PTRE / tet off plazmit sistemine oksijen bağımlı yıkım bölgesi eklenerek hipoksik şartlara bağımlı çalışan vektör sisteminin tasarlanması ve iskemik şartlardaki karakterizasyonunun yapılması
Designing a vector system that works in hypoxic conditions by adding oxygen dependent degradation (ODD) domain to ptre / tet-off plasmid system and chacterization of the system in ischemic conditions
- Tez No: 535016
- Danışmanlar: DOÇ. GÜLAY GÜLEÇ CEYLAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biology, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 140
Özet
İskemi, dokulara giden kan akımının kesilerek dokuda hücresel metabolizma için gerekli olan oksijen ve glikoz desteğinin ortadan kalkmasıdır. İskemik semptomlar belirgin olmadığı için hastalar zamanında gerekli tedaviyi alamamaktadır. Yapılan bu çalışmada, iskemi hasarlarına karşı etkin bir tedavi geliştirilmesi adına, hipoksi durumunda hedef terapötik protein regülasyonunu tetikleyecek bir gen terapi sistemi geliştirilmesi amaçlanmıştır. HIF-1α hücre içinde oksijen homeostazisi düzenlenmesinde görev alan temel bir transkripsiyon faktörüdür. Hipoksi durumunda, oksijen bağımlı hidroksillenme azaldığı için hücre içi miktarı artar. Bu vasfı, ODD bölgesinin varlığından kazanır. ODD bölgesini, TetR-VP16 transaktivatör proteini ile hibrit hale getirip yeni bir gen sistemi oluşturmak tezin temelini oluşturmaktadır. Bu gen sistemi, transaktivatör ve reportör iki plazmitten oluşmaktadır. Bir plazmitten sürekli olarak kimerik TET-ODD proteini üretilirken, sadece hipoksik durumda hücre içinde stabil kalan TET-ODD transkripsiyon faktörü hedef terapötik gen ekspresyonunu başlatacaktır. Yapılan deneylerde, tasarlanan ODD bağımlı gen sisteminden hipoksik şartlarda hedef protein ekspresyonunda 4 kata kadar artış izlendi (n=3, p
Özet (Çeviri)
Tissue hypoxia, or ischemia, is the condition that describes the poor conveyance of oxygen and other vital products to tissues and organs. Ischemia progress silently, patients miss timely and proper treatments. In order to provide cardiovascular protection against ischemia and reperfusion, we are developing a vigilant gene therapy system whose expression level can be automatically up regulated by hypoxic ischemia. HIF-1α is a transcription factor that functions as a master regulator of oxygen homeostasis. HIF-1α protein levels increase under hypoxic conditions because of decreased O2 dependent prolyl-hydroxylation. ODD domain of HIF-1α was used as a switch to turn on the target gene expression in response to hypoxic signal. This hypoxia inducible plasmid system is a double plasmid system: transactivator plasmid and reporter plasmid. Chimeric transcription factor (TET-ODD) is being produced constantly from transactivator plasmid. In hypoxic condition, TET-ODD can stay stabilized in the cell and triggers expression of target gene. Our experiments showed that the ODD-mediated expression could quickly increase 4 fold within 6 hours of hypoxia (n=3) (p
Benzer Tezler
- Farede spermatogenez boyunca metilasyon imprintlerinin meydana getirilmesinde Boris geninin rolü
The role of the Boris gene in generation of methylation imprints during mouse spermatogenesis
GÜLER LEYLA SATI
Doktora
Türkçe
2011
GenetikAkdeniz ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DR. JAMES MCGRATH
PROF. DR. RAMAZAN DEMIR
- Investigation of PTP1B activation mechanism by computational methods
PTP1B aktivasyon mekanizmasının hesapsal yollarla incelenmesi
BURCU ÖZKARAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyomühendislikBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. BURAK ALAKENT
YRD. DOÇ. ELİF ÖZKIRIMLI ÖLMEZ
- Gıda katkı maddelerinden tartrazin, sunset sarısı ve allura kırmızısı azo boyar maddelerinin elektrokimyasal tayinleri
Electrochemical determination of food additives tartrazine, sunset yellow and allura red azo dyes
SELEN URUÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
KimyaYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YÜCEL ŞAHİN
DR. ÖZGE GÖRDÜK
- Design and development of Pt-based trimetallic WGS catalysts
Pt-bazlı üç metalli su-gaz değişimi (WGS) reaksiyonu katalizörlerinin tasarlanması ve geliştirilmesi
ÖZGÜ ÖZER
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Kimya MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ERHAN AKSOYLU
- An experimental study on optimization of Pt-based trimetallic WGS catalysts
Pt-bazlı üç metalli WGS katalizörlerinin optimizasyonu üzerine deneysel çalışma
BAHAR KESİM
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Kimya MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ERHAN AKSOYLU