İnvaziv Klebsiella pneumoniae izolatlarının tigesiklin direncinde efluks pompasının rolü
The role of efflux pump in tigecycline resistance of invasive Klebsiella pneumoniae isolates
- Tez No: 553616
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET BURAK AKSU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Klebsiella, RND, efluks, tigesiklin, direnç, Klebsiella, RND, efflux, tigecycline, resistance
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 111
Özet
Amaç: Bu çalışmanın amacı, tigesikline duyarlı olmayan Klebsiella pneumoniae izolatlarının tigesiklin direncinde acrAB ve oqxAB efluks pompalarının rolünü belirlemektir. Gereç ve yöntem: 2017 yılında Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarında kan örneklerinden elde edilen K. pneumoniae izolatlarından VITEK 2 cihazı ile tigesiklin MİK değeri ≥2 µg/ml olarak bulunan 41 K. pneumoniae izolatı, sıvı mikrodilüsyon çalışmasına alındı. Sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle tigesiklin MİK değeri ≥2 µg/ml olarak belirlenen izolatların tigesiklin MİK değeri, efluks pompası inhibitörleri (PAßN, NMP ve CCCP) varlığında da tespit edildi. Ayrıca bu izolatlardaki RND tipi efluks pompasını kodlayan genlerin (acrB ve oqxB) ve düzenleyicilerinin (ramA, marA, rarA, soxS) ekspresyon seviyeleri qRT-PCR ile saptandı. Bulgular: Sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle tigesiklin MİK değeri ≥2 µg/ml olarak saptanan 18 izolatın efluks pompa inhibitörü (EPİ) yokluğunda ve varlığındaki tigesiklin MİK değerleri karşılaştırıldığında; PAßN, NMP ve CCCP sırasıyla 9, 17 ve 5 izolatın tigesiklin MİK değerinde anlamlı bir düşüşe neden olmuştur. Hem tigesiklin MİK değerleri ile acrB, oqxB ve ramA genlerinin ifade düzeyleri arasında anlamlı bir bağıntı bulunmuş hem de 14 izolatın en az bir EPİ varlığında tigesiklin MİK değerinde anlamlı bir düşüş meydana gelmiş ve bu 14 izolatın hepsinde acrB ve ramA genlerinin, 11 izolatta oqxB geninin ifade seviyesinin yüksek olduğu görülmüştür. NMP varlığında iki izolatın tigesiklin MİK değerinde anlamlı bir düşüş meydana gelmesine rağmen, araştırılan genlerin hepsinin ifade seviyesi bazal düzeylerdedir. Bir izolatın hiçbir EPİ varlığında tigesiklin MİK değerinde anlamlı bir düşüş olmamıştır ve araştırılan genlerin hepsinin ifade seviyesi bazal düzeylerdedir. NMP, bir izolatta tigesiklin MİK değerini anlamlı derecede düşürmesine rağmen, izolatın tigesikline duyarlı hale gelmediği ancak acrB ve ramA genlerini yüksek düzeyde ifade ettiği saptanmıştır. Sonuç: Bu veriler, invaziv Klebsiella pneumoniae izolatlarının tigesiklin direncinde acrAB ve oqxAB efluks pompalarının çok önemli bir rol oynayabileceğini göstermesinin yanı sıra bu dirençte başka efluks pompasının/pompalarının ve farklı mekanizmanın/mekanizmaların rol oynayabileceğini de desteklemektedir.
Özet (Çeviri)
Objective: The purpose of this study is to determine the role of acrAB and oqxAB efflux pumps in resistance to tigecycline of Klebsiella pneumoniae isolates which are not susceptible to tigecycline. Material and Method: Forty one K. pneumoniae isolates -with tigecycline MIC values ≥2 µg/ml according to VITEK 2 device- which were obtained from blood samples at Marmara University Pendik Training and Research Hospital Medical Microbiology Laboratory in 2017 were included in the broth microdilution study. The isolates with tigecycline MIC values ≥2 µg/ml by broth microdilution method were also tested for tigecycline MIC in the presence of efflux pump inhibitors (PAßN, NMP and CCCP). Expression levels of the RND-type efflux pump genes (acrB and oqxB) and their regulators (ramA, marA, rarA, soxS) in these isolates were also investigated by qRT-PCR. Results: When tigecycline MIC values of 18 isolates which were determined as tigecycline MIC ≥2 µg/ml by broth microdilution method were compared in the absence and presence of efflux pump inhibitor (EPI); PAßN, NMP and CCCP caused significant decrease in tigecycline MIC values in 9, 17 and 5 isolates, respectively. Both a significant correlation was found between tigecycline MIC values and expression levels of acrB, oqxB and ramA genes, and a significant decrease in tigecycline MIC value was found in the presence of at least one EPI of 14 isolates, and high expression levels of acrB and ramA genes in all of these 14 isolates and oqxB gene in 11 isolates were observed. Although the presence of NMP caused a significant decrease in the tigecycline MIC values of two isolates, the expression levels of all studied genes were at baseline levels. There was no significant decrease in tigecycline MICs in the presence of any EPI of an isolate, and the expression level of all of the studied genes were at baseline. Although NMP was significantly decreased tigecycline MIC of an isolate, it did not become susceptible to tigecycline but was expressed high levels of acrB and ramA genes. Conclusion: These data show that acrAB and oqxAB efflux pumps may play a very important role in tigecycline resistance of invasive Klebsiella pneumoniae isolates, as well as support that other efflux pump(s) and different mechanism(s) may play a role in this resistance.
Benzer Tezler
- Karbapenem dirençli klebsiella türleri ile rektal kolonizasyonu olan hastalarda enfeksiyon oluşumuna neden olan faktörlerin retrospektif olarak incelenmesi
Retrospective investigation of factors that cause infection in patients with rectal colonization with carbapenem resistant klebsiella species
PINAR ÇAKMAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
UZMAN ÇİĞDEM ARABACI
- N-asetil sistein, rifampisin ve ozonun panrezistan Klebsiella pneumoniae izolatlarının oluşturduğu biyofilm üzerine etkinliği
The efficacy of N-acetyl cysteine, rifampicin, and ozone on the biofilm formed by the panresistant Klebsiella pneumoniae isolates
GÜLŞAH TUNÇER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARİF ATAHAN ÇAĞATAY
- Klebsiella pneumoniae klinik izolatlarında agar dilüsyon yöntemi ile intravenöz fosfomisin direncinin saptanması ve meropenem, imipenem, amikasin antibiyotikleri ile sinerjist etkisinin araştırılması.
Determination of intravenous phosphomic resistance in clinical insulations of klebsiella pneumoniae and investigation of the synergist effect with meropenem, imipenem, amikacin antibiotics
NURULLAH UZUNER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
MikrobiyolojiDicle ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEZAHAT AKPOLAT
- Hastanede yatan hastaların, klinik örneklerinde üreyen enterobactericeae türlerinin klinik ve mikrobiyolojik özellikleri ve karbapenem direnç risk faktörlerinin araştırılması
Research of clinical and microbiological characteristics and carbapenem resistance risk factors of enterobactericeae species isolated in clinical samples of hospitalized patients
ÜMMÜGÜLSÜM BATIK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPAY ARI
- Karbapenem dirençli enterobacteriacae şuşları ile enfekte olan hastaların demografik özelliklerinin ve enfeksiyon oluşumundakirisk faktörlerinin değerlendirilmesi
Evaluation of risk factors for infections due to carbapenem-resistant enterobacteriacae and demographic features of the infected patients
FATMA ESER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık BakanlığıEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLRUHSAR YILMAZ