Geri Dön

Prostat patogenezinde yeni aday genlerin in silico belirlenmesi ve analizi

In silico determinaton of candidate genes related to the pathogenesis of prostate diseases and their analyses

PDF İndir

  1. Tez No: 543035
  2. Yazar: HİKMET KÖSEOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE NUR BUYRU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Üroloji, Genetics, Molecular Medicine, Urology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 128

Özet

Amaç: In silico ön değerlendirme neticesinde çalışmamızda prostat patogenezinde PRKACA ve STK11 ifade düzeylerinin saptanması ve klinik parametreler ile ilişkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Ocak 2016 ve Haziran 2017 arası ameliyat olan selim prostat hiperplazili ve lokalize prostat kanserli 60'şar hasta çalışmaya alındı. Hastaların normal ve patolojik taze prostat dokularından STK11 ve PRKACA ifade analizi yapıldı. Bulgular: 60 adet selim prostat hiperplazisi hastası dokusundan 50'sinde, 60 lokalize prostat kanseri hastası dokusundan 57'sinde kontrol gen, STK11 ve PRKACA ifadeleri elde edilebildi. STK11 ifadesi hem selim prostat hiperplazisi hem de prostat kanserin benzer yaklaşık %60 oranında artmış olarak saptanırken PRKACA gen ifadesinde benzer yaklaşık %60 oranında azalma saptanmıştır. Gen ifadeleri arasında ilişki saptanmadı. Büyük prostat hacimlerinde PRKACA gen ifadesi anlamlı olarak artmış olarak saptandı (p=0,01) ve tersine STK11 gen ifadesi ise anlamlı olarak azalmış (p=0,046) saptandı. Tüm prostat hastalarındaki ortak labaratuar, prostat ölçümleri, klinik değerlendirmeler, gen ifade değerleri, qPCR parametreleri kanser tanısı öngörmedeki etkinlikleri ROC analizleri ile değerlendirildi. PSA Dansitesi/ Ct (STK11) {AUC=0,895 p=0,001 (%95 CI 0,836-0,953)} ve PSA Dansitesi*[Ct(PKA)/Ct(STK11)] {AUC=0,893 p

Özet (Çeviri)

Objective: Candidate genes functioning in prostate cancer-associated pathways were pre-determined by in silico analyses. PRKACA and STK11 genes were investigated to determine their correlation with prostatic diseases and clinical parameters. Methods: Two groups of sixty patients operated for benign prostatic hyperplasia (BPH) or clinically localized prostate cancer between January 2016 and June 2017, were included in study. Gene expression analyses of both STK11 and PRKACA were performed using both fresh normal and pathological prostate tissues from all patients. Results: Relevant gene expression could be determined in 50/60 of patients with BPH and 57/60 of patients with prostate cancer. STK11 gene expression was increased and PRKACA gene expression decreased in approximately 60% of both BPH and prostate cancer tissues. Regardless of pathology, a correlation between prostate volume and expression was noted for both genes. In larger prostates, PRKACA gene expression was significantly increased (p=0,01) while STK11 gene expression significantly decreased (p=0,046). With ROC analyses including clinical parameters, labaratory and qPCR parameters to predict prostate cancer, ratio of PSA Density/cycle threshold for STK11 {AUC=0,895 p=0,001) (95% CI 0,836-0,953)} was found to predict prostate cancer more effectively when compared to PSA density or PSA alone. Conclusions: Similar but inverse rates of changes in the expression of STK11 and PRKACA genes were observed for both BPH and prostate cancer. Expression of STK11 and PRKACA genes were correlated with the volume of the prostate. The ratio defined by the PSA Density/cycle threshold for STK11 gene was found as an effective parameter to predict prostate cancer. Keywords : Prostate, Adenocarcinoma, Benign Prostate Hyperplasia, STK11,PRKACA, Gene Expression

Benzer Tezler

  1. Tez No

    638609

    Alzheimer hastalığı ve kanser patogenezinde rol oynayan ortak aday moleküler biyobelirteçlerin ve anahtar yolakları ın siliko araştırılması

    Investigation of the common candidare molecular biomarkers and key pathways that play a role in the pathogenesis of alzheimer's disease and cancer

    ECEM BUSE YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DİLEK PİRİM

  2. Tez No

    810193

    Prostat kanserinde rol oynayan potansiyel mrna:mirna:lncrna' ların etkileşim ağının biyoinformatik analizler ile belirlenmesi

    Identification of potential mrnas:mirnas:lncrnas network involved in prostate cancer by bioinformatics analysis

    ÇAĞDAŞ AKTAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Bilim ve TeknolojiEge Üniversitesi

    Sağlık Biyoinformatiği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BUKET KOSOVA

  3. Tez No

    165466

    Prostat kanserinde STAMP2 geninin ekspresyonu

    Expression of STAMP2 in prostate cancer

    BORA İRER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    ÜrolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Üroloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. AYKUT KEFİ

  4. Tez No

    336802

    Prostat kanserli hastaların prostat sekresyon sıvılarından mirna eldesi ve mikroarray yöntemi ile miRNA ekspresyon profillerinin karşılaştırılması

    Identification of microRNAs differentially expressed in prostatic secretions of patients with Prostate Cancer

    ESRA GÜZEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Disiplinlerarası Bölümü

    PROF. DR. MUSTAFA ÖZEN

  5. Tez No

    474836

    CRİSPR/CAS9 ile FOXA1 geni knock-out edilen prostat kanseri hücrelerinde anti-kanserojen ajanların PI3K/AKT/MTOR sinyal yolağına etkileri

    Effects of anticancer agents in PI3K/AKT/MTOR signalling pathway on prostate cancer cells that foxa1 gene knocked out via CRİSPR/CAS9

    GÜLŞAH ALBAYRAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Tıbbi BiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ECE KONAÇ

Geri Dön