Soğan bakteriyel hastaklık etmenlerinin fenotipik karakterizasyonu ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR)ile tanısı
Phenotypic characterization of onion bacterial diseases and diagnosis by polymerase chain reaction (PCR)
- Tez No: 596297
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ZAHİDE ÖZDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 91
Özet
Bu tez çalışmasında soğan bitkisinde çürüklük meydana getiren bakteriyel etmenlerin fenotipik karakterizasyonu ve PCR yöntemi ile tanılanması yapılmıştır. Eskişehir ili soğan tarlalarından toplanan hastalıklı soğan örneklerinden izolasyon yapılmıştır. Otuz dört bakteriyel izolatın biyokimyasal testler ile fenotipik karakterizasyonu yapılmıştır. İzolatların patojenisiteleri soğan yumru kesitlerinin inokulasyonu ile belirlenmiştir. Biyokimyasal testler sonucu izolatların Pantoea (16), Pseudomonas (11 floresan ve 1 floresan olmayan) ve Enterobacter (4) cinslerine ait olduğu belirlenmiş iki izolatın ise tanısı yapılamamıştır. İzolatlar farklı derecelerde soğan kesitlerini çürütmüş dört izolat ise patojenik bulunmamıştır. Biyokimyasal testlerle Pseudomonas aeruginosa olduğu belirlenen ve yüksek patojenisiteye sahip bir izolatın tanısı, PCR ile çoğaltılan16S rDNA bölgesinin sekans analizi ile teyit edilmiştir. Pantoea cinsine ait iki izolatın PCR ile tanısı desteklenmiştir. Enterobacter cinsine ait 4 izolatın tRNA-ITS bölgesinin çoğaltımı ile 3 izolatın Enterobacter cloacae ATCC 13047 ile aynı band profili oluşturduğu bulunmuştur. Bilgimize göre ülkemizde, Pantoea, Pseudomonas ve Enterobacter türleri tarafından oluşturulan soğan bakteriyel hastalıklarının varlığı hakkında daha önce bir rapor bulunmamaktadır. Ülkemizde, Pantoea, Pseudomonas ve Enterobacter cinsine ait soğan bakteriyel hastalık etmenlerin varlığı ilk kez bu tez çalışması ile belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this thesis, phenotypic characterization and PCR detection of the bacterial agents that cause rotting in onion plants were done. Isolations were made from the diseased samples collected from onion fields in Eskişehir. The thirty-four bacterial isolates were characterized phenotypically by biochemical tests. Pathogenicity of the isolates was determined by the inoculation of onion scales. As a result of the biochemical tests the isolates were determined as Pantoea (16), Pseudomonas (11 fluorescent and 1 nonfluorescent) and Enterobacter (4) and the two isolates could not be identified. The isolates rot onion scales in variable degrees and four of them were found nonpathogenic. The isolate identified as Pseudomonas aeruginosa by the biochemical tests and with high pathogenicity was confirmed by PCR detection of the 16S rDNA region. Identification of the two isolates that belong to Pantoea genus was supported by PCR detection. tRNA-ITS region of the four isolates that belong to Enterobacter genus was amplified and found that the three isolates shown the same banding pattern with Enterobacter cloacae ATCC 13047. To our knowledge there is no previous report in Turkey about presence of the bacterial diseases of onion caused by the species of Pantoea, Pseudomonas and Enterobacter. In Turkey, presence of the onion bacterial disease agents that belong to Pantoea, Pseudomonas and Enterobacter genus was determined for the first time in this thesis study.
Benzer Tezler
- Bitki büyüme düzenleyici bakterilerin karakterizasyonu
Plant growth promoting bacteria characterization
ALPER DEDE
- Islah edilmiş bazı soğan genotiplerinde mildiyö (Peronospora destructor) hastalığına karşı dayanıklılık geninin varlığının incelenmesi
Investigation of the presence of a resistance gene against (Peronospora destructor) disease in some onion genotypes
REYHAN UÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatBursa Uludağ ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET İPEK
- Amasya ilinde yetiştirilen soğanlarda görülen dip çürüklüğü etmeni Fusarium oxysporum f.sp. cepae'nin karakterizasyonu ve bitki gelişimini teşvik eden kökbakterileri ile biyolojik mücadelesi
Characterization of basal rot disease agent Fusarium oxysporum f.sp. cepae observed growing onions in Amasya and biological control by plant growth promoting rhizobacteria
İDRİS BEKTAŞ
Doktora
Türkçe
2017
BiyomühendislikKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA KÜSEK
- Propolis ve soğan ekstraktlarının antimikrobiyal ve 3T3 fibroblast hücreleri üzerine etkileri
The effects of propolis and onion extracts on antimicrobial and 3T3 fibroblast cells
SEDAT BALCIOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
GenetikÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHSİN KONUK
- Gıda örneklerinde norovirüs ve rotavirüslerin moleküler ve serolojik yöntemler ile saptanması karakterizasyonu ve virüsler üzerine dezenfektanların etkilerinin belirlenmesi
Detection of norovirus and rotavirus in food samples by molecular and serological methods and determination of the effects of disinfectants on viruses
ÇAĞRI ÇELİK
Doktora
Türkçe
2023
Gıda MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL