Geri Dön

Role of butyrate in post-transcriptional regulation of ınflammatory genes by regulating rna binding proteins

Rna'ya bağlanan proteinleri düzenleyerek i̇nflamatuvar genlerin post-transkripsiyonel düzenlenmesinde butiratin rolü

  1. Tez No: 577843
  2. Yazar: AYDAN TORUN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SREEPARNA BANERJEE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Kısa zincirli yağ asitlerinin (KZYAlar) bağırsakta kommensal bakteriler tarafından üretildiği ve siklooksijenaz-2 (COX-2) dahil olmak üzere sitokinleri ve inflamatuvar aracıları transkripsiyonel olarak inhibe ederek inflamasyonu azalttığı gösterilmiştir. Hipotezimiz, bir KZYA olan bütiratın, RBPlerin ifadelerini global olarak veya sitoplazmik translokasyonlarını etkileyerek transkripsiyon sonrası düzenlenmelerinde rol oynayabileceğidir. Kolorektal kanser hücre hatlarını sodyum bütiratla (NaBt) muamele ettik ve bütiratın, çeşitli RBPlerin genel protein ifadesini azalttığını ve stabilize edici RBP, HuR'nin sitoplazmik translokasyonunu inhibe ettiğini gözledik. Bu, butirat ile muamele edildiğinde birkaç farklı AU-zengin element (ARE) sekansının NanoLuc raportör aktivitesindeki azalma ile desteklendi ve bu azalma HuR fazla ifade edildiğinde bile sürdürüldü. HuR'nin gözlenen azalan aktivitesinin, butirat muamelesinden kaynaklı p38 ve MK2 fosforilasyonundaki azalmanın ve Chk2nin fosforilasyonunda artışın bir sonucu olduğunu gösterdik. Sonuçlarımız, bütiratın, inflamatuvar genlerin ifadesini sadece transkripsiyonel olarak değil, transkripsiyon sonrası mRNA stabilize edici proteinleri inhibe ederek azaltabileceğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Short chain fatty acids (SCFAs) are generated in the gut by commensal bacteria and are known to reduce inflammation by inhibiting the expression of inflammatory mediators. There are indications that SCFAs can also affect gene expression post transcriptionally. We have hypothesized that butyric acid, a SCFA, can mediate the post-transcriptional regulation of inflammatory mediators such as Cyclooxygenase-2 (COX-2) by affecting the global expression or cytoplasmic translocation of RNA binding proteins (RBPs). We treated colorectal cancer cell lines with sodium butyrate (NaBt) and observed that butyrate reduced the general protein expression of various RBPs and inhibited the cytoplasmic translocation of the stabilizing RBP, HuR. This was supported by a reduction in the NanoLuc reporter activity of several different AU- rich element (ARE) sequences when treated with butyrate and this reduction was maintained even when HuR was overexpressed. We showed that the observed reduced activity of HuR was a consequence of a decrease in p38 and MK2 phosphorylation and increased phosphorylation of Chk2 due to butyrate treatment. Our results suggest that butyrate can reduce the expression of inflammatory genes not only transcriptionally but also post-transcriptionally by affecting the subcellular localization or expression of mRNA stabilizing proteins.

Benzer Tezler

  1. Üç boyutlu kolorektal kanser modelinde bütirat ve melatonin'in kemoterapi etkinliğindeki rolü

    The role of butyrate and melatonin in chemotherapy effectiveness in three dimensional colorectal cancer model

    TOLGA SEVER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    OnkolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Onkoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM ÇALIBAŞI KOÇAL

  2. İn vitro Spinal Muscular Atrophy (SMA) modelinde sodyum bütirat etken maddesinin moleküler mekanizmasının araştırılması

    Investigation of the molecular mechanism of sodium butyrate in in vitro Spinal Muscular Atrophy (SMA) model

    NAZLICAN YÜREKLİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Tıbbi BiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKAN KILIÇ

  3. Investigation of the effect of sodium butyrate induced differentiation on inflammatory pathways in colon cancer cells

    Kolon kanser hücre hatlarında sodyum bütiratla indüklenmiş farklılaşmanın enflamasyon yolaklarına etkisinin incelenmesi

    MÜMİNE KÜÇÜKDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SREEPARNA BANERJEE

  4. Morris su labirenti uzaysal öğrenme ve bellek modelinde, sıçan hipokampüsünde histon asetilasyonu ve histon deasetilaz inhibitörünün etkisi

    The role of histone acetylation and inhbition of hdac on spatial learning and memory in morris water maze in rat hippocampus

    RUHAN TOPUZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Eczacılık ve FarmakolojiTrakya Üniversitesi

    Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÇETİN HAKAN KARADAĞ

  5. Ketojenik diyetin yaşlı sıçanlarda aquaporin-4 (AQP4) aracılı glimfatik sistem üzerindeki etkisinde bağırsak mikrobiyotasının rolünün araştırılması

    Investigation of the role of gut microbiota in the effect of a ketogenic diet on the aquaporin-4 (AQP4) mediated glymphatic system in elderly rats

    RABİA ILGIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    FizyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FERDA ULVİYE HOŞGÖRLER

    PROF. DR. NAZAN UYSAL HARZADIN