Yeni tasarlanmış ferrosenil üre benzimidazol sensörlerinin metal, redoks ve fotokimyasal özelliklerinin DFT metodu ile incelenmesi
Investigation of metal, redox and photochemical properties of newly designed ferrocenyl urea benzimidazole sensors by DFT method
- Tez No: 522293
- Danışmanlar: PROF. DR. FATMA SEVİN DÜZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Organik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 121
Özet
Bu çalışmada, yeni tasarlanan, ferrosen-benzimidazol tabanlı ve metal iyonlarına (Ca2+, Mg2+ ,Zn2+, Hg2+, Pb2+, Ni2+, Co2+, Cu2+) duyarlı, redoks ve floresans özellik göstermesi beklenen moleküler sensörlerin hesapsal olarak elektronik ve fotokimyasal özelliklerinin incelenmesi amaçlanmıştır. Tasarlanan sensör, ferrosen birimine bağlı üre köprüsü içeren bir bağlayıcı birim ve ona bağlı floresan sinyali veren benzimidazoldan oluşmaktadır. Moleküler modelleme için DFT yöntemi B3LYP (Rives ve Jorgensen, 2008) hibrit yaklaşımının Lanl2dz temel seti kullanılmıştır. Tüm hesaplamalar, gaz ve su fazı olarak iki ayrı fazda, RHF yöntemi ile (spin çokluğu=1 ) yapılmıştır. Tasarlanan sensörün fotokimyasal ve elektrokimyasal özellikleri teorik olarak incelendiğinde, sensörün metal iyonları ile indirgenme potansiyel değerleri 1,078 V ile 0,968 V arasında değişmektedir. Su fazında, en istemli gibbs serbest enerjisi Ni-FcUB ve Co-FcUB kompleksine aittir (sırasıyla -122,19 kcal/ mol ve -99,83 kcal/mol). UV-görünür bölge spektrumları, su fazında, Ca2+, Mg2+, Hg2+, Zn2+ iyonlarının varlığında maviye kayma; Co2+, Cu2+, Ni2+, Pb2+ iyonlarının varlığında ise kırmızıya kayma vermiştir. Aynı fazda, maksimum absorpsiyon dalgaboyu 780 nm ile Co-FcUB sensörüne aittir ve diğer metal iyonlarına göre daha duyarlıdır.
Özet (Çeviri)
In this study, it is aimed to investigate computationally electronic and photochemical properties of newly designed molecular sensors which is ferrocene-benzimidazole-based, sensitive to metal ions (Ca2+, Mg2+ ,Zn2+, Hg2+, Pb2+, Ni2+, Co2+, Cu2+), expected to exhibit redox and photochemical properties. The designed sensor consists of a binding unit containing a urea bridge connected to the ferrocene unit and a benzimidazole which gives a fluorescence signal attached thereto. For the molecular modeling, the Lanl2dz base set of the hybrid approach of the DFT method B3LYP (Rives and Jorgensen, 2008) was used. All calculations were done with RHF method (spin multiplication = 1) in two separate phases, gas and water phase. When the photochemical and electrochemical properties of the designed sensor are theoretically analyzed, the potential values of the sensor for reduction with metal ions range from 1,078 V to 0,968 V. In the water phase, the most volatile gibbs free energy belongs to the Ni-FcUB and Co-FcUB complexes (-122.19 kcal / mol and -99.83 kcal / mol, respectively). UV-visible region spectrums in the water phase give to blue-shift in presence of Ca2+, Mg2+, Hg2+, Zn2+ ions, but red-shift occurs in presence of Co2+, Cu2+, Ni2+, Pb2+ ions. In the same phase, the Co-FcUB sensor was found to give a maximum absorption wavelength at 780 nm.
Benzer Tezler
- Metal iyonlarına duyarlı yeni tasarlanmış ferrosenil tiyazol benzimidazol sensörün teorik olarak incelenmesi
Theoretical investigation of new designed ferrocenyl thioazole benzimidazole sensors, sensible to metal ions
MİNE ALŞAN
- Ferrosen-artemisinin hibrit yapılarının sentezi ve biyolojik uygulamaları
Synthesis and biological applications of hybrid structures of ferrocene-artemisinin
NEVROZ ASLAN ERTAŞ
Doktora
Türkçe
2021
BiyokimyaVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARİF KIVRAK
DR. ÖĞR. ÜYESİ CAN YILMAZ
- Sürekli karbon nanotüp üretimi
Continuous carbon nanotube production
İBRAHİM MUTLAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Fizik ve Fizik MühendisliğiAnkara ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURHANETTİN ÇİÇEK
- Ferrosen birimi içeren benzimidazol türevli bileşiklerin DNA bağlanma, DNA kesim ve antioksidan aktivitelerinin tayini
Investigation of dna binding, DNa cleavage and antioxidant activities of benzimidazole derivatives compounds with ferrocene unit
ŞEYDA AKKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyokimyaKaradeniz Teknik ÜniversitesiEczacılık Biyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ARZU ÖZEL
- Altın biriktirilmiş polivinil ferrosen modifiye Pt elektrodunu temel alan glukoz biyosensörünün geliştirilmesi
Development of glucose biosensor based on gold deposited PVF modified Pt electrode
MERAL TOPCU