Geri Dön

Exploring nanobodies interrupting the interaction between p53 and MDM4

P53 ve MDM4 etkileşimini bozan nanobodilerin keşfi

PDF İndir

  1. Tez No: 554576
  2. Yazar: SANEM SARIYAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET BATU ERMAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Sabancı Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

p53 proteini hücre bölünmesinin durdurulması, apoptoz ve senesens gibi önemli tümör baskılayıcı rolleri sayesinde genomun gardiyanı olarak bilinir. Bu roller son derece hayati olduğu için, p53 yolağı çok sıkı bir şekilde kontrol edilmelidir. Stres olmayan koşullarda, hücre içindeki p53 protein miktarı, p53 proteininin ubikutinlenmesi ve transkripsiyon aktivitesinin engellenmesi ile sırasıyla MDM2 ve MDM4 proteinleriyle kontrol altında tutulur. MDM2, p53 proteinin aktivitesinin ana modülatörü olmasına rağmen, p53' ün kontrolünün sağlanması için MDM2 ve MDM4' un işbirliğine ihtiyaç vardır. Bu nedenle, MDM4 proteini bu mekanizmada MDM2 proteini kadar önemlidir. Çoğu kanser tipinde, p53 proteininde mutasyon vardır ya da antagonistlerinin yüksek seviyede üretilmesi gözlenmiştir. Bu nedenle, kanser ilacı geliştirilmesinde p53-MDM2- MDM4 etkileşimi hedeflenmiştir. Buna ek olarak, antagonistlerin yüksek seviyede üretildiği bazı kanserlerde, sadece MDM2 için inhibitör kullanımı p53 proteinini aktive etmeye yeterli olmamıştır. Bu nedenle, MDM4 proteini için inhibitör araştırmaları önem kazanmıştır. Bu çalışmada bilgisayar ortamında tasarlanmış p53/ MDM4 etkileşimini bozan nanobodilerinin saflaştırılmasını optimize etmeyi ve bağlanmalarını yüzey plasmon rezonans (SPR) ve floresan ikili hibrit tekniği ile test etmeyi amaçladık.

Özet (Çeviri)

The p53 protein is considered as the guardian of the genome thanks to its important tumor suppressor roles such as cell-cycle arrest, apoptosis and senescence. Because these roles are extremely vital, the p53 pathway is strictly regulated. During unstressed conditions, p53 protein levels are kept in control by both ubiquitination of the p53 protein and inhibition of its transcriptional activity through the MDM2 and MDM4 proteins, respectively. Although MDM2 is the main modulator of p53 activity, there is a collaboration between MDM2 and MDM4 proteins to enable the control of p53. Thus, MDM4 is as important as MDM2 in this mechanism. In most human cancers, there is either a mutation in the Tp53 gene or an overexpression of its negative regulators. Thus, targeting the p53-MDM2-MDM4 interplay is one of the main aims of cancer therapeutics. Also, in some cancers, where there is overexpression of negative regulators, the use of inhibitors for only MDM2 is not enough to activate the p53 protein. For this reason, exploring inhibitors for MDM4 are vital for therapy. In this study, we aimed to optimize the purification of in silico designed nanobodies targeting the MDM4-p53 interaction and test their affinity and effectiveness by surface plasmon resonance (SPR) and a fluorescent two-hybrid (F2H) assay.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    902605

    Computational design of nanobodies targeting the neoantigens of oncogenic KRAS G12 mutations

    Onkojenik KRAS G12 mutasyonlarının neoantijenlerini hedefleyen nanokorların hesaplamalı tasarımı

    MURATCAN MENTEŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Moleküler Tıpİzmir Ekonomi Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHANGİR YANDIM

  2. Tez No

    873474

    Innovative approaches in pesticide development: Melt suspension technique and eco-friendly nano emulsion formulation for sustainable pest management

    Pestisit geliştirmede yenilikçi yaklaşımlar: Sürdürülebilir zararlı ıslahı için eriyik süspansiyon teknikleri ve çevre dostu nano emülsiyon formülasyonları

    RAMANAN GANAPATHY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Mühendislik Bilimleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET AYKAÇ

    PROF. DR. FETHULLAH GÜNEŞ

  3. Tez No

    64976

    Exploring affective responses to language learning through diaries at the Bilkent University School of English Language

    Bilkent Üniversitesi İngiliz Dili Meslek Yüksekokulu öğrencilerinin dil öğrenme sürecine duygusal yanıtlarını öğrenci günlükleri yardımıyla incelemek

    NURAN KILINÇARSLAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    Eğitim ve Öğretimİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    DR. BENA GÜL PEKER

  4. Tez No

    119131

    Exploring students' perceptions about problem-based online learning environment: A case study

    Öğrencilerin problem-tabanlı öğrenme ortamına ilişkin algılarının araştırılması: Bir durum çalışması

    SERDAR ENGİN KOÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    Eğitim ve ÖğretimOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. SONER YILDIRIM

    Y.DOÇ.DR. ZAHİDE YILDIRIM

  5. Tez No

    140539

    Exploring the relationships among learning styles, annotation use and reading comprehension for foreign language reading in a hypermedia environment

    Hipermedya ortamlarında yabancı dilde okuma bağlamında öğrenme biçimleri, açıklayıcı notların kullanımı ve okuduğunu anlama arasındaki ilişkilerin araştırılması

    ASIM ŞAKAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    Eğitim ve ÖğretimBoğaziçi Üniversitesi

    İngiliz Dili Eğitimi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÜLCAN ERÇETİN

Geri Dön