Akraba evliliği bulunan konjenital hipotiroidi hastalarında yeni varyasyonların keşfi
The discovery of new variations in congenital hypothyroid patients with consanguineous marriages
- Tez No: 557298
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ESRA ÇAĞAVİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Medipol Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
Konjenital hipotoidi (KH) bir tiroid hormon yetersizliğidir. Dünyada en sık görülen neonatal endokrin hastalığıdır ve tedavi edilmediğinde mental retardasyon ve gelişimsel bozukluklara sebep olabilmektedir. Yeni doğan grubunda tiroid aktivitesi bozukluğu gözlenmesi güç olduğundan KH taraması oldukça önemlidir. Hastalık otozomal resesif kalıtım göstermesinden dolayı özellikle akraba evliliği bulunan ailelerde görülme sıklığı daha yüksektir. Bu çalışmada ailesinde akraba evliliği bulunan 35'i kadın 28'i erkek 63 konjenital hipotiroidi hastası ile çalışılmıştır. Yeni nesil dizileme teknolojisi ve custom tasarlanmış gen paneli kullanılarak hasta DNA'larında; PAX8, NKX2-1, NKX2-5, FOXE1, TSHR, SLC5A5, SLC26A4, TG, TPO, DUOX2, DOUXA2, IYD, SLC26A7, DUOX1, GLIS3, TSHB ve THRA genleri taranmıştır. Çalışmamız sonucunda TPO geninde 5, SLC5A5 geninde 1, DUOX2 geninde 1, SLC26A7 geninde 2 ve TSHR geninde 1 mutasyon tespit edilmiştir. Bu mutasyonlardan ikisi; SLC5A5 genindeki 516. aminoasitin durdurucu kodona dönüşümü ve SLC26A7 genindeki G94R aminoasit değişimi, daha önce veribankalarında bildirilmemiş, bu tez çalışmasında yeni tanımladığımız mutasyonlardır. Bu mutasyonların in silico tahmin gereçleriyle yapılan fonksiyonel analizleri ve hastaların fenotipleri birlikte incelendiğinde bu iki varyant tarafımızca novel patojenik varyantlar olarak değerlendirilmişlerdir. Yeni nesil dizileme sonuçları Sanger dizileme yöntemi ile doğrulanmıştır ve aile segregasyonları fenotiplerle uyum göstermiştir. Elde edilen bu bilgiler veri bankalarına katkı sağlayacak ve hastalığın tanısı için yeni belirteç görevi görecekleri düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Congenital Hypothyroidism (CH) is a thyroid hormone deficiency. It is the most common neonatal endocrin disease and may lead to mental retardation and developmental disorders if not treated. Since the dysfunction of thyroid activity is difficult to detect in newborns, CH screening is very important. Since the disease shows autosomal recessive inheritance, it is more common in families with consanguineous marriges. In this study, we performed a new variation screening in 35 female, 28 male and a total of 63 CH patient with consanguinity marriages. Next- generation sequencing technology and custom-designed gene panel were used to screen the genes; PAX8, NKX2-1, NKX2-5, FOXE1, TSHR, SLC5A5, SLC26A4, TG, TPO, DUOX2, DOUXA2, IYD, SLC26A7, DUOX1, GLIS3, TSHB and THRA in the patients' DNA samples. As a result of our study, 5 mutations in the TPO gene, 1 in the SLC5A5 gene, 1 in the DUOX2 gene, 2 in the SLC26A7 gene and 1 mutation in the TSHR gene were identified. Two of these mutations; a G94R amino acid change in the SLC26A7 gene and amino acid change into a stop codon at the 516. Position in the SLC5A5 gene is the mutations that have not been previously reported in the databases. The functional analyzes of these mutations with in silico estimation tools and the phenotypes of the patients were evaluated together and resulted as novel pathogenic variants by this thesis study. New generation sequencing results were confirmed by Sanger sequencing and family segregations were consistent with phenotypes. This information will contribute to the databases and serve as a new marker for the diagnosis of the disease in the future.
Benzer Tezler
- Yenidoğan yoğun bakım ünitesinde konjenital kalp hastalığı tanısı alan olgularda kardiyak biyomarkerlar (BNP, TROPONİN I, CK MB izoform)'ın tanı ve izlemdeki yeri
Cardiac biomarkers (BNP, TROPONİN I, CK MB) place of diagnosis and fallow up newborn in intensive care unit with congenital heart disease
CANER AYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık BakanlığıÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
UZMAN SULTAN KAVUNCUOĞLU
- Konjenital işitme kayıplarında genetik tarama
Genetic investigation in congenital hearing loss
PELİN ARICI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Kulak Burun ve BoğazÇukurova ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METE KIROĞLU
- Perinatal otopsilerde santral sinir sistemi malformasyonları
Central Nervous System AnomalHes in PerHnatal AutopsHes,
NURAN TUTAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZUHAL AKÇÖREN
- Çocukluk çağı genetik nörosensoriyel işitme kayıpları
Başlık çevirisi yok
ONUR TURAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2001
Kulak Burun ve BoğazEge ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. FAZIL APAYDIN