Enterococcus faecalıs biyofilm yapısında eDNA'nın rolü vebiyofilm ile mücadelede enzim ve antibiyotik uygulamasıyoluyla biyofilm yapılarının zayıflatılması
The role of eDNA on biofilm structures of enterococcus faecalis and combat with biofilm structure via enzyme and antibiotic treatment to weakening of the biofilm structure
- Tez No: 531517
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında, Gram pozitif fırsatçı bir patojen olan Enterococcus faecalis'e ait 4 suşta (74, 114, ATCC 29212 ve ATCC OG1RF) eDNA'nın biyofilm üretimindeki rolünün tanımlanması ve bu patojenle abiyotik yüzeylerde mücadelede enzimler ve antibiyotiklerin kullanım olanaklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Denemelerde kullanılan tüm suşlarda en yüksek düzeyde eDNA üretiminin, 24 saat inkübasyon sonunda gerçekleştiği belirlenmiştir. Öncelikle; 20, 50 ve 100 ng/μl eDNA (hücre dışı DNA) ve gDNA (genomik DNA) ilave edilmiş ortamlarda 24 ve 48 saat süresince geliştirilen biyofilmlerin miktarsal tayinleri yapılarak her iki tip DNA'nın biyofilm oluşumu üzerindeki etkinliği saptanmıştır. Daha sonra ise aynı ortamlara eDNA ve gDNA'nın yanında çeşitli enzimler de ilave edilerek, bu ajanların biyofilm yapıları üzerine kombine etkileri tanımlanmıştır. Çalışmalar sonucunda, eDNA'nın ve gDNA'nın Enterokok biyofilmleri üzerine, suştan suşa ve inkübasyon süresine bağlı olarak değişen bir etkinlik gösterdiği tespit edilmiştir. Antibiyotik ve enzim çalışmalarında, kanamisin uygulamasının biyofilm miktarını artırdığı, nalidiksik asit uygulamasının herhangi bir etkinlik göstermediği, tetrasiklin ve ampisilin uygulamalarının ise biyofilm yapıları üzerinde düşük inhibisyon etkisine sahip olduğu belirlenmiştir. DNaz I ve Benzonaz® enzimlerinin antibiyotiklerle birlikte kombine edilerek kullanımı, antibiyotiklerin genel etkinlik biçiminde önemli bir değişime yol açmamıştır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, it was aimed to define the role of eDNA (extracellular DNA) in the production of biofilms of 4 strains belong to Enterococcus faecalis (74, 114, ATCC 29212 and ATCC OG1RF), a Gram positive opportunistic pathogen and to determine the possibilities of using enzymes and antibiotics in combating with this pathogen on abiotic surfaces. It was determined that the highest level of eDNA production, in all the strains used in the experiments, was performed after 24 hours incubation. Firstly; quantitative determination of the biofilms developed in 24 and 48 hours in media supplemented with 20, 50 and 100 ng /μl eDNA and gDNA (genomic DNA) was performed to determine the activity of both types of DNA on biofilm formation. Then, various enzymes were added to the same media along with eDNA and gDNA, and the combined effects of these agents on biofilm structures were defined. The results of the study indicated that eDNA and gDNA showed an altered activity on enterococci biofilms depending on strain diversity and incubation time. In antibiotic and enzyme studies, it was determined that the application of kanamycin increased the amount of biofilm, nalidixic acid application did not show any activity, while tetracycline and ampicillin had a low inhibitory effect on biofilm structures. The combined use of DNaz I and Benzonase® enzymes with antibiotics did not cause a significant change in the overall effectiveness of antibiotics.
Benzer Tezler
- İmidazolyum bazlı iyonik sıvıların antimikrobiyal potansiyellerinin incelenmesi
Investigation of the antimicrobial potential of imidazolium-based ionic liquids
ALİ NİYAZİ DUMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA YURT ONARAN
- Farklı biyofilmler içeren kök kanallarında şekillendirilmesi esnasında apikalden taşan bakteri miktarlarının belirlenmesi
Determination of the amount of bacteria extruded apically during the shaping of root canals containing different biofilms
ŞEYMA NUR PEKTAŞ İNAL
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2025
Diş HekimliğiAkdeniz ÜniversitesiEndodonti Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KÜRŞAT ER
- Peynir ve kan kökenli Enterococcus faecalis suşlarının biyofilm üretiminin engellenmesi ve eradikasyonunda nisin bakteriyosininin kullanım olanaklarının belirlenmesi
Determination of the potential usage of bacteriocin nisin to inhibit biofilm formation and eradication of mature biofilms of Enterococcus faecalis strains originated from cheese and blood samples
İREM ABAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NEFİSE AKÇELİK
- Dentin diskleri üzerinde oluşturulan enterococcus faecalis biyofilm modeli kullanılarak sodyum hipoklorit, setrimid ve glycrrhiza glabra l. ekstraktının antimikrobiyal etkinliğinin değerlendirilmesi
Evaluation of the antimicrobial efficacy of sodium hypochlorite, cetrimide and glycyrrhiza glabra l. extract on enterococcus faecalis biofilms formed on dentin disks
HİLMİ EGEMEN GÜLDAŞ
Doktora
Türkçe
2014
Diş HekimliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiEndodonti Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE DİLJİN KEÇECİ
- Potassium iodide potentiated photodynamic inactivation of enterococcus faecalis using toluidine blue: Comparative analysis, photothermal effect, and post-treatment biofilm formation study
Entereococcus faecalis'ın toluidin bluekullanılarak potasyum iyodür ile dozuarttırılmıs fotodinamik inaktivasyonu: Karşılaştırmalı analiz, fototermal etki ve uygulama sorası biyofilm olusumununincelenmesı
SAHAND AYATALLAH GHAFFARI
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyomühendislikBoğaziçi ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT GÜLSOY