OGG1'ın doğasal formunun ve Ser326Cys polimorfik vartantının AR ve NKX3.1 ile etkileşimi
Interaction of AR and NKX3.1 with wild-type OGG1 and Ser326Cys polymorphic variant of OGG1
- Tez No: 524894
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ BİLGE DEBELEÇ BÜTÜNER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
OGG1 (8-oxoG DNA glikozilaz 1), oksidatif stres nedeniyle oluşan 8-oxoG baz hasarlarının onarımından sorumlu bir BER elemanıdır. Tek bir amino asit değişimi ile oluşan polimorfik varyantı Ser326Cys'in, onarım aktivitesinde bir eksikliğe neden olup olmadığı ve prostat kanseri(PCa)ne karşı yatkınlıkta bir etken olup olmadığı hala şüphelidir. Baz hasarlarını onaran DNA tamir enzimlerinin hücre içindeki diğer proteinlerle etkileşiminin saptanması, kanser tedavi yöntemlerinin ve terapötik hedeflerin belirlenmesi açısından önemlidir. Erkekler arasında en sık rastlanan kanser türü prostat kanseridir. PCa hücrelerinde, 8-oxoG tamir kompleksi içerisinde OGG1 ile birlikte yer alan proteinleri saptayabilmek için yapılan çalışmalardan birinde, NKX3.1 ve AR ile aralarında protein-protein etkileşimi olduğu gösterilmiştir. Bu tez çalışmasında OGG1'ın ve (S326C) polimorfik varyantının aynı etkileşim içerisinde olup olmadığı immünopresipitasyon ve GST çöktürme yöntemleriyle araştırılmış fakat etkileşim olmadığı gözlenmiştir. İmmünofloresan sonuçları ile OGG1 ve NKX31.'in hücre içerisinde kolokalize olduğu gösterilmiş, fakat (S326C) ve NKX3.1'in kolokalize olmadığı saptanmıştır. Sonuç olarak, androjen ile regüle edilen NKX3.1'in ve DNA tamir enzimi OGG1'in, doğrudan bir etkileşim içerisinde olmasalar bile dolaylı yoldan etkileşimde oldukları görülmüş, S326C polimorfik varyantında ise doğrudan veya dolaylı olarak herhangi bir bağlantı olmadığı saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
OGG1 (8-oxoG DNA glycosylase 1) is a BER element responsible for repair of 8-oxoG base damage related to oxidative stress. It is still doubtful whether Ser326Cys, a polymorphic variant formed by a single amino acid change, causes a deficiency in repair activity and is a factor in susceptibility to prostate cancer (PCa). Determination of the interaction of DNA repair enzymes that repair base damage with other proteins in the cell is important for determining cancer treatment strategies and therapeutic targets. The most common type of cancer among men is prostate cancer. In a study on PCa cells to detect proteins associated with OGG1 in the 8-oxoG repair complex, protein-protein interactions with NKX3.1 and AR have been shown. In this thesis, whether or not OGG1 and its polymorfic variant S326C were in the same interaction was investigated by immunoprecipitation and GST precipitation metods, but it is observed that there is no interaction. Immunofluorescence microscope results showed that OGG1 and NKX31 were colocalized within the cell, but Ser326Cys and NKX3.1 was not found to be colocalized. As a result, it has been found that the androgen regulated NKX3.1 and the DNA repair enzyme OGG1 interact indirectly even if they are not in direct interaction, in the S326C polymorphic variant, there was no direct or indirect linkage.
Benzer Tezler
- Yaşa bağlı katarakt hastalarında XPD (RS1799793) ve OGG1 (RS1052133) genlerindeki polimorfizmlerin araştırılması
Investigation of polyorphisms in XPD (RS1799793) and OGG1 (RS1052133) genes in age-related cataract patients
BARAN YÜCEL
- Behçet hastalığında dna hasarları ve OGG1 gen ifade düzeyleri
DNA damages and OGG1 gene expression levels in behcet's disease
İREM DURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Tıbbi Biyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET GÜVEN
- Diabetes mellitus hastalığının etiyolojisinde GST gen ve OGG1 gen polimorfizmlerinin rolü
Role of GST gene and OGG1 gene polymorphisms in etiology of diabetesmellitus disease
NÜVİT GÖNÜL
Doktora
Türkçe
2010
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BENSU KARAHALİL
- Pankreas kanserli hastalarda OGG1 ekspresyonu ve promotör metilasyonunun sağ kalım süresi üzerine etkisi
The effect of OGG1 expression and promoter methylation on survival rate in patients with pancreatic cancer
ÇAĞLAYAN AKKAYA ENGİN
Doktora
Türkçe
2023
Biyokimyaİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YILDIZ DİNCER
- DNA onarım enzimi OGG1 Ser326Cys polimorfizmi ile akciğer kanseri ilişkisinin Türk popülasyonunda araştırılması ve oksidatif hasarın biyogöstergesi 8-OHdG ölçümü
Association of the OGG1 ser326cys polymorphism with lung cancer risk and 8-OHdG levels as a biomarker of oxidative damage in Turkish population
ESRA EMERCE TUFAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. BENSU KARAHALİL