Association analysis of cholesterol 7- alpha hydroxylase (CYP7A1) and cholesterol 24-hydroxlase (CYP46A1) genetic polymorphisms and multiple sclerosis risk in turkish population
Türk popülasyonunda kolesterol 7-alfa hidroksilaz (CYP7A1) ve kolesterol 24-hidroksilaz (CYP46A1) gen polimorfizimleri ile multipler skleroz riski ilişkisinin incelenmesi
- Tez No: 561894
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN ADALI, DOÇ. DR. BİRSEN CAN DEMİRDÖĞEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biyokimya, Biology, Genetics, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Multipler skleroz (MS), merkezi sinir sisteminde en yaygın görülen demiyelinizasyon hastalığıdır. Belirli çevresel faktörlerin etkisi altında, genetik olarak yatkın kişilerde görülmektedir. MS hastaları düşük seviyede vitamin D'ye sahiptir. Kolesterol sentez ara ürünlerinden biri olan 7-dehidrokolesterolden, UVB-ışınlarının fotokimyasal dönüşümü sonucu deri de vitamin D üretimi gerçekleşir. Karaciğerde kolesterol 7α-hidroksilaz (CYP7A1) ve beyinde kolesterol 24S-hidroksilaz (CYP46A1) vücuttan kolesterolün uzaklaştırılmasından sorumludur. A→C dönüşümünü gösteren, CYP7A1 geninde transkripsiyonun başlama noktasından -204 konumunda bulunan, rs3808607 tek nükleotid polimorfizmi (SNP) gen ifadesinde ve enzim aktivitesinde önemli rol oynar. rs754203 isimli CYP46A1 geninin 5' noktasındaki ekzon 3'e 151 bazlık mesafede ki intronda bulunan T →C SNP'si de aminoasit sekansını ya da gen tarafından üretilen protein yapısını etkilememesine rağmen insan sağlığı ve hastalıkları yönünden çalışılmıştır. Bu mevcut çalışmada, rs3808607 ve rs754203 polimorfizimleri MS riski üzerindeki etkileri yönünden araştırılmıştır. 138 MS hastası ve 100 sağlıklı kontrolle PCR-RFLP metodu kullanılmış olup; istatistiksel analizler SNP'lerin üç farklı genetik model- Dominant, Resesif, Eklemeli model- oluşturularak yapılmıştır. CYP7A1 rs3808607 ve CYP46A1 rs754203 için bütün genotipleme ve allel frekans analizleri bütün bireylerle, yalnızca erkekler ve yalnızca kadın bireylerin olduğu gruplarla yapılmıştır fakat, onların hiçbirinde istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık bulunamamıştır. rs3808607 ve rs754203'lü MS hastalarının ve kontrollerinde, kan lipid ve vitamin D değerleri arasında ilişki olup olmadığını anlamak için, SNP'ler bahsedilen genetik modellere göre ayrılmıştır. rs3808607 için, sadece resesif modelinde, yabanıl tip allel taşıyan hastaların TC ve vitamin D içerikleri, aynı genotipli kontrollerden istatistiksel olarak anlamlı şekilde daha düşük bulunmuştur. Diğer karşılaştırmalarda ise herhangi bir farklılık bulunamamıştır. CYP46A1 rs7554203 için ise, karşılaştırmaların tamamına bakıldığında, bulunan tek istatistiki farklılık, heterozigot mutant genotipe sahip hastaların vitamin D değerleri, aynı genotipli kontrollerden daha düşük olmasıydı. Sonuç olarak, bu çalışmada, CYP7A1 rs3808607 and CYP46A1 rs754203 SNP'lerin genotip ve allel frekansları ile MS riski arasında bir ilişki görülmedi. Lipit ve vitamin D parametreleri açısından değerlendirildiğinde ise, bu genler ve hasta ya da kontrollerin lipit içerikleri arasında bir ilişki bulunamazken, onların bazı alt guruplarında vitamin D değerlerinin hastalarda kontrollerden daha düşük olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Multiple Sclerosis (MS) is the most common demyelinating disorder of the central nervous system. Under the effects of certain environmental factors, MS develops in genetically susceptible individuals. People with MS have significantly lower vitamin D levels. UV-B radiation catalyzes the photo-conversion of 7-dehydrocholesterol, produced in cholesterol production pathway, to vitamin D in the skin. Cholesterol 7α-hydroxylase (CYP7A1) in the liver and Cholesterol 24S-hydroxylase (CYP46A1) in the brain are responsible for cholesterol removal in human