Geri Dön

An investigation of hnrnpa1 functions in breast cancer

Meme kanserinde hnrnpa1 fonksiyonlarının incelenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 577796
  2. Yazar: İBRAHİM ÖZGÜL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Onkoloji, Biology, Genetics, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Heterojen nükleer ribonükleoprotein A1 (HNRNPA1) geniş çaplı fonksiyonları olan bir RNA-bağlayıcı proteindir. Fonksiyonları arasında transkripsiyonal ve translasyonel mRNA kontrolü, nükleustan mRNA transferi, alternatif splicing, telomer bakımı, ve mikro RNA işlenmesi bulunur. Mikro RNA işlenmesi, bu fonksiyonlar arasında en az anlaşılan ve çalışan görevidir. Bu çalışmada, HNRNPA1 tarafından regüle edilen diğer potansiyel mikro RNA'ları bulmayı amaçlamaktayız. MCF7 hücrelerinde HNRNPA1 shRNA metoduyla susturulmuş ve bu hücrelere NanoString teknolojisi uygulanmıştır. Sonuç olarak çok fazla sayıda mikro RNA'nın seviyesi değişmiştir. Bunlardan biri, mir-21, bir onkomirdir ve HNRNPA1'nin hücrede kaybı bu mikro RNA'nın gen ifadesinin düşmesine yol açmıştır. Üstelik, CRISPR/Cas9 metoduyla silinmiş HNRNPA1 geni, VMP1 geninin seviyesini önemli bir şekilde değiştirmezken, pri-mir-21 seviyesinin düşmesine yol açmıştır. Aynı hücrelerde, üç farklı mir-21 hedef mRNA'sının (STAT3, BCL2 ve PDCD4) ifadelerinde artış gözlemlenmiştir. Mir-21 birden farklı kanser türünde tanısal ve tedavisel potansiyeli olan bir onkojenik mikro RNA'dır. Bundan dolayı, mir-21'in kanserde regülasyon yolaklarının açıklanması büyük önem arz etmektedir. Bu bulgular, HNRNPA1 proteininin meme kanseri hücre hattı MCF7'de mir-21 ifadesini regüle edebileceğini göstermektedir. Gelecek çalışmalar bu mekanizmanın açıklanmasında daha çok detay sağlayacaktır.

Özet (Çeviri)

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 (HNRNPA1) is an RNA-binding protein with a broad range of functions including transcriptional and translational regulation of mRNAs, transport of mRNAs from the nucleus, alternative splicing, telomere maintenance, and miRNA processing. Among all, miRNA related functions of HNRNPA1 are the least understood. Hence, in this study, we aim to investigate potential miRNAs regulated by HNRNPA1.Using HNRNPA1-silenced MCF7 cells, we identified several notable miRNAs using NanoString technology that responded to the loss of HNRNPA1. One of these miRNAs was mir-21, an oncogenic miRNA, that is significantly downregulated in response to loss of HNRNPA1. Furthermore, CRISPR/Cas9 deletion of HNRNPA1 showed downregulated pri-mir-21 levels with little to no change in the host gene (VMP1) expression. Three different mRNA targets of mir-21(STAT3, BCL2, and PDCD4) also showed upregulation upon HNRNPA1 deletion. Mir-21 is a well-accepted oncogenic miRNA that has potential diagnostic and therapeutic roles in many different cancers. Therefore, understanding the regulatory mechanisms behind mir-21 levels in cancer is of interest. Results suggest that HNRNPA1 may regulate the mir-21 levels in breast cancer cell line MCF7. Future studies will provide a more detailed mechanistic explanation.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    411814

    Birecik bölgesindeki koyunlarda bakır, çinko ve demir seviyelerinin araştırlması

    An investigation of blood iron, copper and zinc levels in sheep at region of Birecik

    MUSTAFA ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Veteriner HekimliğiHarran Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜRBÜZ AKSOY

    YRD. DOÇ. DR. GÜZİN ÖZKURT

  2. Tez No

    411988

    Samsun organize sanayi bölgesinde hava kalite parametrelerinin izlenmesi ve meteorolojik parametrelerle ilişkilerinin incelenmesi

    An investigation of the relationshios with meteorological parameters and monitoring of air quality parameters in organized industrial region of samsun

    ANDAÇ AKDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Çevre MühendisliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN NURİ ERGUN

  3. Tez No

    412351

    7 - 19 yaş aile rehberliği eğitimi programının annelerin aile tutumlarına etkisinin incelenmesi

    An investigation of the effect of 7 - 19 age family guidance program on the mothers family attitudes

    AHMET BAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Eğitim ve ÖğretimMevlana Üniversitesi

    Rehberlik ve Psikolojik Danışmanlık Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AHMET BEDEL

  4. Tez No

    413501

    Aydın kenti örneğinde gençlik parkı çocuk oyun alanının yeterliliği ve tasarım ilkeleri yönünden incelenmesi

    An investigation of the youth park playground in terms of adequacy and design principles: The case of Aydın city

    SEVDANUR BALLIOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Peyzaj MimarlığıKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Peyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖNER DEMİREL

    DOÇ. DR. ZÖHRE POLAT

  5. Tez No

    414402

    Rehberlik ve psikolojik danışma öğrencilerinin özduyarlık ve mükemmeliyetçilikleri arasındaki ilişkinin incelenmesi

    An investigation of relation between self compassion and perfectionism among psychological guidence and counseling students

    HATİCE TEZCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Eğitim ve ÖğretimMarmara Üniversitesi

    Eğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA OTRAR

Geri Dön