Geri Dön

AGO2 proteininin saflaştırılması ve mikro RNA etkileşimlerinin incelenmesi

Purification of AGO2 protein and investigation of micro RNA interactions

PDF İndir

  1. Tez No: 535406
  2. Yazar: SERCAN GÜZEL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ARZU ERSÖZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Anadolu Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada; RNA interferansı efektör proteini olarak bilinen Argonat 2 (AGO2) proteininin immunoafinite saflaştırılması ve AGO2 proteini içeren nanoprotein partiküller hazırlanarak, hazırlanan bu nanoprotein partiküllerin mikro RNA (miRNA) bağlanma etkinliklerinin kantitatif olarak belirlenmesi amaçlanmıştır. Bunun için ilk aşamada, fotosensitif rutenyum tabanlı amino asit monomeri, bis(2-2ʹ-bipiridil)(MATrp)2-rutenyum (II) kullanılarak ANADOLUCA metoduna göre poli(HEMA-ko-anti-AGO2) kriyojeli sentezlenmiş ve SEM, FT-IR ve su tutma kapasitesi testi ile karakterize edilmiştir. Daha sonra; sentezlenen bu kriyojel kolon ile AGO2 proteini, sığır karaciğeri sitoplazma ekstraktından tek adımda immunoafinite yoluyla saflaştırılmıştır. Saflaştırılan örneğin moleküler ağırlığı ve saflığının belirlenmesi için SDS-PAGE metodu; örnek içerisindeki AGO2 proteininin varlığını net olarak belirlemek için ise EMSA metodu kullanılmıştır. En son aşamada; AGO2 bazlı nano blok polimerler fotosensitif mikroemülsiyon polimerizasyonu metodu kullanılarak hazırlanmış ve hazırlanan bu partiküller SEM ve zeta ile karakterize edilip ticari miR-335' e bağlanma afiniteleri belirlenmiştir. Sonuç olarak, miR-335' in AGO2 partiküllerine yüksek bir afinite ile bağlandığı belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, immunoaffinity purification of Argonaute 2 (AGO2) protein, known as RNA interference effector protein, preparation of nanoprotein particles having AGO2 protein and determination of micro RNA (miRNA) binding activities of these prepared nanoprotein particles have been aimed. In the first step, poly(HEMA-co-anti-AGO2) cryogel has been synthesized using photosensitive ruthenium- based amino acid monomer, bis(2-2ʹ-bipyridyl)(MATrp)2-ruthenium (II) according to ANADOLUCA method and characterized by FT-IR, SEM and water retention capacity test. Then, AGO2 protein has been purified via immunoaffinity chromatography from bovine liver cytoplasmic extract in a single step using this prepared cryogel. SDS- PAGE method has been used to determine the molecular weight and purity of this purified sample. The EMSA method has been used to exact determination of the presence of AGO2 protein in the purified sample. At the last stage, AGO2-based nano block polymers have been prepared using photosensitive microemulsion polymerization method. This prepared particles have been characterized by SEM and Zeta-Sizer and the binding affinities to commercial miR-335 have been determined. As a result, it has been determined that miR-335 has bound to AGO2 particles with a high affinity.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    482336

    Development of novel superparamagnetic iron oxide based theranostic nanoparticles

    Demir oksit bazlı özgün teranostik nanoparçacıkların geliştirilmesi

    ÖZLEM ÜNAL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    KimyaKoç Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAVVA YAĞCI ACAR

  2. Tez No

    495372

    Isolation, purification myelin basic protein (MBP) and generation specific antibodies against its

    Temel miyelin proteininin (MBP) izolasyonu pürifikasyonu ve bu proteine karşı spesifik antikorların oluşturulması

    AZEEZA KHEDER YOUSIF YOUSIF

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyolojiBingöl Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VIKTOR NEDZVETSKYI

  3. Tez No

    667933

    Turning the spotlight on a long-overlooked pathway: molecular dynamics investigation of ras family members with RalGDS

    Başlık çevirisi yok

    KAYRA KÖSOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyofizikKoç Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEHRA ÖZLEM KESKİN ÖZKAYA

  4. Tez No

    550858

    Yoğun bakımda takip edilen travmatik beyin hasarlı hastalarda mikroRNA biyogenezinde yer alan komponentlerin ekspresyon düzeylerinin prognozla ilişkisi

    The relationship between prognosis of expression levels of components in microrna biogenesis in patients with traumatic brain injury in intensive care

    AYŞE ÇABUKUSTA ACAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Anestezi ve ReanimasyonAkdeniz Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SUAT HAYRİ SANLI

  5. Tez No

    911784

    Koyunlarda Meloksikamın Plazma ve Süt Dağılımına Enrofloksasinin Etkisi

    The effect of enrofloxacin on plasma and milk distribution of meloxicam in sheep

    AHMET IŞIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUAMMER ELMAS

Geri Dön