CRISPR/dCas9 ile pankreatik transkripsiyon faktörü Pdx1 geninin aktivasyon bölgelerinin belirlenmesi
Determination of activation regions of pancreatic transcription factor Pdx1 gene with CRISPR/dCas9
- Tez No: 571036
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ERSİN AKINCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Diabetes mellitus (DM), insülin hormonunun yokluğundan ya da bu hormonun etkisindeki yetersizlik sonucu oluşan metabolik bir hastalıktır. Pankreasın oluşması ve beta hücresinin farklılaşması sırasında rol oynayan birçok gen olduğu bilinmektedir. Bu genler arasında Pdx1 geni; pankreasın oluşmasında, beta hücre farklılaşmasında ve bu hücrelerin hayatta kalmasında kritik bir role sahiptir. Bu genin düzenlenmesi için pek çok yöntem kullanılmaktadır. Bunların arasında son dönemlerde en çok kullanılan yöntem; bakterilerin immün yanıtta kullandıkları CRISPR/Cas9 sistemidir. Bu sistem, hedef gende istenilen düzenlemelerin yapılmasını sağlar. CRISPR/Cas9 sisteminde; Cas9 proteinindeki mutasyonla elde edilen CRISPR/dCas9 sistem gende düzenleme yapılmasına olanak tanır. Bu sistem; hedef gende mutasyon yapmadan, genin ekspresyonunun artmasını (aktivasyon) ya da azalmasını (represyon) sağlar. Ancak bu sistemin çalışabilmesi için dCas9 proteinine bir aktivatör domain (genin ekspresyonunun artması için) ya da baskılayıcı bir domainin bağlanması gerekir. CRISPR/dCas9-VPR sistemi memelilerde istenilen genin aktivasyonunda kullanılan sistemdir. Yaptığımız bu çalışmadaki amacımız; CRISPR/dCas9-VPR sistemi kullanarak Pdx1 geninin aktivasyonunu arttırmayı sağlamaktı. Sonuç olarak; CRISPR/dCas9-VPR sistemi kullanılarak Pdx1 geninin proksimal promoter bölgesinde bu geninin aktivasyonunu sağlayan önemli bölgeler belirlendi.
Özet (Çeviri)
Diabetes mellitus (DM) is a metabolic disorder caused by the absence of insulin hormone or by the inability to influence this hormone. It is known that many genes play a role in the formation of pancreas and differentiation of beta cells. These cells have the potential to differentiate into other types of cells, such as nerve cells, nerve cells, and blood cells. Many methods are used to regulate this gene. Among these, the most common method in recent times is the CRISPR/Cas9 system used by bacteria in the immune response. This system ensures that the desired arrangements are made in the target gene. In the CRISPR/Cas9 system, the CRISPR/dCas9 system, obtained by mutation in the Cas9 protein, allows the regulation of genes. This system allows the expression of the gene to increase (activation) or decrease (suppression) without mutating the target gene. In order for this system to work, however, it must be connected to the dCas9 protein to an activator domain (to increase gene expression) or to a suppressor domain. CRISPR/dCas9-VPR system is the system used in the activation of the desired gene in mammals. Our purpose in this study; Using the CRISPR/dCas9-VPR system, it was to increase the activation of the Pdx1 gene. As a result, significant areas of activation of the Pdx1 gene in the proximal promoter region were determined using CRISPR/dCas9-VPR system.
Benzer Tezler
- Pankreatik genlerin CRISPR yöntemi ile aktivasyonu esnasında farklı dCas9-aktivatör komplekslerinin karşılaştırılması
Comparison of different dCas9-activator complexes during activation of the pancreatic genes by CRISPR method
ADEM KABA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET FATİH CENGİZ
DR. ÖĞR. ÜYESİ ERSİN AKINCI
- The use of CRISPR/dCas9 engineered mscs and exosomes to prevent cisplatin-induced ovarian failure in mice
Farede sisplatin ile indüklenen ovaryen yetmezliği önlemek için CRISPR/dCas9 ile tasarlanmış mezenkimal kök hücrelerin ve eksozomlarının kullanımı
ARİANA SİVASLIOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiKoç ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SERÇİN KARAHÜSEYİNOĞLU
- The use of CRISPR/DCAS9 engineered mscs to prevent cisplatin-induced cellular damage in human granulosa cells
Sisplatin ile indüklenen insan granüloza hücrelerinde ki hücre hasarini önlemek için CRİSPR/DCAS9 tasarlanmiş MSC'lerin kullanimi
MEHMET YUNUS ÇOMAR
- Re-establishment of fertilization competency of the oocyte via CRISPR/DCAS9 epigenome edıtıon technology
CRISPR/DCAS9 epigenom düzenleme teknolojisi kullanılarak oositin döllenme yeteneğinin geri kazandırılması
GİZEM NUR ŞAHİN
Doktora
İngilizce
2022
Histoloji ve EmbriyolojiKoç ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERÇİN KARAHÜSEYİNOĞLU
PROF. ÖZGÜR ÖKTEM
- Generation of a reporter-retinitis pigmentosa mouse model for retinal regeneration studies using CRISPR/dCAS9-based artificial transcription factors
CRISPR/dCAS9-temelli yapay transkripsiyon faktörleri kullanarak retinal rejenerasyon çalışmaları için bir raportör-retinitis pigmentoza fare modelinin oluşturulması
YEŞİM TÜTÜNCÜ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
GenetikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CAVİT AĞCA