İncir'de enfeksiyon yapan Closteroviridae familyası virüslerin tanılanması
Detection of viruses in the family Closteroviridae in fig trees
- Tez No: 568615
- Danışmanlar: PROF. DR. NİHAL BUZKAN, DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA KÜSEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 45
Özet
Bu çalışma, Kahramanmaraş ilinde ev bahçeleri ve Sütçü İmam Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bahçe Bitkileri Bölümü incir seleksiyon bahçesindeki ağaçlarda mozaik-benzeri belirti taşıyan ağaçlarda Closteroviridae familyası virüs türlerini tanılamak amacıyla yürütülmüştür. Toplam 89 ağaçtan alınan yaprak örneklerinden silika yakalama yöntemiyle toplam nükleik asit (TNA) izole edilmiştir. TNA'lar Closteroviridae familyası için hazırlanmış dejenere primerleri kullanılarak RT-PCR ile testlenmiştir. Testlenen örneklerin 54 tanesinde 550-650 bç büyüklüğünde Closteroviridae familyası DNA'sı tanılanmıştır. Pozitif örneklerin 49 tanesinin nükleotid dizini çıkartılacak kalitede elde edilmiştir. Nükleotid dizinleri MEGA6 yazılım programında ClustalW ile hizalanmış, BLASTN kullanılarak gen bankasında kayıtlı, nükleotid benzerliği gösteren virüs türleriyle çoklu karşılaştırması yapılmıştır. Yedi örnek DNA'sı Ffig leaf mottle associated virus-1 (FLMaV-1), 38 örnek Fig leaf mottle associated virus-2 (FLMaV-2), 3 örnek Fig leaf mottle associated virus-3 (FLMaV-3) ve 1 örnek Fig mild mottle associated virus (FMMaV) dizinleriyle ile benzerlik göstermiştir.
Özet (Çeviri)
This research was carried out to determine viruses in the family Closteroviridae in fig trees having mosaic-like symptoms in home gardens in Kahramanmaraş province and in the experimental fig orchard of the Horticulture Department at Agriculture Faculty at Kahramanmaraş Sütçü imam University. Leaf and fruit samples were collected in July and stored at cold environment until they were processed for virus test. Total nucleic acid (TNA) isolation was made by using silica-capture method and used for reverse transcription and cDNA synthesis. PCR was carried out with degenerate primers prepared for Closteroviridae family. Fifty four out of 89 tested samples resulted positive in PCR test and had DNA band of 550-650 bp in size. Then they were directly sequenced in both direction and only 49 samples gave clear nucleotide sequences. Sequences were aligned with ClustalW and analysed in BLASTN for multiple comparison with other isolates in GeneBank using MEGA6 nucleotide sequence analyse software. The samples showed high nucleotide homology with Fig leaf mottle associated virus-1 (FLMaV-1) (7 sample), Fig leaf mottle associated virus-2 (FLMaV-2) (38 samples), Fig leaf mottle associated virus-3 (FLMaV-3) (3 samples) and Fig mild mottle associated virus (FMMaV) (1 sample).
Benzer Tezler
- Hacettepe Üniversitesi İhsan Doğramacı Çocuk Hastanesi'ne bir yılda yatan hastalarda tespit edilen hastane enfeksiyonu sıklığı ve hastane enfeksiyonu gelişmesiyle ilişkili faktörler
Frequency of nosocomial infections and related risk factors among children hospitalized at Hacettepe University Ihsan Dogramaci Children?s Hospital in a period of one year.
İNCİ BURÇİN YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiHalk Sağlığı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SABAHAT TEZCAN
- Ventilatör ilişkili pnömoni tanısında; Elabela, visfatin, chemerin gibi enflamatuar biyobelirteçlerin rolünün değerlendirilmesi
Evaluation of the role of inflammatory biomarkers such as elabela, visfatin, chemerin and dynamic thiol / disulphide homeostasis in the diagnosis of ventilator-associated pneumonia
ERDAL İNCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiDicle ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAİM DAYAN
- Hastanemizde izole edilen Klebsiella spp. ve Escherichia coli suşlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamazların genotipik tiplendirmesi
Genotypic Typing of Extended-Spectrum ß-Lactamase of Klebsiella spp. and Escherichia coli Strains isolated in our Hospital
NURAN AKMİRZA İNCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLHAMİ ÇELİK
- Toxoplasma gondii fraksiyonlarının normal ve apoptotik hücreler üzerine etkileri
Effects of toxoplasma gondii fractions on normal and apoptotic cells
KEREM YAMAN
Doktora
Türkçe
2013
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇİĞDEM GÜNGÖR
- Pankreasın duktal adenokarsinom dışındaki ekzokrin ve nonfonksiyone endokrin tümörleri
Başlık çevirisi yok
AYŞE NUR GÖNEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
Genel Cerrahiİstanbul ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. YAMAN TEKANT