Geri Dön

Characterization of adipokinetic hormone receptor in stick insect, Carausius morosus

Değnek böceği Carausius morosus'ta adipokinetik hormon reseptörünün karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 512513
  2. Yazar: MERVE GİZEM SINMAZ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NECLA BİRGÜL İYİSON
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biyoloji, Biophysics, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 76

Özet

Adipokinetik hormone (AKH) bir böcek nöropeptiti olup, insanlardaki gonadotropin-salgılayan hormonun ortoloğu olarak da bilinir. Corpora cardiaca'dan salgılanır ve enerji mobilizasyonu için genellikle depo lipitleri üzerinde etkisini gösterir. Kan hemolenfindeki trehaloz seviyesinin, kalp atışı sıklığının ve protein sentezinin artması gibi birçok çeşitli fizyolojik fonksiyonlarda da yer alırlar. Ayrıca bazı böcek türlerinde yağ asitlerinin ve RNA sentezinin inhibe edilmesinde de görev yaparlar. Kendilerine karşılık gelen adipokinetik hormone reseptörü (AKHR) olarak isimlendirilen G-protein kenetli reseptörleri (GPCR) aktive ederler. Şimdiye kadar birçok AKHR çalışılmış, ancak değnek böceği C.morosus'takiler çalışılmamıştır. Değnek böceğinin transkriptom verisini kullanılarak, bu böceğe ait adipokinetik hormone reseptör (CamAKHR) ve adipokinetik hormon (CamAKH) tanımlanmıştır. Değnek böceğine ait AKHR'nin homoloji modellemesi, kenetlenme analizi ve moleküler dinamik yöntemleri ile karakterize edilmesi ve bu sayede yeni bir nöropeptit-esaslı yeni-jenerasyon pestisit üretimine katkı sağlaması amaçlanmıştır. Çalışmanın sonunda ligandın bağlanmasında önem taşıyan on üç rezidünün, CamAKHR modelinin çoğunlukla transmembran 6, transmembran 7 ve hücre dışı ilmek 2 bölgelerinde yer aldığı gözlemlenmiştir. Bu on üç rezidüden altısı farklı böceklerde de korunmuş halde bulunduğundan, önerilen bağlanma cebi CamAKHR'nin TM2, TM3, TM6 ve TM7 bölgelerine denk gelen Glu246, Arg269, Tyr423, Tyr430, Lys446 and Phe449 rezidülerini içermektedir.

Özet (Çeviri)

Adipokinetic hormone (AKH) is an insect neuropeptide and known as gonadotropin- releasing hormone, which is orthologue to humans. It is released from corpora cardiaca and acts generally on fat body for energy mobilization. It is also involved in several different physiological functions such as increasing blood hemolymph trehalose levels, heart beat frequency, and protein synthesis. Furthermore it functions in inhibiting fatty acid and RNA synthesis in different insect species. It activates its corresponding G-Protein Coupled Receptors (GPCR), which are Adipokinetic Hormone receptors (AKHR). Many AKHRs were studied so far, but not in stick insect, Carausius morosus. Utilizing transcriptome data of stick insect, its AKHR (CamAKHR) and AKH (CamAKH) were identified. It was aimed to characterize AKHR of stick insect by homology modeling, docking analysis and molecular dynamics within this project contributing to the production of a novel neuropeptide-based next-generation pesticide. At the end, thirteen important residues mostly located in transmembrane 6, transmembrane 7 and extracellular loop 2 regions of CamAKHR model were observed contributing to ligand binding in CamAKHR- CamAKH complex. Six of them were found as the most conserved residues in different insect species, therefore proposed binding pocket includes these Glu246, Arg269, Tyr423, Tyr430, Lys446 and Phe449 residues corresponding to TM2, TM3, TM6 and TM7 of CamAKHR.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    413259

    Borlanmış AISI M35 ve AISI M42 çeliklerinin karakterizasyonu ve aşınma davranışlarının incelenmesi

    Characterization of the boronized AISI M35 & M42 steels and investigation of the wear behavior

    MEHMET KÜÇÜKKURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Metalurji MühendisliğiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Metalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HALİL AYTEKİN

  2. Tez No

    413316

    RF saçtırma yöntemi ile biriktirilen CdS ve ZnS ince filmlerin karakterizasyonu ve heteroeklem üretiminde kullanılması

    Characterization of CdS and ZnS thin films deposited by RF sputtering method and usage in the fabrication heterojunctions

    CİHAT BOZKAPLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Fizik ve Fizik MühendisliğiDicle Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL AKKILIÇ

  3. Tez No

    413445

    Küçükbaş hayvan derilerindeki ılımlı halofil bakterilerin karakterizasyonu

    Characterization of moderately halophilic bacteria found on the sheep and goat skins

    PINAR ÇAĞLAYAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERAL BİRBİR

    PROF. DR. ANTONIO VENTOSA

  4. Tez No

    413536

    Elmada 'Kaşel 37xdelbarestivale' f1 populasyonunda bazı meyve kalite kriterlerinin karakterizasyonu

    Characterization of some of the fruit quality characteristics on apple 'Kasel 37xdelbarestivale' f1 population

    MURAT AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESİBE EBRU KAFKAS

  5. Tez No

    416419

    Characterization of fly ashes from thermal power plants in Turkey

    Türkiye termik santrallerinden elde edilen uçucu küllerin karakterizasyonu

    MELTEM TANGÜLER BAYRAMTAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    İnşaat MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. ÇAĞLA MERAL

Geri Dön