Çevre su örneklerinde Legionella pneumophila ve makrolid dirençlerinin araştırılması
Investigation of Legionella pneumophila and macrolide resistance in environmental water specimens
- Tez No: 580118
- Danışmanlar: PROF. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Legionella pneumophila, Legionellosiz olarak adlandırılan ciddi pnömoniye neden olabilir. Çalışmamızda Lpn serogrupları üzerinde makrolid grubu antibiyotiklerin etkinliği ve etkinlik derecesini belirleyen effluks pompasını kodlayan gen bölgeleri araştırıldı. Azitromisin, eritromisin ve klaritromisinin çevresel ve hastane su sistemlerinden izole edilen 43 Legionella spp. suşu üzerine etkileri değerlendirildi. Aglutinasyon kiti ile Lpn türlerinin serogrupları belirlendi. Serogrupları belirlenen 30 Lpn suşundan (15 Sg 1, 15 Sg 2-14) üç Sg 1 (no.10,13,30) ve 3 Sg 2-14 (no.16,17,26) suşlarında test edilen antibiyotiklere karşı DDT'nde zon oluşumu izlenmedi ve bu suşların MIC değerleri ≥ 256 µg/mL olarak tespit edildi. Bu 6 suş ile MIC değeri düşük olan (no.9) suşun effluks pompasını kodlayan gen bölgeleri olan lpp 2879 ve lpp 2880'in baz dizilimleri, RT-PCR kullanılarak kantitatif olarak yapılan analizlerinde Lpn Philadelphia 1 standart suşun Ct değeri 16,74 olarak bulundu. Zon oluşturan ve MIC değeri okunabilen suşumuzun Ct değeri 11,5 iken zon oluşturmayan ve MIC değeri ≥ 256 µg/mL olan suşların Ct değerleri sıfır olarak tespit edildi. Çalışmamız sonucunda, DDT'nde zon oluşturmayan ve MIC değeri ≥ 256 µg/mL olan suşlara ait effluks pompasını kontrol eden gen bölgelerindeki baz dizilerinin, MIC değeri okunabilen, zon oluşturan suşlardan farklı olduğu belirlenmiştir. Gen bölgelerindeki bu farklılığın, effluks pompasının yapısı ve işlevini değiştirdiği, böylece ilaç aktivite seviyelerinde farklılıklara neden olduğu düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Legionella pneumophila can cause severe pneumonia called Legionellosis. In our study, gene regions encoding efflux pump which determine the efficacy and efficacy of macrolide antibiotics on Lpn serogroups were investigated. The effects of azithromycin, erythromycin, clarithromycin on 43 Legionella-spp. strains isolated from environmental and hospital water systems were evaluated. Serogroups of Lpn species were determined by agglutination kit. Against the antibiotics tested in three Sg-1 (no.10,13,30) and 3 Sg2-14 (no.16,17,26) strains from 30 Lpn strains (15 Sg1, 15 Sg2-14) whose serogroups were determined No zone formation was observed in DDT and the MIC values of these strains were ≥256 µg/mL. The base sequences of the lpp2879 and lpp2880, the gene regions encoding the efflux pump of these 6 strains and the low MIC (no.9) strain, were quantitatively analyzed using RT-PCR and the Ct value of the Lpn Philadelphia 1 standard strain was found 16.74. While the Ct value of our strain-forming strain, whose MIC was readable, was 11.5, the Ct values of the non-zone-producing strains with MIC values ≥256 µg/mL were found to be zero. As a result of our study, it was found that the base sequences in the gene regions controlling the efflux pump of the strains that did not create zone in DDT and whose MIC value was ≥256 µg/mL were different from the zone forming strains whose MIC values could be read. This difference in gene regions is thought to alter the structure and function of the efflux pump, thereby causing differences in drug activity levels.
Benzer Tezler
- Klinik ve çevre örneklerinde Legionella Pneumophila'nın kültür yöntemi ile araştırılması
Başlık çevirisi yok
ÇİĞDEM BANU ÇETİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1996
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıEge ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Antimikrobiyal katkılı soğutma kulesi yapı malzemesinde biyofilm oluşumunun izlenmesi
Monitoring of biofilm formation on antimicrobial treated cooling tower construction materials
SEVAL BAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NAZMİYE ÖZLEM ŞANLI
- Rapid detection and identification of bacterial pathogens in drinking water sources using DNA-based methods and immunoimmobilization technology
İçme suyu kaynaklarındaki bakteriyel patojenlerin DNA'ya dayalı yöntemler ve immünoimmobilizasyon teknolojisi kullanılarak tespiti ve tanımlanması
ŞÜKRİYE ÇELİKKOL AYDIN
Doktora
İngilizce
2013
BiyoteknolojiBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAHAR İNCE
PROF. DR. RECEP AVCI
- Soğutma kulelerinden izole edilen gram negatif bakterilerde N-açil homoserin lakton (AHL) üretiminin incelenmesi
Investigation of acylated homoserine lactone (AHL) molecule production in gram negative bacteria isolated from cooling towers
EZGİ HASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYTEN ERDEM
- Organofosforlu insektisitlerin Antalya çevre su örneklerinde bozunmalarına etki eden faktörlerin incelenmesi
Investigation of the factors that effecting the degradation of organophosphourus insecticides in environmental water samples in Antalya
SİBEL ÖZDEMİR