Hıyarda (Cucumis sativus L.) tohum iriliği ile düşük sıcaklıkta çimlenme yeteneğinin karşılıklı melezleme ve genomik bağlantı analizleriyle qtl haritalanması
Qtl mapping of seed size and cold germination ability in cucumber (Cucumis sativus L.) through biparental linkage analysis and genome-wide association analysis
- Tez No: 542150
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞEKÜRE ŞEBNEM ELLİALTIOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 251
Özet
Hıyar tropik orijinli, çimlenme yönünden düşük sıcaklıklara hassas bir sebzedir. Yapılan bu çalışma hıyarda düşük sıcaklıkta çimlenme yeteneği (CG) ve tohum iriliği özelliği olan; tohum uzunluğu (SL), tohum genişliği (SWI), 100 tohum ağırlığı ile ilgili QTL haritalama çalışması olup iki kısımdan oluşmaktadır. Çalışma düşük sıcaklıklarda çimlenme yeteneğine ve iri tohum özelliğine sahip olan Coolgreen ile düşük sıcaklıklarda çimlenme özelliğine sahip olmayan ve küçük tohumlu 7088D ebeveynlerinden elde edilen 135 adet RIL populasyonunda yapılmıştır. Düşük sıcaklıkta çimlenme özelliği 13 °C'de 10 gün boyunca karanlık ortamda çimlendirilerek elde edilmiştir. Tohum özellikleri ile ilgili veriler GiNA yazılımı ile elde edilmiştir. Düşük sıcaklıkta çimlenme oranı ile ilgili sırasıyla kromozom 1, 2 ve 4'te qCG1.1, qCG2.1 ve qCG4.1 QTL gen bölgeleri tespit edilmiştir. Farklı yıl ve çevre koşullarında yetiştirilen populasyonlardan elde edilen sonuçlara göre toplam fenotipik varyasyonun açıklanma oranı % 23.3-40.3 arasında bulunmuştur. qCG1.1 düşük sıcaklıkta çimlenme yüzdesi ile ilgili ana QTL gen bölgesi olarak belirlenmiştir. Tohum uzunluğu, genişliği ve 100 tohum ağırlığı ile ilgili kromozom 3 ve 5'te qSL3.2, qSL5.1, qSL5.2, qSWI3.2, qSWI5.1, qSWI5.2, qSWE3.2, qSWE5.1 ve qSWE5.2 ana QTL gen bölgeleri olarak tespit edilmiştir. Farklı yıl ve çevre koşullarında yetiştirilen populasyonlardan elde edilen 3. ve 5. kromozomdaki QTL'lerin toplam fenotipik varyasyonu açıklama oranı qSL % 23.4-60.6, qSWI % 33.9-51.5 ve qSWE % 26.5-57.7 olarak bulunmuştur. Her özellik için tespit edilen QTL'lerin alanı, 602 adet F2:3 populasyonundan ilgili geni taşıdığı düşünülen rekombinant bireyler seçilerek daraltılmıştır. Bu çalışma sonunda her özelliği kontrol eden gen bölgelerinin tespiti markır destekli seleksiyon ile ıslah çalışmalarında etkili olarak kullanılabilecektir.
Özet (Çeviri)
Cucumber is of tropical origin and sensitive to low temperature for germination. This study is composed of two parts. First part is related to cold germination ability (CG). Second part includes seed size related traits which are 100 seed weight (SWE), seed length (SL), seed width (SWI). This study, was conducted QTL analysis for CG ability using a recombinant inbred line (RIL) population derived from the cross between the CG tolerant and large seeded variety Coolgreen, the cold sensitive and small seeded line 7088D. Both phenotypic data were collected from 135 RILs in five environments which were used in QTL analysis. Phenotypic data on CG ability in terms of germination rate were obtained at 13 °C during 10 days in dark condition. Data related to seed traits were obtained with GiNA, high throughput method. Three QTL, qCG1.1, qCG2.1 and qCG4.1 on chromosomes 1, 2 and 4 were consistently detected across multiple environments, which could explain 23.3 to 40.3 % of observed total phenotypic variance. Major QTLs were detected for all seed size traits which are qSL3.2, qSL5.1, qSL5.2, qSWI3.2, qSWI5.1, qSWI5.2, qSWE3.2, qSWE5.1 and qSWE5.2 on chromosomes 3 and 5 were consistently detected across multiple environments, which could explain for qSL 23.4 to 60.6 %, qSWI 33.9 to 51.5 %, qSWE 26.5 to 57.7% observed total phenotypic variance. QTL regions for all traits were narrowed down, choosing recombinant individuals having related genes from 602 F2:3 families. In conclusion, related genes for all traits can be detected marker-assisted selection in breeding.
Benzer Tezler
- F1 hıyar (Cucumis sativus L.) tohum üretiminde meyve saysı ile tohum miktarı ve kalitesi arasındaki ilişkiler
The relationship between fruit number and seed quality and quantity in F1 Cucumber seed production
ESRA CEBECİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HÜSEYİN PADEM
- Hıyarda (Cucumis sativus L.) örtüaltı yetiştiriciliğine uygun hibrit çeşit ıslahında morfolojik karakterizasyon, hibrit kombinasyonları ile hibrit tohum verim ve kalitesinin belirlenmesi
Morphologic characterization in hybrid greenhouse cucumber (Cucumis sativus L.) breeding and determination of appropriate hybrid combinations and hybrid seed quality
VOLKAN GÖZEN
- Hıyarda (Cucumis sativus L.) kabak sarı mozayik virüsü (ZYMV)'ne karşı dayanıklılığı kontrol eden genle bağlantılı moleküler işaretleyicilerin belirlenmesi
Determination of molecular markers linked to the resistancy control gene towards zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) in cucumber (Cucumis sativus L.)
HASAN ÖZGÜR ŞIĞVA
- Hıyar (Cucumis sativus l.) genotiplerinin önemli hastalıklara dayanıklılık durumlarının moleküler yöntemlerle belirlenmesi ve double haploid tekniğinin optimizasyonu
Determination of resistance to important diseases of some cucumber (Cucumis sativus l.) genotypes by molecular methods and optimization of double haploid technique
MAMOUDOU ZONON
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE İKTEN
- Ceviz yapraklarından mevsimsel olarak elde edilen özütlerin tohum çimlenmesine etkileri
The effects of walnut leaf extracts depend on seasonal changes on seed germination
ESMA MERT
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
BiyolojiDumlupınar ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL KOCAÇALIŞKAN