Geri Dön

Translasyonel tıp bakış açısı ile candida albicans ve candida dubliniensis' in tanısı ve ayırıcı tanısında biyolojik gösterge olarak türe özgü yağ asidi metil ester araştırması

Species-specific fatty acid methyl ester research as a biological indicator in the diagnosis and differential diagnosis of candida albicans and candida dubliniensis with the translational medicine perspective

PDF İndir

  1. Tez No: 597367
  2. Yazar: CANSU AKGÜL KAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ABDURRAHMAN HÜSEYİN BASKIN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Candida albicans, Candida dubliniensis, Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu (MİK), Yağ Asidi Profilleri, Candida albicans, Candida dubliniensis, Minimum Inhibitory Concentration (MIC), Fatty Acid Profiles
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Translasyonel Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

daha sonra doldurulacaktırGiriş: Candida türleri konak savunma sisteminin zayıflaması durumunda 'fırsatçı patojen' olarak davranarak 'kandidazis' olarak adlandırılan enfeksiyonlara neden olurlar. Fenotipik ve genotipik açıdan birbirine oldukça benzer olmasından dolayı Candida albicans (Calbicans) ve Candida dubliniensis (C.dubliniensis) türlerinin tanı ve ayırıcı tanılarında zorluklar yaşanır. Candida albicans ve Candida dubliniensis türlerinin antifungallere karşı direnç – duyarlılık şekilleri farklılık gösterebildiği için, ayırıcı tanıları özellikle immün yetmezlikli hastalarda önem kazanır. C.dubliniensis' in birçok izolatının antifungallere karşı duyarlı olmasına rağmen 'multidrug transporter genleri' eksprese ederek direnç geliştirebilmektedir. MIDI Sherlock Mikrobiyal tanımlama sistemi, türe özgü olan mikrobiyal yağ asidi metil esterlerini (FAME) gaz kromatografisi (GC) cihazı ile analiz ederek mikroorganizmaların identifikasyonunu sağlar. Amaç: Calbicans ATCC 10231 ve C.dubliniensis CD36 standart suşlarının amfoterisin B antifungaline karşı 'Mininmum İnhibisyon Konsatrasyonu' (MİK) değerlerinin belirlenmesi, antifungal etkisinde biyofilm oluşumunun değerlendrilmesi ve yağ asidi profillerinin belirlenmesidir. Yöntem: Candida albicans ATCC10231 ve Candida dubliniensis CD36 standart suşlarından analiz için hazır 'hücresel yağ asitleri' elde edildi. Amfoterisin B antifungalinin Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu (MİK) değerlerini belirlemek için Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi (EUCAST) sıvı mikro dilüsyon yöntemi kullanıldı. Antifungal etkisindeki suşların biyofilm değerlendirmesi kristal viyole boyama yöntemi ile yapıldı. 2 Bulgular: C.albicans ATCC 10231 suşu için amfoterisin B MİK yoğunluğu 64 µg/ml olarak belirlendi. C.dubliniensis CD36 suşu için amfoterisin B MİK yoğunluğu 64 µg/ml olarak belirlendi. Antifungale maruz bırakılmayan C.albicans ATCC 10231 ve C.dubliniensis CD36 suşlarının biyofilm oluşturduğu saptandı. Suşların amfoterisin B MİK konsantrasyonlarında da biyofilm oluşturduğu görüldü. C.dubliniensis CD36 suşunun C.albicans ATCC 10231 suşuna göre yüzeye daha güçlü adere olduğu tespit edildi. Amfoterisin B antifungalinin MİK ve sub-MİK konsantrasyonları C.dubliniensis CD36 suşunun biyofilm olşumunda inhibisyona yol açarken, MİK yoğunluğu C.albicans ATCC 10231 suşunda anlamlı bir inhibisyona neden olmadığı belirlendi ve sub-MİK yoğunluklarında biyofilm oluşumunun istatiksel olarak anlamlı bir şekilde arttığı belirlendi. C.albicans ATCC 10231 suşuna spesifik iki, C.dubliniensis CD36 suşuna spesifik bir referans pik olduğu belirlendi. Bir tanesi dallanma özelliği farklı olan toplam altı ortak yağ asidi referans piki elde edildi. Sonuç: C.dubliniensis CD36 ve C.albicans ATCC 10231 suşlarının amfoterisin B antifungali için MİK yoğunlukları aynı olmasına rağmen C.dubliniensis CD36 suşunun yüzeye daha güçlü adere olduğu tespit edilmiştir. C.dubliniensisCD36 suşu yüzeye daha güçlü adere olmasına karşın, amfoterisin B antifungalinin inhibisyon etkisinin C.albicans ATCC 10231 suşuna göre daha fazla olduğu saptanmıştır. Elde edilen sonuçlar gösteriyor ki, morfolojik ve genotipik olarak birbirine benzer olan suşlarla yapılan analizlerde elde edilebilinecek türe özgü tanı belirteçleri, enfeksiyonun tanısının konulmasında ve seyrinin izlenmesinde son derece önemlidir.

