Geri Dön

Hatay ilinde Cucurbitaceae familyasına ait bitkilerde yeni tanımlanan bazı virüslerin DAS-ELISA ve RT-PCR yöntemleriyle saptanması ve moleküler karakterizasyonu

Molecular characterization and detection by DAS-ELISA and RT-PCR analysis of some new emerging viruses in Cucurbitaceae family plants growing in Hatay province

PDF İndir

  1. Tez No: 547689
  2. Yazar: HÜLYA ÜSTÜNKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MONA GAZEL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

Bu çalışma ile Hatay ilinde Cucurbitaceae familyasına ait bitkilerde yeni tanımlanan bazı virüslerin (cucurbit sarı bodurlaşma bozuklugu virüsü CYSDV, cucurbit klorotik sarılık virüsü CCYV, şekerpancarı yalancı sarılık virüsü BPYV) DAS-ELISA ve RT-PCR yöntemleriyle saptanması ve moleküler karakterizasyonlarının yapılması amaçlanmıştır. Hatay ilinde yetiştirilen kabak, hıyar ve kavun bitkilerinde virüs benzeri belirtiler gösteren toplam 90 adet örnek toplanmıştır. Gözlenen en yaygın simptomlar yapraklarda küçülme, deformasyon, yaprak kırışıklıkları, kıvrılmalar ve damar açılmalarıdır. DAS-ELISA testi sonuçlarına göre testlenen tüm örneklerde CCYC bulunamamıştır. RT-PCR analizleri sonucunda testlenen örneklerde BPYV ve CCYV bulunamamış ancak CYSDV'nin heat shock protein 70h (HSP70h) genini çoğaltan 364 bp büyüklüğünde PCR amplikasyonları 11 örnekte (9 kabak, 2 kavun) elde edilmiştir. Bu ürünlerden 10 tanesinin doğrudan iki yönlü sekans analizi sonucunda, elde edilen nükleotit dizilerinin gen bankasında kayıtlı CYSDV izolatları ile yüksek oranda (%99) benzerlik gösterdiği saptanmıştır. CYSDV izolatlarından CYSDV-48 kabak izolatının GenBankasında kayıtlı AY580974.1 İspanya hıyar izolatıyla %99 oranında benzer olduğu belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

The aim of the present study was to investigate the occurrence and characterization of some new emerging viruses (cucurbit yellow stunting disorder virus CYSDV, cucurbit chlorotic yellows virüs CCYV, beet pseudo-yellows virus BPYV) in Cucurbitaceae family plants growıng in Hatay province by DAS-ELISA and RT-PCR analysis. Totaly 90 samplas showing virus-like symptoms were collected from cucumber, melon and squash plants growing in Hatay province. The most common symptoms were and observed as vein clearing, leaf rolling, crinkling, deformation and small leaves. According to DAS-ELISA results, all tested samples were found negative for CCYV. RT-PCR analysis showed that CCYV and BPYV was not detected in all tested samples but, heat shoch protein 70h (HSP70h) gene of CYSDV was succesfully amplified in 11 samples (9 squash, 2 melon) and 364 bp amplicon was obtained. Ten PCR product were directly sequenced on both strands and nucleotide sequences of isolates shared the highest sequence identity (99%) between each other. CYSDV-48 squash isolate is very similar with AY580974.1 Spain-cucumber isolate deposited in GenBank.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    644751

    Hatay ilinde etnobotanik bir çalışma

    An ethnobotanical study in Hatay province

    ZAHİDE VARLIBAŞ ODUNKIRAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Eczacılık ve FarmakolojiYeditepe Üniversitesi

    Fitoterapi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ETİL GÜZELMERİÇ

  2. Tez No

    246185

    Hatay ili Sesiidae (Lepidoptera) familyası türlerinin ve populasyon yoğunluklarının belirlenmesinde feromonların kullanılması

    Determination of Sesiidae species (Lepidoptera) and their population density by using pheromones in Hatay province

    ERKAN İSA SAĞIROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    ZiraatMustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FEZA CAN

  3. Tez No

    918416

    Hatay ilinde köpek üzümü (Solanum nigrum L.)'nün yaygınlığı, tohum biyolojisi ve bazı bitki uçucu yağların biyo-herbisidal etkinliklerinin belirlenmesi

    Determination of the distribution, seed biology and bio-herbicidal effects of some plant essential oils of black nightshade (Solanum nigrum L.) in Hatay province, Türkiye

    BESTAMİ ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    ZiraatHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN ÜREMİŞ

  4. Tez No

    425976

    Hatay ilinde tüketime sunulan sürklerde genişlemiş spektrumlu Beta- laktamaz (GSBL) sentezleyen Escherıchia coli prevalansının belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonu

    Determination of prevelance of extended specturum Beta-lactamase producing escherichia coli in sürk cheeses consumed in Hatay province and its antibiotic resistance and molecular characterization

    MÜGE HORUZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiMustafa Kemal Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAHYA KEMAL AVŞAR

    YRD. DOÇ. DR. CEMİL KÜREKÇİ

  5. Tez No

    425980

    Hatay ili örtüaltı organik domates yetiştiriciliğinde bazı begomovirüslerin enfeksiyon oranları ile doğal taşınma ve diğer konukçularının araştırılması

    Investigation on the infection rates of some begomoviruses, their natural transmission and other hosts in organic tomato production in greenhouses in hatay-turkey

    MEMET YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ZiraatMustafa Kemal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLŞEN SERTKAYA

Geri Dön