body. A Single Nucleotide Polymorphism (SNP) conferring A→C transition, named rs3808607 in CYP7A1 and present at -204 location of form the transcriptional start site, might play a critical role in gene expression and its enzyme activity. T → C SNP named rs754203 in CYP46A1, which is located in intronic region of CYP46 gene, 151 bases 5′ to exon 3, is investigated in terms of human health or disease although it does not affect the amino acids sequences or the structure of the protein expressed by gene. In this study, rs3808607 and rs754203 polymorphisms were investigated for their effect on the risk of MS. 138 MS patients and 100 healthy controls were tested by PCR-RFLP method to determine their genotypes. Analyses of them were conducted by forming three genetic models of SNPs: Dominant, Recessive and Additive Model. For CYP7A1 rs3808607 and CYP46A1 rs754203, all genotypes and allele frequency analyses were performed with all subjects, male and female subgroups only. However, any significant difference was not found in them. To understand whether there were any relations of blood lipids and vitamin D levels in MS patients and controls with rs3808607 and rs754203, SNPs were split according to mentioned genetic models. For rs3808607, only its recessive model, TC and vitamin D contents of patients, carrying the wild type allele were significantly lower than controls with same genotypes. The other comparisons didn't show any meaningful difference. As regard to CYP46A1 rs754203 SNP, of all the comparisons, only statistical significance was that vitamin D levels of patients with heterozygote mutant genotype was lower than controls with same genotype. As a conclusion, in this study, there were no any significant associations between genotypes and allele frequencies of CYP7A1 rs3808607 and CYP46A1 rs754203 SNPs and MS risk. In terms of lipid parameters and vitamin D levels, these genes and lipid parameters were not found to be related in patients and controls, however, vitamin D levels were found to be lower in patients compared to controls in some subgroups.
Benzer Tezler
- Mercimek diyet liflerinin izolasyonu, karakterizasyonu ve fonksiyonel özelliklerinin incelenmesi
Isolation of dietary fibers from lentils, characterization and evaluation of their functional properties
SİNEM KAMİLE GEDİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. DİLARA ERDİL
- Crohn ve serum Maresin-1 düzeyleri arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the relationship between Crohn's disease and serum Maresin-1 levels
MEHMET ALPASLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
GastroenterolojiFırat Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVZAT GÖZEL
- Aterosklerozda rol alabilecek yeni bir aday genin fonksiyonel analizi ve bu genin kardiovasküler hastalıklar ile ilişkisi
Functional analysis of a new candidate gene which may play role in atherosclerosis, and it's relationship with cardiovascular diseases
NESLİHAN ÇOBAN
Doktora
Türkçe
2012
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAN ERGİNEL-ÜNALTUNA
- Tip 2 diyabet hastalarında Rev-erb beta gen dizisindeki varyasyonların klinik fenotiple ilişkilerinin araştırılması
Investigation of associations of Rev-erb beta gene variations with clinical phenotype in patients with type 2 diabetes
BENGÜ TOKAT
Doktora
Türkçe
2018
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA YILMAZ AYDOĞAN
- Aorta-iliak ve femoro - popliteal arter oklüzyonlu hastalarda hıf1a-as1 ve hıf1a-as2 gen ekspresyonu düzeylerinin oksidatif rna hasarı ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relationship between hif1a-as1 and hif1a-as2 gene expression levels and oxidative rna damage in patients with aortoiliac and femoropopliteal arterial occlusion
AFSOON GHORISHIZADEH
Doktora
Türkçe
2026
Biyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURCU BAYOĞLU