Özet (Çeviri)

Introduction and Purpose: Candida species may act as an opportunistic pathogen in case of weakening of the host defense system and cause infections called as candidiasis. Because of the similar phenotypic and genotypic aspects, Candida albicans (C.albicans) and Candida dubliniensis (C.dubliniensis) have difficulties in the diagnosis and differential diagnosis. Since Candida albicans and Candida dubliniensis species differ in their resistance to antifungals, their differential diagnosis is particularly important in immunodeficient patients. Although many isolates of C. dubliniensis are sensitive to antifungals, they can develop resistance by expressing multidrug transporter genes. The MIDI Sherlock Microbial Identification System provides the identification of microorganisms by analyzing species-specific microbial fatty acid methyl esters (FAME) with gas chromatography(GC). Objective: Determination of 'Mininmum Inhibition Concentration' (MIC) values of fluconazole and amphotericin B antifungals of C.albicans ATCC 10231 and C.dubliniensis CD36 standard strains, evaluation of biofilm formation under antifungal effect and determination of fatty acid profiles. Method: Candida albicans ATCC10231 and Candida dubliniensis CD36 standard strains were prepared for analysis of cellular fatty acids. To determine the Minimum Inhibition Concentration (MIC) values of amphotericin B antifungals, European Antimicrobial Susceptibility Test Committee (EUCAST) liquid micro dilution method was used. Biofilm evaluation of strains under antifungal effect was performed by crystal violet staining method. 4 Results: The amphotericin B MIC concentration for C.albicans ATCC 10231 strain was 64 µg / ml. Amphotericin B MIC concentration for C.dubliniensis CD36 strain 64 µg / ml. It was determined that C. albicans ATCC 10231 and C. dubliniensis CD36 strains which were not exposed to antifungal were biofilm. The strains were also found to produce biofilm at amphotericin B MIC concentrations. C.dubliniensis CD36 was found to be more potent to the surface than C.albicans ATCC 10231. MIC and subMIC concentrations of amphotericin B antifungalin lead to inhibition of the biofilm formation of C.dubliniensis CD36 strain, while MIC concentration was determined not to cause a significant inhibition of C.albicans ATCC 10231 strain, and biofilm formation was significantly increased at sub-MIC concentrations It was identified that there were two reference peaks specific for C.albicans ATCC 10231 strain and a specific reference peak for C.dubliniensis CD36 strain. A total of six common fatty acid reference peaks were obtained, one of which had different branching properties. Conclusion:. Although MIC concentrations of C.dubliniensis CD36 and C.albicans ATCC 10231 were the same for amphotericin B antifungal, C.dubliniensis CD36 was found to be more potent to the surface. Although C. dubliniensis CD36 was more strongly adherent to the surface, it was found that the inhibition effect of amphotericin B antifungalin was higher than that of C.albicans ATCC 10231. The results show that species-specific diagnostic markers that can be obtained in the analysis of strains that are morphologically and genotypically similar to each other are extremely important in diagnosing and monitoring the course of the infection.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    574390

    Akciğer adenokarsinomu olgularında ezh2 ve cd10 ekspresyonunun önemi

    The importance of ezh2 and cd10 expression at lung adenocarcinoma cases

    KENAN BARIŞ BİNGÜL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    PatolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ VERAL

  2. Tez No

    559860

    Osteogenezis imperfekta hastalarında morbiditeye etki eden faktörlerin retrospektif olarak değerlendirilmesi

    Retrospective evaluation of the factors affecting morbidity in patients with osteogenesis imperfecta

    PARISA SADAT HOSSEINI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Anestezi ve Reanimasyonİstanbul Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET İLKE BÜGET

  3. Tez No

    687354

    Structural bioinformatics analysis of the candidate tumor suppressor protein CTCF

    Aday tümör baskılayıcı protein CTCF'in yapısal biyoenformatik analizi

    SİNEM DARWISH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Biyoistatistikİstanbul Medipol Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ KIVANÇ KÖK

  4. Tez No

    647352

    Identification of genes conferring resistance to chemotherapeutic drugs

    Kemoterapötik ilaçlara karşı direnç kazandıran genlerin belirlenmesi

    İRFAN BAKİ KILIÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

    Moleküler ve Translasyonel Biyotıp Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE DENİZ

  5. Tez No

    856287

    Investigation of the effect of v-set transmembrane domains containing-5 (VSTM5) protein on the growth rate of consensus molecular subtype -1 (CMS1) group colon adenocarcinoma cell line cells

    V-set transmembran domain içeren-5 (VSTM5) proteininin konsensüs moleküler alt tıp-1 (CMS1) grubu kolon adenokarsinoma hücre hattı hücrelerinin büyüme hızına etkisinin incelenmesi

    ADİLE BUSE ANDAÇ AKTAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Genetikİzmir Ekonomi Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BARIŞ EMRE DAYANÇ

    DOÇ. DR. OSMAN DOLUCA

Geri Dön