Transgenik patateste farklı promotörlerin aktivitesinin karşılaştırılması
Comparison of different promoter activities in transgenic potato
- Tez No: 577168
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ALLAH BAKHSH
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Ziraat, Biotechnology, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 110
Özet
Bu tez çalışmasında patatesten elde edilen yeşil dokuya özgü pRCA promotörü ile Arabidopsis thaliana bitkisinden elde edilen ve stres koşullarında uyarılabilen pRD29A promotörünün Lady Olympia patates (Solanum tuberosum L.) çeşidinde gen ifade seviyelerine bakılmıştır. Çalışmada konstitütif -35S CaMV promotörü kontrol olarak kullanılmıştır. Seçilen promotörler GUS-INT genini kontrol edecek şekilde pCAMBIA-1301 plazmidine yerleştirilmiştir. Bitki transformasyonu Agrobacterium tumefasiens bakterisinin LBA4404 suşu aracılığıyla sağlanmıştır. Eksplant olarak yaprak ve boğum araları kullanılmıştır. Elde edilen transgenik hatlar histokimyasal GUS analizi, PCR, gen ifadesini belirlemek için qRT-PCR ve fluorogenik assay analizi kullanılarak doğrulanmıştır. Laboratuvar koşullarında transgenik bitkilerin taranması için higromisin fosfotransferaz (hptII), en uygun konsantrasyonda (5 mg/l) kullanılmıştır. Transformasyon etkinliği % 0,98 olarak hesaplanmıştır. pRD29A içeren transgenik patateslerde GUS gen ifadesinin kontrol koşullara göre farklı abiyotik stresler altında 10 kattan fazla arttığı gözlemlenmiştir. pRCA promotöründe kök/yumru kısımlarına göre yapraklarda GUS gen ifadesi 4 kat artmıştır. Bu promotörlerin aktivitelerine bakılarak, ileride farklı genler ile beraber kullanılmaları durumunda patateste transgenik teknolojinin risklerini minimuma indirmek ve olumsuz çevre koşullarına dayanıklı patates hatları geliştirmek mümkün olabilir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, the efficiency of green tissue specific (pRCA, isolated from potato) and stress inducible promoter (pRD29A, isolated from Arabidopsis thaliana) was compared in transgenic potato (Solanum tuberosum L.) plants in comparison with constitutive promoter (35S CaMV). The promoter fragments were cloned upstream to a reporter gene (GUS-INT) in pCAMBIA-1301 binary vector. Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404 harboring recombinant binary vector was used to infect leaf discs and internodal explant of Lady Olympia cultivar. Transgenic lines were verified by GUS histochemical analysis, PCR, gene expression via RT-qPCR and fluorogenic GUS assay techniques. Hygromycin phosphotransferase (hptII) was used at optimal concentration (5 mg/l) for the screening of in vitro cultured putative transgenic plants. Overall transformation efficiacy was calculated as 0,98%. As a result of the validation methods, pRD29A transgenic potatoes were observed to increase GUS gene expression more than 10 times in different abiotic conditions compared to controls. In pRCA promoter, GUS gene expression was increased 4-fold in leaves compared to root / tuber parts. The results of this study encourage the appropriate use of promoter to drive the expression of foreign gene(s) for the development of potato lines resistant/tolerant against biotic and abiotic stresses. Thus, minimizing the risks of transgenic technology can be possible in potatoes using different genes under suitable promoters in the future.
Benzer Tezler
- Yaralanmayla aktif olan AoPR1 promotörünün kontrolü altındaki CRY genlerinin protein üretimlerinin patateste sınırlandırılması
Restriction of CRY gene protein production under the control of wound-induced AoPR1 promoter in potato
HÜSEYİN ABDULLAH AHMED AHMED
Doktora
Türkçe
2014
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEBAHATTİN ÖZCAN
- Pyramiding of insecticidal genes in potato to encode resistance against colorado potato beetle, leptinotarsa decemlineata (Say), (Chrysomelidae: Coleoptera)
Patateste gen piramit tekniği kullanarak patates böceğinin, leptınotarsa decemlıneata (Say), (Chrysomelidae: Coleoptera), direnç yönetimi
MUHAMMAD SALIM
Doktora
İngilizce
2019
ZiraatNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiBitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYHAN GÖKÇE
- Agrobacterium-mediated genetic transformation and microtuberization of potato (solanum tuberosum L.)
Patateste (solanum tuberosum L.) agrobacterium aracılığıyla genetik transformasyon ve mikroyumru üretimi
İREM KARAMOLLAOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2000
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
PROF. DR. ŞEBNEM ELLİALTIOĞLU
- Agrobacterium-mediated transformation of Turkish sweetpotato cultivar using a marker gene
Türk tatlı patates çeşidinde Agrobacterium aracılığı ile markör gen transferi
SENA DAMLA OKTAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BAHAR SOĞUTMAZ ÖZDEMİR
- Herbisite direnç geni CP4-EPSPS'nin Agrobacterium tumefaciens aracılığıyla patatese aktarılması
Agrobacterium tumefaciens mediated genetic transformation of potato with CP4-EPSPS herbicidal gene
SAFA SÜMER
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALLAH BAKHSH