Romatoid artritte potansiyel biyomarker olabilecek epigenetik değişikliklerin incelenmesi
Investigation of epigenetic changes would be potential biomarkers in rheumatoid arthritis
- Tez No: 566736
- Danışmanlar: PROF. DR. NURTEN KARA, DOÇ. DR. ŞENGÜL TURAL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Romatoid artrit, epigenetik, metilasyon, miRNA, MMP-3, Artrit-romatoid, Biyobelirteçler, Epigenez-genetik, Matriks metalloproteinazlar, Mikro RNA, RNA, Romatizmal hastalıklar, Rheumatoid arthritis, epigenetics, metylation, miRNA, MMP-3, Arthritis-rheumatoid, Biomarkers, Epigenesis-genetic, Matrix metalloproteinases, Methylation, Micro RNA, RNA, Rheumatic diseases
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Romatoid artrit (RA) çok sayıda genetik ve epigenetik faktörün etkili olduğu kronik bir inflamatuvar hastalıktır. Bu çalışma, RA hastalarında interlökin-16 (IL-16) ve matriks metalloproteinaz-3 (MMP-3) genlerinin promotör metilasyon durumlarının ve bu genleri hedeflemesi muhtemel mikro-RNA'lardan olan hsa-miR-93-5p ile hsa-miR-4668-5p'nin ekspresyon düzeylerinin RA ile ilişkisini tespit etmek amacıyla yapıldı. Materyal ve Metot: RA teşhisi konulmuş 49 hasta ve 38 sağlıklı kontrol ile çalışma grubu oluşturuldu. Gönüllü bireylere ait periferal kan numunelerinden DNA izolasyonu ile elde edilen genomik DNA'lardaki IL-16 ve MMP-3 genlerinin promotör metilasyon profilleri, metilasyon spesifik PZR metodu ile analiz edildi. Toplam 41 RA hastasında hsa-miR-93-5p ve hsa-miR-4668-5p'nin ifade düzeylerini belirlemek için kantitatif real-time PZR metodu kullanıldı. Bulgular: RA hastalarında metilasyon sıklığı; MMP-3 geni için %75.5 (37/49) ve IL-16geni için %93.9 (46/49)'du. Kontrol grubunda metilasyon sıklığı; hem MMP-3, hem de IL-16 geni için %97.4 (37/38)'di. Hasta ve kontrol grubuna ait DNA örneklerinin MMP-3 promotör bölge metilasyonları karşılaştırıldığında, metilasyon sıklıkları açısından anlamlı fark bulundu (p=0.004). Ancak, IL-16promotör metilasyon sıklıkları açısından bir fark bulunmadı (p>0.05). RA grubunda hem hsa-miR-93-5p, hem de hsa-miR-4668-5p'nin ekspresyon düzeylerinde kontrole göre anlamlı fark bulundu (p<0.001). Sonuç: MMP-3 geninin atipik promotör metilasyonu ve hsa-miR-93-5p ile hsa-miR-4668-5p'nin ekspresyon seviyelerindeki değişimler, RA'nın tanısı ve tedavi etkinliğinin değerlendirilmesinde kullanılabilecek birer biyobelirteç olabilir. Ayrıca, bu biyobelirteçlerin kan örneklerinden analizi kolay uygulanabilir bir yöntem olabilir.
Özet (Çeviri)
Aim: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic inflammatory disease, and it is known that genetic factors and the environment are involved in the disease process. We aimed to determine the relationship between promoter methylation status of interleukin-16 (IL-16) and matrix metalloproteinase-3 (MMP-3) genes and RA. Then we aimed to analyze the expression levels of hsa-miR-93-5p and hsa-miR-4668-5p which is possible micro-RNAs targeting these genes in RA. Material ve Method: The study group consisted of 49 patients diagnosed with RA and 38 healthy controls. Promoter methylation of IL-16 and MMP-3 was analyzed by methylation-specific PCR. Expression levels of hsa-miR-93-5p and hsa-miR-4668-5p in 41 RA patients and healthy control were determined by quantitative Real Time PCR. Results: The frequency of methylation in RA patients; 75.5% (37/49) for the MMP-3 gene and 93.9% (46/49) for the IL-16 gene. Methylation frequency in the control group; 97.4% (37/38) for both the MMP-3 and IL-16 gene. When patient and control groups were compared, a significant difference was found in terms of MMP-3 promoter methylation frequency (p = 0.004). However, there was no difference in IL-16 promoter methylation frequencies (p> 0.05). In the RA group, expression levels of both hsa-miR-93-5p and hsa-miR-4668-5p were significantly different compared to the control group (p <0.001). Conclusion: Atypical promoter methylation of the MMP-3 gene and changes in expression levels of hsa-miR-93-5p and hsa-miR-4668-5p may be biomarkers that can be used to diagnose RA and evaluate treatment efficacy. Furthermore, the analysis of these biomarkers from blood samples can be an easily applicable method.
Benzer Tezler
- Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study
Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma
DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU
- IgM, IgG ve lgA romatoid faktörlerin değişik artritli hasta gruplarında mikro-ELISA test yöntemiyle ölçülmesi
Başlık çevirisi yok
BAHRİYE KEŞ
- Romatoid artrit'te pulse kortikosteroid ve pulse siklofosfamid uygulaması
Başlık çevirisi yok
HÜLYA DEDE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Fiziksel Tıp ve Rehabilitasyonİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN YAZICI
- Akut romatizmal ateş tanısında jones kriterlerinin özgüllüğünün ve duyarlılığının araştırılması
Başlık çevirisi yok
BETÜL ÖZTÜRK (KALENDER)
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Fiziksel Tıp ve Rehabilitasyonİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN YAZICI
- M.S. 5. yüzyıl Geç Roma dönemine ait bir erkek iskelette ankilozan spondilit
Başlık çevirisi yok
ZÜBEYDE ÇELİK