Miyeloid hematolojik malignensilerde miRNA oluşum yolağındaki genlerin ekspresyon düzeylerinin araştırılması
The investigation of expression levels of miRNA biogenesis genes in myeloid hematological malignancies
- Tez No: 522098
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ERTAN AY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Hematolojik malignensiler, miRNA, Drosha, DGCR8, hematopoez, ekspresyon
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 115
Özet
Hematolojik malignensiler, kan, kemik iliği, lenfoid nod ve lenfatik sistemin diğer kısımlarını etkileyen malignant neoplazmlardır. Miyeloid hematolojik malignensiler, yüksek morbidite ve mortaliteye yol açtığından erken tanı ve etkili tedavi oldukça önemlidir. Hematolojik malignensilerin gelişiminde çalışmalar, çoğunlukla miRNA'lar üzerine yoğunlaşmıştır. miRNA'lar hematopoezin potansiyel düzenleyicileridir. Bu çalışmada, miyeloid hematolojik malignensilerde miRNA biyogenezindeki yolağında rol alan Drosha, DGCR8, Dicer, XPO5, AGO1, AGO2 ve TARBP2 genlerinin ekspresyon düzeyleri araştırıldı. Çalışma grubuna, Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları Anabilim Dalı Hematoloji Bilim Dalı'na başvuran 34 Miyelodisplastik Sendrom (MDS) ve 20 Akut Miyeloid Lösemi (AML) tanısı almış toplam 54 hasta ve 7 sağlıklı birey dahil edildi. Hasta ve sağlıklı bireylerden alınan kemik iliği örneklerinden total RNA izolasyonu ve cDNA isentezi gerçekleştirildi, Seçilen genler, qPCR yöntemiyle analiz edildi. Bu genlerin ekspresyon düzeyleri; Toplam hasta (AML ve MDS)- kontrol, MDS-kontrol, AML-kontrol ve AML-MDS grupları arasında Ki-kare testi, Shapiro–Wilk testi, Student t-testi, Mann-Whitney U testi kullanılarak istatistiksel olarak değerlendirildi. Her iki grupta da XPO5 ve AGO2 genlerinin ekspresyon düzeyleri Real-time'da saptanamadığı için istatistiksel olarak değerlendirilemedi. Drosha, DGCR8, Dicer, AGO1 ve TARBP2 genlerinin ekspresyon düzeyleri açısından toplam hasta-kontrol ve MDS-kontrol arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark olduğu gözlendi (p0,05), TARBP2 ekspresyon düzeyinde ise anlamlı bir farklılık saptandı. Sonuç olarak, miRNA biyogenezinde görevli Drosha, DGCR8, Dicer, AGO1 ve TARBP2 genlerindeki ekspresyon değişimleri, AML ve MDS gibi miyeloid hematolojik malignensilerin oluşumuna katkı sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Hematological malignancies are malignant neoplasms that affect blood, bone marrow, lymphoid nodes and other parts of lymphatic system. Since myeloid hematological malignancies cause high morbidity and mortality, early diagnosis and effective treatment is very important. Studies about hematological malignancies have been mostly focus on miRNAs. miRNAs are potential regulators of hematopoiesis. In this study, the expression levels of miRNA biogenesis genes Drosha, DGCR8, Dicer, XPO5, AGO1, AGO2 and TARBP2 were investigated in myeloid hematological malignancies. In total, 54 patients with diagnosed AML (n=20) and MDS (n=34) and a control group of 7 healthy participants were recruited from Mersin University, Faculty of Medicine Department of Internal Medicine, Hematology Department. After total RNA isolation and cDNA synthesis, miRNA biogenesis genes were analyzed with qPCR method. Expression levels of these genes were evaluated between the total patient (AML and MDS) and control, MDS patients and control, AML patients and control and AML-MDS groups statistically by using the Chi-square test, Shapiro-Wilk test, Studendt's t-test, Mann-Whitney U test. We could not detect the expression level of XPO5 and AGO2 genes in control and healthy groups in Real time PCR so they could not be calculated by statistically. While the expression levels of Dicer, Drosha, AGO1 and TARBP2 were lower, the level of DGCR8 was higher in total patients compared to healthy group. Similar results were seen between MDS and healty group. While there was a significant difference in the expression levels of Drosha, DGCR8, Dicer, AGO1 genes between AML and healthy group (p
Benzer Tezler
- Miyeloid malignansilerde hematopoetik miRNA ekspresyonlarının araştırılması
Investigation of miRNA ekspressions in Myeloid hematopoietic malignancies
CEMİLE ERSÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ERTAN AY
- Hematolojik malignansilerde miyeloid stem hücre (CFU-GM) oluşumunun değerlendirilmesi
The Formation of the myeloid stem cell (CFU-GM) in hematological malignancies
GÜLLÜ TOPAL
- Hematolojik malignensilerde konvansiyonel sitogenetik, moleküler ve moleküler sitogenetik uygulamalar
Conventional cytogenetics, molecular and moleccular cytogenetics aplications in hematological malignancies
BARBAROS YİĞİT
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. PINAR ASLAN KOŞAR
- Kronik miyeloid lösemi (KML) hastalarında sFRP1 geninin promotör bölgesinin epigenetik ve genetik değişikliklerinin incelenmesi
Investigation of the genetic and epigenetic alterations in the promotor region of sFRP1 gene in chronic myeloid leukemia (CML) patients
MELEK PEHLİVAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. H.OGÜN SERCAN
- Dasatinib ile muamele edilen k562 hücre serisinde, dasatinib'in, pp2a katalitik ve regulatuvar alt birimlerinde, enzim aktivitesine ve protein ekspresyonu üzerine etkisinin değerlendirilmesi
The evaluation of the effects of dasatinib on protein expression and the enzymatic activity of PP2A catalytic and regulatory subunits that are dasatinib-treated k652 cell line
BUKET ÖZEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NUR SELVİ