Granüler kornea distrofili ailelerde TGFBI (transforme edici büyüme faktörü beta tarafından indüklenen) gen mutasyonların araştırılması
Investigation of TGFBI (transforming growth factor beta induced) gene mutations in Turkish families with granular corneal dystrophy
- Tez No: 543711
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HİLAL ARIKOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Granüler kornea distrofisi Tip 1, TGFBI geni, Türk populasyonu, Granular corneal dystrophy type 1, TGFBI gene, Turkish population
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Granüler kornea distrofisi'nin (GCD) karakteristik özellikleri kornea stromasında yerleşim gösteren küçük, ayrık, keskin kenarlı, grimsi beyaz opasitelerdir. GCD'nin gelişiminden sorumlu tutulan genler içinde en kuvvetli ilişkilendirilen gen TGFBI (Transforme edici büyüme faktörü beta tarafından indüklenen) genidir. Yapılan çalışmalar kromozom 5q31.1 lokusunda yer alan TGFBI geninin ekzon 4 ve ekzon 12 bölgelerinde sırasıyla R124H ve R555W değişimlerinin GCD gelişimine yol açan sıcak nokta mutasyonları olduğunu göstermektedir. Ancak farklı etnik gruplarda probandların yaş ve cinsiyetlerindeki farklılıkların yanı sıra distrofilere sebep olan TGFBI mutasyonlarının da farklılık gösterdiği görülmüştür. Bu çalışmada GCD Türk ailelerde TGFBI geninde ekzon 4 ve 12 bölgelerinde yer alan iki sıcak nokta mutasyonunun ve varsa proteinde önemli işlevsel bölgeleri kodlayan bu ekzon bölgelerindeki başka mutasyonların araştırılması ve belirlenen mutasyonların hastalıkla ve ilgili fenotiplerle ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Çalışmamıza, Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Göz Hastalıkları Anabilim Dalına başvuran ve GCD1tanısı alan 16 hasta ile bu bireylerin aile ağaçlarından belirlenen 11 sağlıklı birey ve bu ailelerle akraba olmayan 28 sağlıklı birey dahil edildi. Bireylerin ön segment fotoğraflarında birikintilerin özellikleri ve derinlikleri değerlendirildi. Her bir bireyden alınan periferik kan örneklerinden DNA elde edildi ve PZR (Polimeraz Zincir Yöntemi) tekniği ile hedef gen bölgeleri çoğaltıldı. Genotipleme çalışmaları Dizi Analizi yöntemiyle gerçekleştirildi. Çalışmamızda, GCD1 tanısı alan bireylerde TGFBI geninin ekzon 4 R124S mutasyonu belirlenmedi. Ancak GCD1 tanısı alan tüm bireylerde TGFBI geninin ekzon 12 bölgesinde R555W mutasyonu heterozigot olarak tespit edildi. Ayrıca çalışmamızda sessiz bir mutasyon olan F540F değişimi ve intronik bölgede c.32924G>A değişimi tespit edildi. Bulgularımız, TGFBI geninin ekzon 12 bölgesinde yer alan bir sıcak nokta mutasyonu olan R555W mutasyonunun GCD1 ile literatürde rapor edilen ilişkisini kuvvetli şekilde desteklemektedir.
Özet (Çeviri)
Granular corneal dystrophies (GCD) are characterized by small, discrete, sharp-edged, grayish-white opacities in the corneal stroma. Among the genes responsible for the development of GCD, the most strongly related gene is TGFBI (Transforming growth factor beta induced). Studies show that R124H in exon4 and R555W in exon 12 are hot spot mutations in TGFBI gene, located in the 5q31.1 locus leading to GCD development. However, in the literature there are reports suggesting disease related mutations at different localization TGFBI gene as well as differences in age and gender of probands in different ethnic groups. In this study, we aimed to investigatetwo hot spot mutations in exon 4 and 12 regions and other possible different mutations at the same regions,coding important fuctional regions of the protein, in TGFBI gene in Turkish families with GCD and to determine the relationship between the mutations and disease and related phenotypes. In our study, 16 individuals diagnosed as GCD1 in Selcuk University Faculty of Medicine Department of Ophthalmology with 11 healthy individuals chosen from their family trees and 28 unrelated individuals were included. DNA was obtained from peripheral blood samples taken from each individual and PCR (Polymerase Chain Method) technique was used to amplify target gene regions. Genotyping studies were done by Sequence Analysis. The R124S mutation in exon 4 of TGFBI gene was not determined in individuals diagnosed as GCD1. However, in all individual diagnosed as GCD1,the R555W mutationin exon 12 of TGFBI gene was found as heterozygote genotype. In addition, we detected silent mutation F540Fin exon 12 and c.32924 G>A substitution in intronic region. Our study strongly supports the association of GCD1 with R555W mutation in exon 12 region of TGFBI gene as reported in the literature.
Benzer Tezler
- Kornea distrofilerinde keratoplasti sonuçları
Results of keratoplasty in corneal dystrophies
TAMER TAKMAZ
- Penetran keratoplasti (PK) ve derin ön lameller keratoplasti (DALK) ile tedavi edilen stromal distrofi olgularının uzun dönem sonuçlarının incelenmesi
Evaluation of long-term results of stromal dystrophy cases treated with penetrating keratoplasty (PK) and deep anterior lamellar keratoplasty (DALK)
SELVA ARSLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Göz Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN ŞEVKİ ARSLAN
- Granüler kornea distrofisi tip 1 hastalarının periferal kan mononükleer hücrelerinde TGFBI genindeki R555W mutasyonunun CRISPR/Cas9 teknolojisi ile düzenlenmesi
Editing of the R555W mutation in TGFBI gene in peripheral blood mononuclear cells of granular corneal dystrophy type 1 patıents using CRISPR/Cas9 technology
BURAK DAĞDELEN
Doktora
Türkçe
2024
Tıbbi BiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİLAL ARIKOĞLU
- TGFBI genindeki R555W mutasyonunun, CRISPR/Cas9 ile indüklenmiş homoloji yönelimli onarım tekniği kullanılarak oluşturulmasına yönelik gRNA, donör DNA tasarımı ve vektör dizaynı
Vector design with gRNA and donor dna design for the generation of R55W mutation in the TGFBI (transforming growth factor beta induced) gene by using CRISPR/Cas9 induced homology-directed repair technique
SEREN MIZRAK DANACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DUDU ERKOÇ KAYA
- CRISPR/Cas9 genom düzenleme aracı kullanarak TGFBI geninde R124H mutasyonu oluşturmaya yönelik gRNA ve donör DNA tasarlama ve dh5α vektörüne klonlama
Design of donor DNA sequences with gRNA for creating the R124H mutation in the TGFBI gene and creation of CRISPR/Cas9 structures
BÜŞRA KALDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HİLAL ARIKOĞLU