Fosfomisin dirençli enterobacteriaceae izolatlarında fosfomisin direncinin genotipik olarak araştırılması
Investigation of fosfomycin resistance in fosfomycin resistant enterobacteriaceae isolates
- Tez No: 513084
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YELİZ TANRIVERDİ ÇAYCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Fosfomisin direnci, Enterobacteriaceae, fosA3, fosC2, Fosfomycin resistance, Enterobacteriaceae, fosA3, fosC2
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 54
Özet
Amaç: Çalışmaya, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıp Laboratuvarları Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü Bakteriyoloji Laboratuvarına gönderilmiş idrar yolu örneklerinden izole edilen 185 Enterobacteriaceae izolatı dahil edildi. Çalışmaya dahil edilen Enterobacteriaceae izolatlarında, fosfomisin direncinden sorumlu olduğu bilinen genlerden fosA3 ve fosC2 genlerinin varlığının moleküler olarak tespit edilmesi planlandı. Materyal ve Metot: İzolatların tanımlanması Vitek MS (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi kullanılarak yapıldı. Antibiyotik duyarlılığı Vitek 2 Compakt (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ve disk difüzyon yöntemleri ile test edildi. Enterobacteriaceae izolatları moleküler çalışmaya kadar -20°C'de saklamaya alındı. Fosfomisin dirençli izolatların kaynatma yöntemiyle DNA ekstraksiyonu yapıldı. DNA ekstraksiyonundan sonra özgün primerler kullanılarak optimizasyon işlemi yapıldı. Optimizasyon işleminin ardından Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) yöntemiyle Enterobacteriaceae izolatlarında fosA3 ve fosC2 genlerinin varlığı araştırıldı. PZR işleminin ardından sekans analizi yapıldı. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen Enterobacteriaceae izolatlarının en çok Dahiliye (%23,2), Üroloji (%19,5) ve Nöroloji (%18,9) servislerinden gönderildiği belirlendi. Enterobacteriaceae izolatları ile yapılan PZR işlemi sonucunda izolatların 2'sinde fosA3 geni yönünden pozitif olarak bulunurken, izolatların hiçbirinde fosC2 geni tespit edilemedi. Sonuç: Yaptığımız çalışmaya dahil edilen Enterobacteriaceae izolatlarının %1,1'i fosA3 geni yönünden pozitif bulundu. Ancak izolatların hiçbirinde fosC2 geni tespit edilemedi.
Özet (Çeviri)
Aim: This study was included 185 Enterobacteriaceae, which isolated from clinical samples and sent to Bacteriology Laboratory of Medical Microbiology Department of Medical Faculty of Ondokuz Mayıs University Medical School. We aimed to investigate the presence of fosA3 and fosC2 genes that cause fosfomycin resistance in Enterobacteriaceae isolates which were included in the study. Material and Method: Identification of isolates were performed in Vitek MS (bioMérieux, Fransa) automated system. The antibiotic susceptibility was tested with the Vitek 2 Compact (bioMérieux, Fransa) automated system and disc diffusion method. Enterobacteriaceae isolates were stored at -20 ° C until the molecular study. DNA extraction of fosfomycin resistant isolates was performed by boiling method. After DNA extraction, optimization was performed using the original primers. After optimization, fosA3 and fosC2 genes were investigated by polymerase chain reaction (PCR) method. Sequence analysis was done for the positive isolates after PCR. Results: It was determined that the Enterobacteriaceae isolates included in the study were sent mostly from Internal Medicine (23.2%), Urology (19.5%) and Neurology (18.9%) services. As a result of the PCR and seqeunce, 2 of the 185 Enterobacteriaceae isolates were positive in the fosA3 gene, fosC2 gene was not detected. Conclusion: As a result 1.1% of Enterobacteriaceae isolates included in the study were positive for fosA3 gene. However, no fos C2 was detected in any of the isolates.
Benzer Tezler
- Klinik Enterobacteriaceae izolatlarında fosfomisin direncinin moleküler epidemiyolojisi ve biyolojik özelliklere etkisi
Molecular epidemiology of fosfomycin resistance and effect on biological properties in clinical Enterobacteriaceae isolates
MUSTAFA ÖKEER
Doktora
Türkçe
2023
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAYRI ERAÇ
- Karbapanemaz dirençli enterobactericeae 'lerin antibiyotik duyarlılıklarının iki farklı panelle (phoenix BD) karşılaştırılması
Comparison of antibiotic susceptibility of carbapanemase resistant enterobactericeae with TWO different panels (phoenix BD)
HACER UĞURLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT ARAL
- Karaciğer nakli yapılan hastaların kan kültüründe üreyen karbapenem dirençli enterobacteriacea suşlarında fosfomisin duyarlılığı ve fosfomisin direnç genlerinin araştırılması
Investigation of phosphomycin sensitivity and phosphomycin resistance genes in carbapenem-resistant enterobacteriacea strains in the blood culture of liver transplant patients
YAKUP GEZER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİnönü ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAŞAR BAYINDIR
- Üriner sistem enfeksiyonlarında etken olan gram negatif bakterilerin direnç paternleri
Resistance pattern in gram negative bacteria causing urinary system infections
AYŞİM BENGÜ KÜÇÜKAKKAŞLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CUMHUR ÇÖKMÜŞ
- Ratlarda klebsiella pneumoniae ile oluşturulan deneysel peritonit modelinde kolistin ve fosfomisin tedavisinin etkinliklerinin karşılaştırılması
Comparison of the efficacy of colistin and fosfomycin treatment in a rat model of klebsiella pneumoniae peritonitis
AYSEL KÖKSAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ERTEK
UZMAN SABAHAT ÇEKEN