İnsan protein disülfit izomeraz (hPD) enzim aktivitesinin in vitro mutasyon çalışmaları ile araştırılması
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 55374
- Danışmanlar: PROF.DR. EROL AKÖZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Enzimler, İn vitro, İzomerazlar, Enzymes, In vitro, Isomerases
- Yıl: 1996
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
IV ÖZET Bu tez çalışmasında hücrede protein katlanımını katalizleyen temel faktörlerden biri olan protein disülfit izomeraz (PDI) enziminin aktivitesi ve aktif merkezi arasındaki bağlantı in vitro mutasyon çalışmaları ile araştırıldı. In vitro mutasyon çalışmaları oligonükleotid ile yönlendirilen nokta mutasyonları şeklinde gerçekleştirildi. Enzimin aktif merkezlerinde (a/a' domeyinleri) bulunan ve diğer tüm oksidoredüktazlarda da mayadan insana kadar korunmuş CXXC motifindeki Histidin amino asiti, yine küçük bir oksidoredüktaz olan tiyoredoksin model alınarak Prolin amino asitine çevrildi. Sonuçda a domeyinin aktivite değeri 0.728 U/ mi, yabanıl tip aktivite değeri 1.424 U/ml olarak ölçüldü. Böylece a domeyinin aktivite değerinin yabanıl tipe oranla %50 düşüş gösterdiği bulundu. Bu değerler mutant a' domeyini için 0.285 U/ml ve yabanıl tip için 1.402 U/ml olarak ölçüldü, a' domeyininin ise yabanıl tipe oranla %80 aktivite düşüşü gösterdiği bulundu. Böylece aktif merkezdeki CXXC motifinde yer alan Histidin amino asitinin enzim aktivitesi üzerinde direkt etkili olduğu saptandı.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT In this thesis, relationship between the activity and active site structure of protein disulfide isomerase which is one of the basic factor that catalyses protein folding in the cell was investigated by in vitro mutagenesis studies. For this porpose, in vitro mutagenesis studies was carried out as oligonucleotide directed point mutations. CXXC motif which is found not only in the active sites (a/a' domains) of this enzyme but also in all oxidoreductases is highly conserved in many organisms from yeast to human. Histidine amino acid of this sequence was converted to proline amino acid which is found in thioredoxin that is one of the small oxidoreductase as a model system. Mutant and wild type activities were measured by sRNAase assay. Consequently, mutant a domain and wild type a domain activities were measured and detected as 0.738 U/ml and 1.424 U/ml respectively. This result indicates to a 50 % decrease in a domain activity compared to wild type. On the other hand, a' domain activities of the mutant and wild type were also determined and was found that a' domain activity in this case decreased 80% accordingly to the wild type. As a result, it is a conclusion that histidine amino acid which is found in CXXC motif has a direct effect on the enzyme activity.
Benzer Tezler
- Amiloid beta ile PDIA3 arasındaki ilişkinin nörona farklılaştırılmış SH-SY5Y hücrelerinde incelenmesi
Investigation of the association between amyloid beta and PDIA3 in neuron differentiated SH-SY5Y cells
İDİL YÜKSEKEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Nörolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDİNÇ DURSUN
- The ubiquitin/proteasome system related role of Bag-1L in breast cancer
Bag-1L'in ubikuitin/proteazom sisteminde rolünün meme kanserinde incelenmesi
SEVİLAY ACAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Nitrosatif stres kökenli nörodejeneratif hastalıkların hücresel sinyal yolaklarının Arabidopsis thaliana kullanılarak araştırılması
Investigation of cellular signaling pathways of nitrosative stress-induced neurodegenerative diseases by using of Arabidopsis thaliana
AZİME GÖKÇE
- Sarı pas enfeksiyonuna dirençli buğday (Triticum aestivum L.)'da proteomik analizler
Proteomic analyses in yellow rust-resistant wheat (Triticum aestivum L.)
CİHAN İNAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. SEMRA HASANÇEBİ
PROF. DR. NAZLI ARDA
- Çocukluk çağı kronik böbrek hastalarının serumlarında YKL-40/kitinaz 3 benzeri protein 1 ile tiyol-disülfit homeostazının araştırılması
Investigation of YKL-40/kitinase 3 similar protein 1 and thyol-disulphite homeostasis in the serums of childhood chronic kidney patients
MELEK SENA TARAKÇIOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEYİTHAN TAYSI