Kandan izole edilen enterecoccus türlerinde biyofilm oluşumunun fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Biofilm formation of enterococcus species isolated from the blood to be investigated by phenotypic and genotypic methods
- Tez No: 532698
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ KEMAL BİLGİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Tıbbi Biyoloji, Microbiology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, biyofilm, esp, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, biofilm, esp
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
Amaç: Çalışmamızda, Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium türlerinin vankomisin direnç durumlarının belirlenmesi ve biyofilm oluşumu ile ilişkili olduğu düşünülen esp gen varlığının polimeraz zincir reaksiyonu ile, genel biyofilm oluşturma kapasitelerinin de fenotipik yöntemlerle araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Çalışmaya kan kültüründen izole edilen toplam 170 adet Enterococcus izolatı dahil edilmiştir. Türlerin tanımlanması, konvansiyonel ve otomatize yöntemler kullanılarak yapılmıştır. İzolatların vankomisin duyarlılıkları, Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle belirlenmiştir. Tüp ve Mikrotitrasyon plak yöntemleri kullanılarak biyofilm oluşumu fenotipik olarak değerlendirilmiştir. Tüm izolatlarda, PZR yöntemi ile, biyofilmle ilişkili esp geninin varlığı incelenmiştir. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen suşların vankomisin duyarlılıkları incelendiğinde, E. faecalis izolatlarının 14 tanesi (%16,5) orta duyarlı, 1 tanesi (%1,2) dirençli; E. faecium izolatlarının ise 29 tanesi (%34,1) dirençli olarak bulunmuştur. Tüp yöntemi ile 5 suşun (%5,9) biyofilm oluşturduğu görülmüştür. Mikrotitrasyon plak yöntemi ile ise 27 suş (%31,8) pozitif olarak tespit edildi. Her iki fenotipik yöntemde de pozitif olan suşların tamamının E. faecalis olduğu görülmüştür. PZR işleminin sonucunda 49 (%57,6) E. faecalis, 20 (%23,5) E. faecium suşunda esp varlığı saptanmıştır. Sonuç: Bu sonuçlara göre E. faecalis izolatlarının biyofilm oluşumu kapasitelerinin E. faecium'a göre daha fazla olduğu düşünülmektedir. Ayrıca esp geninin biyofilm oluşumu ile ilgisi olabileceği ancak tek başına esp varlığının biyofilm oluşumu için yeterli olamayacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Aim: In our study, it was aimed to determine the vancomycin resistance status Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium species and to studied on presence of esp gene which is thought to be related to general biofilm formation capacity with polymerase chain reaction and and general biofilm formation capacity by phenotypic methods. Material and Method: A total of 170 Enterococcus spp. isolates that were isolated from blood culture were included in the study. Species identification was performed using conventional and automated methods. Vancomycin susceptibilities of isolates were determined by Kirby-Bauer disk diffusion method. Biofilm formation was evaluated phenotypically by using Tube and Microtitration plate methods. In all isolates, the presence of esp gene which is associated biofilms was investigated by PCR method. Results: When the vancomycin susceptibilities of the strains included in the study were examined, it was found that 14 of the E. faecalis isolates (16.5%) were susceptible and 1 of them was (1.2%) resistant. And 29 (34.1%) of E. faecium isolates were found to be resistant. It was determines that 5 strains (5.9%) formed biofilm by tube method. By Microtiter plate method, 27 (31.8%) tested strains were determined positive for biofilm formation. All strains that were positive in both phenotypic methods were found to be E. faecalis. And 49 (57.6%) E. faecalis and 20 (23.5%) E. faecium strains were found positive esp. Conclusion: According to these results, E. faecalis isolates are thought to have higher biofilm formation capacity than E. faecium. Furthermore, it is thought that the esp gene may be related to biofilm formation but the presence of esp alone is not sufficient for biofilm formation.
Benzer Tezler
- Isparta bölgesinde enterokok türlerinde glikopeptid ve yüksek düzey aminoglikozid direncinin araştırılması ve antibiyotik duyarlılık testlerinin karşılaştırılması
The investigation of glycopeptide and high-level aminoglycoside resistance in enterococcus species in Isparta region and the comparison of the antibiotic sensitivity tests
MÜMTAZ CEM ŞİRİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALİ KUDRET ADİLOĞLU
- Febril nötropenik hastalarda üretilen etkenlerin dağılımı ve direnç durumu
The Distribution and resistance patterns of microorganism isolated from patients with febrile neutropenia
ÖZLEM ACİCBE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2001
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. FEHMİ TABAK
- Gentamisine farklı düzeyde duyarlılık gösteren enterokoklar üzerine ampisilin ve gentamisinin in vitro sinerjistik etkisinin araştırılması
In Vitro synergistic effect of gentamicin and ampicillin on enterococci with differing sensitivity to gentamicin
KEZİBAN FARSAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. BÜLENT SÜMERKAN
- Deneysel peritonit modelinde doku plazminojen aktivatörleri ve probiyotiklerin etkisi
Effects of tissue plasminogen activators and probiotics in experimentally induced peritonitis
BAŞAK ERGİNEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Çocuk Cerrahisiİstanbul ÜniversitesiÇocuk Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. F. TANSU SALMAN
- Kandan izole edilen kandida türleri ve antifungal duyarlılıkları
The candida species isolated from blood and antifungal Susceptibility
VESİLE TUBA BALABAN ERAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
MikrobiyolojiCelal Bayar ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KENAN DEĞERLİ