Geri Dön

Potent inhibitors designed for methionine aminopeptidase II using pharmocophore modeling

Başlık çevirisi mevcut değil.

PDF İndir

  1. Tez No: 536306
  2. Yazar: SAFANAH A. AL BAYATI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Kadir Has Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 68

Özet

Metaloenzimlerden Metiyonin Aminopeptidazlar (MetAP2), yeni sentezlenmiş polipep-titlerin başından metionin amino asidini kesmekle sorumludur. MetAP2'nin seçimli olarak engellenmesi damar oluşumunu baskıladığını, katı tümörlerde tümör boyunu ve metastazı sınırlandırdığı gösterilmiştir. Romatizma, kanser v.b. gibi tedavisi zor hastalıklarla direkt ilgili olduğu bulunmuştur. Araştırmacılar uzun süredir bu enzimi inhibe eden ilaçlar üzerine çalışmaktadır. Fumagillin MetAP2'nin doğal geri dönüşümsüz inhibitörüdür. Fumagillin ve yarı sentetik analogları potansiyel ilaç olarak umut vaat etmelerine karşı farmakokinetik ve nörotoksik özelliklerinden dolayı FDA'dan klinik deneyler için izin alamamıştır. Bu çalışmada, Zinc15 ve Ulusal Kanser Enstitüsü (NCI) veri bankalarından MatAP2'nin potansiyel ve tok- sik olmayan inhibitörleri in silico tarama, ligand ve yapı bazlı farmakofor modelleme yöntemleri ile elde edilmiştir. PyRx ve Doklama işlemleri ile uygulanarak aralarından daha isabetli ilaç adayları seçilmiştir. Discovery Studio (2016)'nın ADMET protokolü adayların farmakokinetik özelliklerini tespiti için kullanılmıştır. Bulunan bu adaylar MetAP2 enzimine potansiyel inhibitör olabilecekleri ve farmkokinetik özelliklerinin Fumagillian'dan daha iyi oldukları bulunmuştur. Bulunan bu moleküller biyolojik testler için ve tedavisi zor kanser ve bu gibi hastalıklara karşı çok iyi potansiyel ilaç adayları olacağı görüşüne varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Methionine Aminopeptidase (Metap2) is a metalloenzyme that is responsible of removing of the N-terminal of newly synthesized protein. The inhibition of the enzyme was found to be crucial in diminishing tumor's nourishment, growth, and metastasis. It is directly related to incurable diseases such as Cancer, Rheumatoid Arthritis, etc. Over the year, different compounds were developed to inhibit that enzyme. Fumagillin, a natural irreversible inhibitor of MetAP2 and its derivatives, has been showing great potential therapy, however, their toxicity and poor pharmacokinetic characteristics have forbidden them from passing clinical trial and FDA approval. In this research, an in-silico approach was conducted to obtain a compound that is capable of inhibiting the enzyme with non-toxic properties. Two different approaches were conducted using a pharmacophore modeling; Ligand-Based, and Structure-Based. The Zinc15 and National Institute of Cancer Data (NCI) Databases was screened to obtain diversity of pre-synthesized compound. Followed by Molecular Docking filtration process using PyRx, and Autodock4. Followed by Discovery Studios protocol called ADMET prediction to signify the ability of these compound to pass the blood barriers and demonstrate batter pharmacokinetics properties than the Fumagillian. These compounds will serve, as Great Drug Candidate for the biological test in our continuous war against cancer and others Incurable disease.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    636315

    Sanal tarama ve çok boyutlu moleküler modelleme yöntemleri ile p53-MDM2 potansiyel inhibitörlerinin belirlenmesi

    Identification of p53-MDM2 potential inhibitors with virtual screening and multidimensional molecular modeling methods

    GÜLŞAH AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MİNE YURTSEVER

    PROF. DR. SERDAR DURDAĞI

  2. Tez No

    504267

    In silico screening of potent HIV-1 integrase inhibitors for the treatment of human immunodeficiency virus (HIV)

    İnsan immünyetmezlik virüsü (HIV) tedavisine yönelik in silico taramayla potansiyel integraz inhibitörlerinin bulunması

    AUGUSTINE S. SAMORLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Tıbbi BiyolojiKadir Has Üniversitesi

    Biyoinformatik ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ

  3. Tez No

    524346

    Structure prediction of eukaryotic elongation factor 2 kinase (eEF-2K) and elucidation of binding mechanisms of its novel compounds with molecular modelling applications

    Moleküler modelleme uygulamaları ile ökaryotik uzama faktör 2 kinaz (EEF-2k) enziminin yapı tahmini ve yeni bileşikleri ile bağlanma mekanizmasının aydınlatılması

    GİZEM TATAR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    BiyokimyaGaziantep Üniversitesi

    Biyoenformatik ve Bilişimsel Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TUĞBA TAŞKIN TOK

  4. Tez No

    803964

    Synthesis of some new pyrrole derivatives and investigation of their biological effects

    Yeni bazi pirol türevlerinin sentezi ve biyolojik etkilerinin incelenmesi

    SHORUQ A O NAJI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu Üniversitesi

    Farmasötik Bilimler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET ÇAĞRI KARABURUN

  5. Tez No

    301415

    Bir grup açilaminoalkanamit bileşiğinin sentezi ve biyoaktivitelerinin araştırılması

    Synthesis and bioactivity ınvestigation on a group of acylaminoalkanamide derivatives

    GÜNEŞ ÇOBAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Eczacılık ve FarmakolojiEge Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VAROL PABUÇCUOĞLU

Geri Dön