Enterococcus faecalıs biyofilm yapısında eDNA'nın rolü vebiyofilm ile mücadelede enzim ve antibiyotik uygulamasıyoluyla biyofilm yapılarının zayıflatılması
The role of eDNA on biofilm structures of enterococcus faecalis and combat with biofilm structure via enzyme and antibiotic treatment to weakening of the biofilm structure
- Tez No: 531517
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 160
Özet
Bu tez çalışmasında, Gram pozitif fırsatçı bir patojen olan Enterococcus faecalis'e ait 4 suşta (74, 114, ATCC 29212 ve ATCC OG1RF) eDNA'nın biyofilm üretimindeki rolünün tanımlanması ve bu patojenle abiyotik yüzeylerde mücadelede enzimler ve antibiyotiklerin kullanım olanaklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Denemelerde kullanılan tüm suşlarda en yüksek düzeyde eDNA üretiminin, 24 saat inkübasyon sonunda gerçekleştiği belirlenmiştir. Öncelikle; 20, 50 ve 100 ng/μl eDNA (hücre dışı DNA) ve gDNA (genomik DNA) ilave edilmiş ortamlarda 24 ve 48 saat süresince geliştirilen biyofilmlerin miktarsal tayinleri yapılarak her iki tip DNA'nın biyofilm oluşumu üzerindeki etkinliği saptanmıştır. Daha sonra ise aynı ortamlara eDNA ve gDNA'nın yanında çeşitli enzimler de ilave edilerek, bu ajanların biyofilm yapıları üzerine kombine etkileri tanımlanmıştır. Çalışmalar sonucunda, eDNA'nın ve gDNA'nın Enterokok biyofilmleri üzerine, suştan suşa ve inkübasyon süresine bağlı olarak değişen bir etkinlik gösterdiği tespit edilmiştir. Antibiyotik ve enzim çalışmalarında, kanamisin uygulamasının biyofilm miktarını artırdığı, nalidiksik asit uygulamasının herhangi bir etkinlik göstermediği, tetrasiklin ve ampisilin uygulamalarının ise biyofilm yapıları üzerinde düşük inhibisyon etkisine sahip olduğu belirlenmiştir. DNaz I ve Benzonaz® enzimlerinin antibiyotiklerle birlikte kombine edilerek kullanımı, antibiyotiklerin genel etkinlik biçiminde önemli bir değişime yol açmamıştır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, it was aimed to define the role of eDNA (extracellular DNA) in the production of biofilms of 4 strains belong to Enterococcus faecalis (74, 114, ATCC 29212 and ATCC OG1RF), a Gram positive opportunistic pathogen and to determine the possibilities of using enzymes and antibiotics in combating with this pathogen on abiotic surfaces. It was determined that the highest level of eDNA production, in all the strains used in the experiments, was performed after 24 hours incubation. Firstly; quantitative determination of the biofilms developed in 24 and 48 hours in media supplemented with 20, 50 and 100 ng /μl eDNA and gDNA (genomic DNA) was performed to determine the activity of both types of DNA on biofilm formation. Then, various enzymes were added to the same media along with eDNA and gDNA, and the combined effects of these agents on biofilm structures were defined. The results of the study indicated that eDNA and gDNA showed an altered activity on enterococci biofilms depending on strain diversity and incubation time. In antibiotic and enzyme studies, it was determined that the application of kanamycin increased the amount of biofilm, nalidixic acid application did not show any activity, while tetracycline and ampicillin had a low inhibitory effect on biofilm structures. The combined use of DNaz I and Benzonase® enzymes with antibiotics did not cause a significant change in the overall effectiveness of antibiotics.
Benzer Tezler
- İmidazolyum bazlı iyonik sıvıların antimikrobiyal potansiyellerinin incelenmesi
Investigation of the antimicrobial potential of imidazolium-based ionic liquids
ALİ NİYAZİ DUMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA YURT ONARAN
- Parasetamol ve ibuprofen içeren nanoliflerin antibiyofilm özelliklerinin değerlendirilmesi
Evaluation of antibiofilm characteristics of nanofibers including paracetamol and ibuprofen
GÜRKAN ALKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEYHAN ULUSOY
DOÇ. DR. AYHAN ORAL
- Dentin diskleri üzerinde oluşturulan enterococcus faecalis biyofilm modeli kullanılarak sodyum hipoklorit, setrimid ve glycrrhiza glabra l. ekstraktının antimikrobiyal etkinliğinin değerlendirilmesi
Evaluation of the antimicrobial efficacy of sodium hypochlorite, cetrimide and glycyrrhiza glabra l. extract on enterococcus faecalis biofilms formed on dentin disks
HİLMİ EGEMEN GÜLDAŞ
Doktora
Türkçe
2014
Diş HekimliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiEndodonti Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE DİLJİN KEÇECİ
- Yeni bir antibiyotik olan HEAA'nın ENTEROCOCCUS -faecalis v-583 bakteri biyofilmleri üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of a new antibiotic HEAA on ENTEROCOCCUS -faecalis v-583 bacterial biofilms
GÜLŞAH UYGUR
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Biyokimyaİstanbul ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYBEN KİLİSLİOĞLU
- Güncel kanal içi ilaçların ve yeni hidrojellerin rejeneratif endodontide kullanımı sonrasında E. faecalis biyofilmini uzaklaştırma etkinliği ve kök hücreler üzerindeki sitotoksik ve alkalen fosfataz aktivitesi
E. faecalis biofilm removal efficacy and cytotocix and alkaline phosphatase activity on stem cells after the use of conventional medicaments and new hydrogels in regenerative endodontics
ADEM ÖZTÜRK
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2024
Diş HekimliğiSelçuk ÜniversitesiEndodonti Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYÇE ÜNVERDİ ELDENİZ