Investigation of the effect of miRNA-582-5p and miRNA-363 expression levels on caspase-9 in glioblastoma multiforme tumors
Glioblastoma multiforme tümörlerinde miRNA-582-5P ve miRNA-363 ekspresyon seviyelerinin kaspaz-9 üzerine etkisi
- Tez No: 563845
- Danışmanlar: PROF. DR. TURGAY İSBİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Nöroloji, Molecular Medicine, Neurology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 110
Özet
Bu tezin amacı, miRNA-582-5p ve miRNA-363 ekspresyon seviyelerinin, apoptozun başlatılmasında kilit role sahip olan kaspaz-9'un serum düzeyinde ilişkisinin glioblastoma multiforme (GBM) hastalarında araştırılmasıdır. Bu amaçla, toplam olarak 71 birey seçilerek, GBM tanısı almış olan (n=35) ve daha önce bu hastalığın tanısını almamış olanlar (n=36) olmak üzere iki gruba ayrılmıştır. Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak grupların miRNA-582-5p, miRNA-363 ekspresyon seviyeleri ve kaspaz-9 geni Ex5+32 G>A (rs1052576) polimorfizmi analiz edilmiştir. miRNA ekspresyon analizleri, miRNA-582-5p ve miRNA-363 ekspresyon seviyelerinin anlamlı olarak hasta grubunda anlatımının azaldığını göstermiştir (p=0.014* ve p=0.010*). Serum miRNA-582-5p, miRNA-363 ve serum kaspaz-9 seviyeleri karşılaştırıldığında, istatistiksel olarak miRNA ekspresyon seviyesi arasında bir anlamlılık tespit edilememiştir (p=0.144 ve p=0.050).Ayrıca, Türk populasyonunda kaspaz-9 geni Ex5+32 G>A (rs1052576) polimorfizmi GBM hastalarının yanı sıra tanı konulmamış bireylerde araştırılmıştır. GG genotipine sahip olmak, GBM riskini 3.78 kat azaltmaktadır (p=0.015*). Biyobelirteç adaylığının son değerlendirme noktası olan ROC analiz sonuçlarına göre, miRNA-582-5p ve miRNA-363'ün GBM için biyobelirteç adayı olabileceği gözlemlenmiştir (miRNA-582-5p ΔCт p=0.006*; kat değişimi p=0.0001* ve miRNA-363 ΔCт p=0.0016*; kat değişimi p=0.0001*). Sonuç olarak, çalışma grupları ile miRNA-582-5p ve miRNA-363 ekspresyon seviyeleri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmuş olup, miRNA-582-5p ve miRNA-363 ekspresyon seviyelerinin serum kaspaz-9 seviyesi üzerinde bir etkisi olmadığı bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
The aim of this thesis study is to investigate the expression levels of microRNA-582-5p and miRNA-363 as they relate to serum levels of caspase-9, which holds key roles in the initiation of apoptosis in glioblastoma multiforme (GBM) patients. For this purpose, a total of 71 individuals, were selected and divided into two groups: those who were diagnosed with GBM disease (n=35),and those who were not previously diagnosed with this disease (n=36).The expression levels of miRNA-582-5p, miRNA-363 and caspase-9 gene Ex5+32 G>A (rs1052576) polymorphism of the groups were analyzed using real-time polymerase chain reaction. The miRNA expression analysis showed that miRNA-582-5p and miRNA-363 expressions were significantly downregulated in the patient group (p=0.014* and p=0.010*). When the means of serum miRNA-582-5p, miRNA-363 and serum caspase-9 levels were compared, a statistically significant relationship between miRNA expression levels and caspase-9 level could not be determined (p=0.144 and p=0.050). Also, caspase-9 gene Ex5+32 G>A (rs1052576) polymorphism was investigated in GBM patients, as well as undiagnosed individuals in the Turkish population. Having GG genotype reduced the risk of GBM by 3.78 times (p=0.015*). According to the results of ROC analysis, which is the last assessment point for biomarker nomination, it was observed that miRNA-582-5p and miRNA-363 are candidate biomarkers for GBM (miRNA-582-5p ΔCт p=0.006*; fold change p= 0.0001* and miRNA-363 ΔCт p=0.0016*; fold change; p=0.0001*). In conclusion, while a statistically significant relationship was found between miRNA-582-5p, miRNA-363 expression levels and working groups, no statistically significant relationship was found between miRNA-582-5p and miRNA-363 expression levels regarding an effect on serum caspase-9 levels.
Benzer Tezler
- Tüp bebek tedavisinde tekrarlayan implantasyon başarısızlığı görülen kadınlarda antısense mırna gen polimorfizmlerinin etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of mirna gen polymophisms in women with repeat implantation failures in İVF treatment
AMIR SAGHAFIAN
Doktora
Türkçe
2023
GenetikOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞENGÜL TURAL
- MirNA-223 ifade düzeyinin HDl kolesterol seviyesi üzerine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of mirna-223 expression on HDL cholesterol level
EZGİ YALBIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Moleküler TıpYeditepe ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TURGAY İSBİR
- Romatoid artrit hastalarında egzersizin miRNA ve mRNA ekspresyonları üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of exercise on mirna and MRNA expression in patients with rheumatoid arthritis
ZEYNEP BETÜL ÖZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaSağlık Bilimleri ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET ZAHİT ÇIRACI
- Osteoartrit hastalarında egzersizin miRNA ve mRNA ekspresyonları üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of exercise on mirna and MRNA expression in osteoarthritis patients
FULYA SENEM KARAAHMETOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaSağlık Bilimleri ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HALİME HANIM PENÇE
- Let-7C ifadesinin çeşitli meme kanser hücre hatlarında otofaji ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the effect of LET-7C expression on autophagy in breast cancer cell lines
SEÇİL DEMİRAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Tıbbi BiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI