Geri Dön

Modification of catalytic subunit of dna polymerase gamma by CRISPR/CAS9 genome editing technology

Dna polimeraz gama katalitik alt ünitesi gen bölgesinin CRISPR/CAS9 genom düzenleme teknolojisi ile modifikasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 515990
  2. Yazar: AYŞEGÜL EKMEKÇİOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MELTEM MÜFTÜOĞLU, DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE DENİZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Biotechnology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: BER, CRISPR/Cas9 teknolojisi, kanser, pol, sentetik letalite, Base excision repair, cancer, CRISPR/Cas9 technology, pol, synthetic lethality
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

DNA polymerase g (polg) ve MLH1 arasındaki sentetik lethal ilişki, MLH1 mutasyonuna sahip/hasarlı kanser hücrelerinin polg'nın küçük molekül inhibitörleri ile seçici olarak öldürülmesini sağlayabileceği için önemli bir yaklaşımdır. Polg mitokondriyel baz eksizyon tamir (BER) yolağında, tümör baskılayıcı protein MLH1 ise yanlış eşleme tamir (MMR) yolağında görev almaktadır. MMR, DNA replikasyonu sırasındaki tamir fonksiyonun yanı sıra temel tamir yolağı BER olan oksidatif DNA hasarının da tamirin de görev almaktadır. Seçici kanser tedavisi için polg inhibisyonu önemli bir hedeftir. Polg inhibitörleri aracılığıyla oluşan kanser hücrelerinin ölümlerinin diğer hücresel faaliyetleri etkilemeden sadece polg'nın hücredeki fonksiyonuna bağlı olarak mı gerçekleştiğini belirlemek için polg proteini susturulmuş hücrelere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu nedenle, bu çalışma kapsamında MLH1 geni mutasyonu taşıyan (HCT116) ve mutasyona uğramamış MLH1 geni taşıyan (HCT116_Chr3) hücre hatlarında CRISPR/Cas9 genom düzenleme teknolojisi kullanılarak inhibe edilmiş/mutasyona uğratılmış polg proteini elde edilmesi amaçlanmıştır. Polg geninin susturulmasında, polg proteinin enzimatik aktiviteye sahip olan katalitik alt ünitesinin birinci ekzonu hedeflenmiştir. Polg proteininde CRISPR/Cas9 teknoloji kullanılarak erken stop kodonu yaratılarak gen susturulmuştur. Sonuç olarak, tekli hücre kolonilerinin üçünde polg geni susturulmuştur.

Özet (Çeviri)

The synthetic lethality between DNA polymerase g (polg) and MLH1 is an important approach to kill MLH1 mutated/deficient cancer cells selectively through the small molecule inhibitors of polg. Polg involves in mitochondrial base excision repair (BER) and tumor suppressor protein MLH1 plays a role in mismatch repair (MMR). Besides its repair function during DNA replication, MMR also involves in the repair of oxidative DNA damage where the major repair pathway is BER. The polg inhibition is a powerful target for the selective cancer treatment. To determine if polg inhibitors-mediated tumor or cancer cell death is only through the cellular function of polg without affecting other cellular processes, polg knockdown cells are needed. Therefore, the aim of this study was to create inhibited/mutated polg protein in MLH1 deficient HCT116 colon cancer and MLH1 proficient HCT116_Chr3 cell lines by using CRISPR/Cas9 gene editing technology for polg. The first exon of the catalytic subunit of polg was targeted for the polg gene silencing, because it has all the enzymatic activities. A frame-shift mutation was created on polg gene by CRISPR/Cas9 technology which caused to the premature stop codon and then polg gene silencing. Consequently, three of the single cell colonies were identified as polg knockdown cells.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    494693

    Hepatoselüler karsinoma ve nöroblastoma hücre hatlarında insan telomerazı htert alt birimi olası glikozilasyon profilinin biyoinformatik ve deneysel yöntemlerle belirlenmesi

    Determination of potential glycosylation profile for human telomerase's htert subunit in hepatocellular carcinoma and neuroblastoma cell line with bioinformatic and experimental methods

    SİNEMYİZ ATALAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REMZİYE DEVECİ

  2. Tez No

    811090

    Kapsaisinle muamele edilmiş YKG-1 (glioblastoma) ve HUVEC hücrelerinde telomeraz geni transkript varyantlarının tip ve seviyelerinin belirlenmesi

    Determination of type and level of telomerase gene transcripts variants in capsaicin treated YKG-1 (glioblastoma) and HUVEC cells

    FEYZA NUR ZABUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Moleküler TıpKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY

  3. Tez No

    440183

    EZH2 aracılıklı h3k27me3 modifikasyonunun hepatoselüler karsinoma gelişimindeki rolü

    The role of EZH2 mediated H3K27ME3 modification in the development of hepatocellular carcinoma

    SANEM TERCAN AVCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Moleküler TıpDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞERİFE ESRA ERDAL BAĞRIYANIK

  4. Tez No

    201286

    Alfa amilaz-dekstran konjugatlarının sentezi ve karakterizasyonu

    Synthesis and characterization of alpha amylase-dextran conjugates

    ÖZLEM ÖZTOLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyokimyaYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HURİYE KUZU

  5. Tez No

    323731

    Alkil zincirleri ile sübstitüe asimetrik ftalosiyanin sentezi

    Synthesis of alkyl chain substituded unsymmetrical phthalocyanines

    NİLGÜN ÖZGÜR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESİN HAMURYUDAN

Geri Dön