Prostat kanserli hastaların prostat sekresyon sıvılarından mirna eldesi ve mikroarray yöntemi ile miRNA ekspresyon profillerinin karşılaştırılması
Identification of microRNAs differentially expressed in prostatic secretions of patients with Prostate Cancer
- Tez No: 336802
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA ÖZEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Üroloji, Genetics, Urology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Disiplinlerarası Bölümü
- Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
Prostat kanseri (PKa), erkek üreme sistemine bağlı salgı bezi olan prostatta oluşan ve erkeklerde ölümle sonuçlanan en ciddi kanser türlerindendir. PKa, prostat hücreleri değişime uğradığında ve kontrol dışı çoğaldığında gelişir. İlerlemiş ve metaztatik tümörler için tedavi seçenekleri kısıtlı olduğundan yeni tanı araçlarına ihtiyaç duyulmaktadır. Orta yaş ve üzeri erkeklerde sık görülen prostat bezi hastalıklarından Benign Prostat Hiperplazi (BPH) ise, yaşa bağlı artan histolojik değişikliklerle ve prostat bezinin büyümesiyle karakterizedir. MikroRNA?lar (miRNA) kısa, yaklas?ık 18-24 nükleotid uzunlug?unda, kodlamayan, yeni kes?fedilmis? bir RNA çes?ididir. Gen ifadesi düzenlenmesinde görevli olan miRNA?ların PKa dahil birçok kanserin patogenezinde rol oynadığı gösterilmiştir. Bu çalışmada PKa ve BPH vakalarının birbirinden ayırdedilmesinde kullanılabilecek spesifik miRNA ifade değişimlerinin tespiti amaçlanmıştır. 23 PKa ve 25 BPH?lı hastadan prostat sekresyon sıvıları (PSS) toplanarak, miRNA profillemesi için 4 PKa ve 4 BPH örneğiyle mikrodizin çalışması yapıldı. Sonrasında, ifade değişimleri anlamlı olan miRNA?lardan dördü seçilerek kantitatif ters-transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PZR) yöntemiyle doğrulama çalışması gerçekleştirildi. İstatistiksel analizler Student?s t-test kullanılarak yapıldı ve ROC (Receiver Operating Curve) eğrileri SPSS-15.0 ile çizildi. Mikrodizin sonuçlarına göre PKa hastalarında BPH?lılara oranla miR-361-3p, -133b, ve -221?in ifade düzeylerinde anlamlı azalma, mir-203?te ise artış saptanmıştır. Bu miRNA?ların ifadelerindeki değişimler, 23 PKa ve 25 BPH hastasının PSS örnekleri kullanılarak qRT-PZR yöntemiyle doğrulanmıştır. Yapılan ROC analizi, BPH ve PKa?nın ayırdedilmesinde bu miRNA?ların prostat spesifik antijen?e (PSA) göre çok daha güçlü olduğunu göstermiştir. Sonuç olarak, PSS?de miRNA?ların varlığı literatürde ilk kez tarafımızdan gösterilmiştir. Prostat masajının rutin muayenede kolay uygulanabilir olması, bu noninvaziv yöntemi PKa tanısında güçlü bir aday yapmaktadır. Sonuçlarımız, PSS?de farklı eksprese olan miRNA?ların tanı belirteci olarak kullanılabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Prostate cancer (PCa) is one of the leading causes of cancer deaths in men and develops as a result of genetic/epigenetic alterations and uncontrolled cell proliferation. Since there are limited treatment options available for advanced/metastasized tumors, there is an urgent need for novel diagnostic tools for PCa. Benign Prostatic Hyperplasia (BPH) is a common prostate gland disease in middle-aged/old men and characterized by age-related histological changes and increased prostate gland growth. MicroRNAs (miRNAs), a newly discovered RNA type, are small, non-coding, and approximately 18-24 nucleotides in length. They are responsible for regulation of gene expression and are implicated in pathogenesis of many cancers, including PCa. In this study, we aimed to identify an miRNA expression signature that could be used to distinguish PCa from BPH. miRNA profiling of prostate secretion samples (PSS) of four BPH and four PCa patients, were performed using microarray. Then four of significantly deregulated miRNAs were further confirmed with quantitative reverse-transcription polimerase chain reaction (qRT-PCR) in PSS samples. Statistical analysis was performed using Student?s t-test. ROC curves were plotted with SPSS-15.0. Microarray profiling revealed that miR-361-3p, -133b, and -221 were downregulated and miR-203 was upregulated significantly in PSS of PCa patients. Further qRT-PCR analysis confirmed the altered expressions of these miRNAs in PSS of 23 PCa and 25 BPH patients. These miRNAs, together and individually have much power (AUC:0.950) than prostate specific antigen (PSA) has (AUC:0.463) to discriminate PCa from BPH patients. Consequently, we showed for the first time in the literature the presence of miRNAs in PSS. We suggest PSS as a powerful non-invasive source for prognosis evaluation in PCa, since prostate message can be easily applied during routine examination. Our results showed that certain differentially expressed miRNAs in PSS could be used as diagnostics markers.
Benzer Tezler
- Prostat spesifik antijen yüksekliği olan olgularda eksprese prostatik sekresyon kültürünün tanısal değeri
The diagnostic value of expressed prostatic secretion culture in patients with elevated prostate specific antigen level
YAŞAR CANDAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
ÜrolojiMustafa Kemal ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET NAMIK KİPER
- PSA'sı 4-10 ng/ml arasında olan hastalarda prostatik inflamasyon tespit ve tedavisinin PSA degişimine etkisi
The effect of diagnosis and treatment in prostatic inflammation in patients with PSA levels between 4 and 10 ng/ml on PSA change
ONUR KAYGISIZ
- Assessment of the effects of melatonin on the funtional deficits induced by cellular stress in obese donor derived mesenchymal STEM cells
Melatonin'in obez donor mezenkimal kök hücrelerinde hücresel strese bağlı olarak oluşan fonksiyon bozuklukları üzerindeki etkilerinin değerlendirilmesi
ECE GİZEM POLAT
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİMA SUSANNA FAUSTINA AERTS KAYA
- Prostat kanserli hastaların prostat iğne biyopsisinde saptanan tümöral odaklar ile GA-68 PSMA PET/BT'deki prostat tutulumunun karşılaştırılması
Comparison of tumoral foci in prostate needle biopsy of patients with prostate cancer and prostate involvement in GA-68 PSMA PT CT
SÜLEYMAN ÇANKAYA
- Benign prostat hiperplazisi ve prostat kanseri tanısı alan hastaların prostat dokularında mikoplazma DNA yapısının araştırılması
Investigation of mycoplasma DNA structure in prostate tissues of patients who have benign prostate hyperplasia and prostate cancer diagnosis
MEHMET HANİFİ ÖZGÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
ÜrolojiGaziantep ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M. SAKIP ERTURHAN