amaçlanmıştır. Çalışmanın sonunda ligandın bağlanmasında önem taşıyan on üç rezidünün, CamAKHR modelinin çoğunlukla transmembran 6, transmembran 7 ve hücre dışı ilmek 2 bölgelerinde yer aldığı gözlemlenmiştir. Bu on üç rezidüden altısı farklı böceklerde de korunmuş halde bulunduğundan, önerilen bağlanma cebi CamAKHR'nin TM2, TM3, TM6 ve TM7 bölgelerine denk gelen Glu246, Arg269, Tyr423, Tyr430, Lys446 and Phe449 rezidülerini içermektedir.

Özet (Çeviri)

Adipokinetic hormone (AKH) is an insect neuropeptide and known as gonadotropin- releasing hormone, which is orthologue to humans. It is released from corpora cardiaca and acts generally on fat body for energy mobilization. It is also involved in several different physiological functions such as increasing blood hemolymph trehalose levels, heart beat frequency, and protein synthesis. Furthermore it functions in inhibiting fatty acid and RNA synthesis in different insect species. It activates its corresponding G-Protein Coupled Receptors (GPCR), which are Adipokinetic Hormone receptors (AKHR). Many AKHRs were studied so far, but not in stick insect, Carausius morosus. Utilizing transcriptome data of stick insect, its AKHR (CamAKHR) and AKH (CamAKH) were identified. It was aimed to characterize AKHR of stick insect by homology modeling, docking analysis and molecular dynamics within this project contributing to the production of a novel neuropeptide-based next-generation pesticide. At the end, thirteen important residues mostly located in transmembrane 6, transmembrane 7 and extracellular loop 2 regions of CamAKHR model were observed contributing to ligand binding in CamAKHR- CamAKH complex. Six of them were found as the most conserved residues in different insect species, therefore proposed binding pocket includes these Glu246, Arg269, Tyr423, Tyr430, Lys446 and Phe449 residues corresponding to TM2, TM3, TM6 and TM7 of CamAKHR.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    80242

    Vankomisin içeren Poli(D,L-laktik-ko-glikolik asit) implantların karakterizasyonu ve in vitro-in vivo salım davranışlarının incelenmesi

    Characterization of vancomycin containing poly(d,l-lactide-co-glycolide) implants and investigation of their in vitro-in vivo release behaviour

    YILDIZ ÖZALP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURTEN ÖZDEMİR

  2. Tez No

    82603

    Characterization of arylamine N-acetyltransferase in tissues from human breast cancer

    İnsan kanserli meme dokusunda arilamin N-asetiltransferaz enziminin karakterizasyonu

    YAŞASIN SENEM GEYLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TÜLİN GÜRAY

  3. Tez No

    82785

    Characterization of Aspergillus oryzae transformed with a plasmid carrying alfa-amylase gene

    (Alfa)-amilaz geni taşıyan bir plazmid ile transforme edilmiş aspergillus aryzae'nin karakterizasyonu

    GÖKHAN TOLUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ

  4. Tez No

    82786

    Characterization of membrane phospholipids and proteins of some wheat (Triticum aestivum l.) varieties under salt and drougth stress conditions

    Buğday (Triticum aestivum l.) bazı çeşitlerinin tuz ve kuraklık stresi altında hücre zarı fosfolipitlerinin ve proteinlerinin tanımlanması

    E.SEMA TORAMAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERAL YÜCEL

  5. Tez No

    82833

    Characterization of the Küçük Menderes River basin aquifer system

    Küçük Menderes Nehri Havzası akifer sisteminin karakterizasyonu

    KORAY KAMİL YILMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Jeoloji MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN YAZICIGİL

Geri Dön