Türkiye Eurygaster austriaca Schrk. (Hemıptera: Heteroptera: Scutellerıdae) popülasyonlarındaki genetik farklılıkların belirlenmesi
Determination of genetical differences in Turkish populations of Eurygaster austriaca Schrk. (Hemiptera: Heteroptera: Scutelleridae)
- Tez No: 588026
- Danışmanlar: PROF. DR. ERHAN KOÇAK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Isparta Uygulamalı Bilimler Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 81
Özet
Bu tez çalışmasında, Türkiye genelinde 17 ilin buğday ekim arazilerinden toplanan Eurygaster austriaca Schrk. popülasyonlarının 14 farklı AFLP moleküler marker primer kombinasyonuyla genotip farklılıklarının ortaya konulması hedeflenmiştir. Yassı vücutlu süne (E. austriaca) ile ilgili gerçekleştirilmiş herhangi bir moleküler çalışmaya rastlanamadığı için genotipleme protokolü olarak AFLP metodu tercih edilmiştir. Yassı vücutlu süne için hiçbir genom bilgisi mevcut olmadığından, herhangi bir dizi bilgisine bağlı olmayan ve ayrıca duyarlı ve güvenilir bir teknik olduğu kabul edilmiş olan AFLP tekniği kullanılmıştır. Moleküler çalışmaların sonucunda, en yüksek polimorfizm Uşak popülasyonunda %45.4, en düşük polimorfizm oranı Bursa popülasyonunda %17.7 olarak belirlenmistir. En yüksek polimorfizm oranını (%86.8) elde ettiğimiz reaksiyonda kullanılan primer çifti EcoRI ATT – MseI CGG'dir. En düşük polimorfizm oranını (%53.9) elde ettiğimiz reaksiyonda kullandığımız primer çifti ise, EcoRI ACC – MseI CCC'dir.AMOVA (Analysis of Molecular Variance) analizi sonucunda elde edilen popülasyonlar arası varyasyon değeri %23.08 düzeyinde bulunmuş, popülasyonlar içerisinde ise bu değer %76.91 seviyesinde tespit edilmiştir. PhiST değeri 0.23 olarak bulunmuştur. Popülasyonlar arası genetik farklılaşma, neighbour joining ve UPGMA dendrogramları popülasyonların farklılaşmalarını belirlemiştir. Görsellik açısından ek olarak Principle Coordinate Analizi popülasyonların gruplanmalarını daha net bir şekilde ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
In this thesis work, it was aimed to find out genetical differences of Eurygaster austriaca Schrk. populations collected from cultivated areas of 17 provinces across Turkey by using 14 different AFLP molecular marker primer combinations. In order to conduct studies concerning genetic variability of pest (E. austriaca), genotyping protocol was slightly modified. There were no genome information available for the pest so amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique was chosen since it does not depend on any prior sequence information of the samples and also is a sensitive and reliable technique. As a result of molecular studies, while the highest polymorphism was 45.4% in the Uşak population, the lowest polymorphism rate was 17.7% in the Bursa population. The highest polymorphism rate (86.8%) was obtained by using EcoRI ATT - MseI CGG primer combination. The lowest polymorphism rate (53.9%) was obtained by using EcoRI ACC - MseI CCC primer combination.As a result of the AMOVA analysis, the variation value was found as 23.08% among the populations and 76.91% within the populations. The PhiST value was 0.23. Genetic differentiation between populations, neighbor joining and UPGMA dendrograms have identified differentiation of the populations. In terms of visuality, Principle Coordinate Analysis has clearly demonstrated the groupings of populations.
Benzer Tezler
- Türkiye'deki eurygaster lap. (Heteroptera:scutelleridae) türleri üzerinde sistematik araştırmalar
Systematical studies on the species of eurygaster lap. (heteroptera:Scutelleridae) from Turkey
HİVİN ABBAS
- Süne ve kımıl zararlılarının ses işleme yöntemleri ile sınıflandırılması ve bir gömülü sistem gerçeklemesi
Classification of sunn pests using sound processing methods and an embedded system realization
BİLGİ GÖRKEM YAZGAÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MÜRVET KIRCI
- Erzurum ili scutellerıdae (Hemıptera: Heteroptera) türleri üzerinde faunistik ve sistematik çalışmalar
Faunistic and systematic studies on the species of scutelleridae (Hemiptera: Heteroptera) in Erzurum province
NİHAL KARAKURT
- Türkiye' deki eurygaster integriceps popülasyonlarında serratia marcescens bakterisinin yaygınlığının belirlenmesi
Prevelance of serratia marcescens in eurygaster integriceps populations in Turkey
NECMİYE İNAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURPER GÜZ
- Türkiye'de süne (Eurygaster integriceps, Hemiptera:Scutelleridae) popülasyonlarında endosimbiont bakteri wolbachia enfeksiyonunun belirlenmesi
Determination of endosymbiont bacteria Wolbachia infections in sunn pest (Eurygaster integriceps, Hemiptera:Scutelleridae) populations from Turkey
İLYAS KARAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERHAN KOÇAK