İnvaziv örneklerden izole edilen klebsiella pneumoniae suşlarının aminoglikozid antibiyotiklere direncinin araştırılması
A research of aminoglycoside antibiotics resistance on klebsiella pneumoniae strains isolated from invasive samples
- Tez No: 558276
- Danışmanlar: PROF. DR. NURVER ÜLGER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Aminoglikozid antibiyotik direnci, Klebsiella pneumoniae, Ribozomal metiltransferazlar, rmtC, armA, Aminoglycoside resistance mechanisms, Klebsiella pneumoniae ribosomal methyltransferases, rmtC, armA
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Amaç: Hastanemizde izole edilen invaziv Klebsiella pneumoniae izolatlarında aminoglikozid direncinden sorumlu mekanizmaları ortaya koymaktır. Gereç ve Yöntem: Marmara Üniversitesi Hastanesi'nde Ocak-Aralık 2016 tarihleri arasında izole edilen 125 invaziv K. pneumoniae izolatı çalışmaya alınmıştır. VİTEK® 2 (BioMérieux, Fransa) ile amikasin veya gentamisinden en az birine dirençli saptanan 50 izolatta; amikasin, gentamisin, tobramisin, netilmisin, apramisin ve kanamisin minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK), standart sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle belirlenmiştir. Elli izolatta ayrıca aminoglikozid modifikasyon enzimlerini kodlayan genler, aac(3)-II, aac(3)-I, aac(6')-Ib ve ant(2'')-I, PZR yöntemiyle araştırılmıştır. Yüksek düzey aminoglikozid direnci gösteren izolatlarda ayrıca ribozomal metiltransferazları (RMT) kodlayan genler, armA, rmtA, rmtB, rmtC, rmtD, rmtE, rmtF, rmtG, rmtH, npmA araştırılmıştır. Bulgular ve Sonuçlar: Çalışmamızda 125 K. pneumoniae izolatının %82'si amikasine, %64'ü gentamisine duyarlı bulunmuştur. Amikasin veya gentamisinden birine dirençli bulunan elli izolatta en sıklıkla rastlanan aminoglikozit modifikasyon genleri, aac(3)-II (%86) ve aac(6')-Ib (%78) olup bu genler izolatların %64'ünde birlikte saptanmıştır. Amikasin, gentamisin, tobramisin ve netilmisinin hepsine birden yüksek düzey dirençli bulunan 13 izolatta ise en sıklıkla rmtC ardından armA RMT genleri saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this study is to determine the aminoglycoside resistance mechanisms in invasive Klebsiella pneumoniae isolates in our Hospital. Material and Methods: A total of 125 invasive K. pneumoniae isolates collected in 2016 in Marmara Üniversitesi Hospital were included. In 50 out of 125 K. pneumoniae isolates exhibiting resistance to amikacin or gentamicin in VITEK® 2 (BioMérieux, France) were run to standard broth microdilution assay to determine amikacin, gentamicin, tobramycin, netilmicin, apramycin and kanamycin MICs. Aminoglycoside modifying enzyme genes, aac(3)-II, aac(3)-I, aac(6')-Ib and ant(2'')-I, were also investigated by PCR in 50 isolates. In addition the isolates presenting high level aminoglycoside resistance in broth microdilution test were run to PCR for detection of genes encoding ribosomal methyltransferases, armA, rmtA, rmtB, rmtC, rmtD, rmtE, rmtF, rmtG, rmtH, npmA. Results and Conclusion: In our study we found that 82% and 64% of total isolates (n:125) were susceptibile to amikacin and gentamicin, respectively. The most common aminoglycoside modifying enzyme genes were aac(3)-II (%86) and aac(6')-Ib (%78) in our collection. These two genes were found together in 64% of the isolates. High level aminoglycoside resistance was detected in 13 isoletes. rmtC and armA genes were found as responsible genetic determinants of high level resistance in these isolates.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen klebsiella pneumoniae suşlarında virülans faktörlerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması ve antibiyotik direnci ile ilişkilerinin incelenmesi
Investigation of virulence factors by phenotypic and genotypic methods and evaluation of their relationship with antibiotic resistance in klebsiella pneumoniae strains isolated from clinical samples
İREM SERBEST
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN BAYLAN
- Piperasilin- tazobaktam ve karbapenem kullanımının karbapeneme dirençli enterobacterales ile fekal kolonizasyon gelişmesi üzerindeki etkisinin karşılaştırılması
Comparison of the effect of carbapenem and piperacillin-tazobactam on the development of fecal colonisation with carbapenem resistant enterobacterales
TUĞBA PAMUKÇU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖKHAN METAN
- Karbapenem dirençli klebsiella türleri ile rektal kolonizasyonu olan hastalarda enfeksiyon oluşumuna neden olan faktörlerin retrospektif olarak incelenmesi
Retrospective investigation of factors that cause infection in patients with rectal colonization with carbapenem resistant klebsiella species
PINAR ÇAKMAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
UZMAN ÇİĞDEM ARABACI
- Fonksiyonel endoskopik sinüs cerrahisi (FESC) uygulanan kronik sinüzitli hastaların sinüs materyallerinin bakteriyolojik yönden değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
MURAT ARAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HATİCE HANDAN AKBULUT
- Nozokomiyal gram-negatif çomak bakteriyemisi olan hastalarda mortaliteye etki eden risk faktörleri
Risk factors for mortality in patients with nosocomial gram-negative rod bacteremia
ZEHRA ÇAĞLA KARAKOÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARİF ATAHAN ÇAĞATAY