Geri Dön

Karadeniz' de yayılış gösteren kudoa (Myxosporea: multıvalvulıda) türlerinin 28s rDNA filogenisi

28S rDNA diversity of kudoa spp. from the blacksea

  1. Tez No: 592450
  2. Yazar: ERKAN ÖZDEMİR
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CEM TOLGA GÜRKANLI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Balıkçılık Teknolojisi, Genetik, Parazitoloji, Fisheries Technology, Genetics, Parasitology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ordu Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 35

Özet

Bu çalışmada Kudoa anatolica ve K. niluferi türlerinin 28S rDNA genlerinin nükleotit dizilerine dayalı filogenetik analizleri amaçlanmıştır. Bu parazitler Karadeniz'in Sinop kıyılarında yakalanan Atherina hepsetus ve Neogobius melanostomus konaklarından izole edilerek tanımlanmıştır. Bu amaçla Kudoa anatolica'ya ait iki (AO-18, AO-20) ve K. nilüferi'ye ait bir (AO-24) bir izolatın 28S rDNA gen bölgelerinin nükleotit dizileri belirlenmiş ve Neighbor-Joining, Maximum-Likelihood ve Maximum-Parsimony algoritmaları kullanılarak filogenetik analizleri yapılmıştır. Filogenetik analizler sonucunda üç farklı algoritma ile oluşturulan ağaçların topolojik olarak farklı oldukları görülmüştür. Bunun sebebi olarak 28S rDNA gen bölgesinin yüksek miktarda varyasyon içermesi bu nedenle cins yada daha yüksek seviyedeki taksonomik kategorileri kapsayan filogenetik çalışmalar için uygun bir genetik markör olmadığı düşünülmektedir. Ayrıca bu çalışmada Karadenize ait bir Kudoa soyhattına dair destekleyici genetik bulgularda ortaya konmuştur.

Özet (Çeviri)

In the current study phylogenetic analyses depending on the nucleotide sequences of 28S rDNA of Kudoa anatolica ve K. niluferi were aimed. These parasites were isolated and identified from Atherina hepsetus and Neogobius melanostomus hosts from Sinop coasts of Blacksea. For this aim 28S rDNA nucleotide sequences belonging to two Kudoa anatolica isolates (AO-18, AO-20) and one K. niluferi isolate (AO-24) were determine and and phylogenetic analyses using Neighbor-Joining, Maximum-Likelihood ve Maximum-Parsimony algorithms were performed. As a result, topological differences were observed between phylogenetic trees created with three different algoritms. The reason of this case is the high amonth of variation within 28S rDNA gene regions which makes it unsuitable genetic marker for phylogenetic studies conserning genus or higher taxonomic levels. Additionally this study reveales additional genetic results supporting a Kudoa lineage specific to the Blacksea.

Benzer Tezler

  1. Türkiye'de yayılış gösteren glis glis (Lınnaeus, 1766) (mammalia:rodentia) populasyonlarının morfolojik ve filogenetik analizi

    Morphologic and phylogenetic analysis of Glis glis (Linnaeus, 1766)(mammalia: rodentia) populations distributed in Turkey

    SİBEL EYLEM EROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCÜMENT ÇOLAK

  2. Trakya ve Karadeniz bölgesinde yayılış gösteren Mus (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) cinsinin RAPD-PCR analizi

    RAPD-PCR analysis the genus Mus (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) in Thrace and Black Sea region

    SERRA ANGIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REYHAN ÇOLAK

  3. Batı Karadeniz ve Trakya'da yayılış gösteren Mus L., 1758 (Mammalia: Rodentia) cinsinin allozim varyasyonları

    Allozymic variations of the genus Mus L., 1758 (Mammalia: Rodentia) in Western Black Sea and Thrace

    UFUK GÜNDÜRÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. REYHAN ÇOLAK

  4. Türkiye kıyılarında dağılım gösteren Syngnathus (Syngnathidae) cinsine ait türlerin filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi

    Determination of the phylogenetic relationships of Syngnathus (Syngnathidae) species in Turkish seas

    ADNAN ÇAĞLAR ORUÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Su Ürünleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMİH ENGİN

  5. Türkiye'de yayılış gösteren Myodes glareolus Schreber, 1780 (Mammalia: Rodentia)'un filogenetik analizi

    Phylogenetic analysis of Myodes glareolus Schreber, 1780 (Mammalia: Rodentia) distributed in Turkey

    FATMA HÜMEYRA TAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REYHAN ÇOLAK

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜL OLGUN KARACAN