Marmara denizinde yayılış gösteren Aurelia aurita denizanası türünün moleküler filogenisi
Molecular phylogeny of Aurelia aurita jellyfish species in the sea of Marmara
- Tez No: 544112
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FİKRİYE POLAT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kocaeli Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
Bu çalışmada, Marmara Denizi sahillerinde yayılış gösteren Aurelia aurita denizanası türünün moleküler karakterizasyonunun belirlenmesi hedeflenmiştir. Ekim 2017- Şubat 2018 tarihleri arasında Marmara Denizi'nin kuzey ve güney sahillerinden 4 istasyon ve toplamda 28 denizanası örneği toplanarak, DNA izolasyonları yapılmıştır. Mitokondrial Sitokrom Oksidaz Altünite I (COI), 16S rDNA, nüklear 18S rDNA ve Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gen bölgeleri Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile amplifiye edildikten sonra DNA Dizi Analizi yapılmıştır. Elde edilen diziler Chromas (v.2.6.5.) programı ile FASTA formatında kaydedilip NCBI BLAST'a yüklenerek, veri bankasında kayıtlı diğer dizilerle benzerlikleri karşılaştırılmıştır. İlgili gen bölgelerine ait tüm diziler MEGA (v.7.0) programına yüklenerek modelleme yöntemleri ve mesafeleri belirlenmiştir. Bootstrap 1000'de filogenetik ağaçları oluşturulmuştur. Sonuç olarak, 18S rDNA geninin denizanası türlerini belirleme oranının düşük olmasına rağmen COI, 16S rDNA ve ITS1 genlerinin tür bazında ayırım gücünün yüksek olduğu bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
In this study, it was aimed to determine the molecular characterization of the Aurelia aurita jellyfish line which is spread in Marmara Sea coasts. Between October 2017 and February 2018, 4 station and totally 28 samples of jellyfish from the northern and southern coasts of the Sea of Marmara were collected and DNA isolations were made. DNA Sequence Analysis was performed after amplification with Polymerase Chain Reaction (PCR) by mitochondrial Cytochrome Oxidase Substrate I (COI), 16S rDNA, nuclear 18S rDNA and Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) gene region. The obtained sequences were recorded in FASTA format and uploaded to NCBI BLAST with Chromas (v.2.6.5.) program and their similarities were compared with the other sequences recorded in the data bank. All sequences belonging to the respective gene regions were loaded into the MEGA (v.7.0) program, and modeling methods and distances were determined. Phylogenetic trees were created in Bootstrap 1000. As a result, although the rate of detection of jellyfish species of the 18S rDNA gene is low, the discrimination power of COI, 16S rDNA and ITS1 genes is found to be high.
Benzer Tezler
- Türkiye denizlerindeki iskorpit (Scorpaena spp.) türlerinin moleküler, morfometrik ve otolit biyometrisi yöntemleriyle ayrımı
Discrimination of scorpionfish (Scorpaena spp.) species in turkish seas by molecular, morphometric and otolith biometry methods
SERDAR YEDİER
Doktora
Türkçe
2020
BiyolojiOrdu ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DERYA BOSTANCI
- İstanbul Büyükçekmece Küçükçekmece gölleri arasındaki kütle hareketlerinin türü ve mekanizmasının incelenmesi
Investigation of mass movements type and mechanism between i̇stanbul Büyükçekmece and Küçükçekmece lakes
GÖKHAN ŞANS
Doktora
Türkçe
2023
Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. REMZİ KARAGÜZEL
- Kuzeydoğu Ege kıyı ve deniz alanlarının tersiyer jeolojisi ve sedimantolojisi
Tertiary geology and sedimentology of the Northeastern Aegean offshore and nearshore regions
YAŞAR KESGİN
Doktora
Türkçe
2002
Jeoloji MühendisliğiAnkara ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAKİ VAROL
- İstanbul Kentiçi kara toplu ulaşım hizmetlerinin başlaması ve gelişimi: 1850 - 1900
Intrıduction and evolution of public trans portation sector in Istanbul: 1850 - 1900
İBRAHİM MURAT BOZKURT