Geri Dön

Üriner ve solunum yolu enfeksiyonlarından izole edilen E.colı ve klebsıella izolatlarında bazı virülans genleri ile antibiyotik direnç genlerinin sıklığı

The frequency of some virulence genes and antibiotic resistance genes in E. coli and klebsiella isolates isolated from urinary and respiratory infections

PDF İndir

  1. Tez No: 604493
  2. Yazar: ALİ ATEŞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NİZAMİ DURAN
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: E. coli, Klebsiella, antibiyotik direnç, kolistin, gen, virülans, E. coli, Klebsiella, antibiotic resistance, colistin, gene, virulence
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 143

Özet

Amaç: İdrar ve solunum yollarından izole edilen E. coli ve Klebsiella suşlarında mukoidal fenotiple ilişkili virulans genleri (magA, rmpA, wcaG), kinolon direnç genleri (qnrA, qnrB, qnrS), karbepenem (KPC) ve kolistin (mcr-1) direnç genlerinin sıklığını ve fenotipik yöntemlerle elde ettiğimiz antibiyotik direnç profillerinin karşılaştırmasını yapmayı hedefledik. Ayrıca 2011 yılı Suriye savaşından sonra önemli bir mülteci merkezi haline gelen Hatay bölgemizde Suriye kökenli hastalarla Türk hastaların antibiyotik direnç profillerinin karşılaştırılması da planlanmıştır. Yöntem: Bakterilerin identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılık testleri otomatize sistem ile kolistin direnci ise sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile belirlenmiştir. İzolatlardaki direnç ve virulans genleri multipleks PCR ile araştırılmıştır. Bulgular: İzolatların 127'si idrar, 37'si solunum numuneleriydi. Yetmiş dört E. coli, 68 K. pneomoniae ve 22 K. oxytoca suşlarının ampisilin, amoksisilin/klavulonik asit, sefuroksim aksetil, seftazidim, seftriakson, sefepim, trimetoprim/sulfametoksazol ve siprofloksasin antibiyotiklerine karşı yüksek direnç tespit edilmiştir. Tüm izolat türlerinde en düşük direnç kolistin, ertapenem, meropenem ve amikasine karşı saptanmıştır. E. coli, K. pneomoniae, K. oxytoca kökenlerinde kinolon direnci sırasıyla %66.2, %52.9 ve %59 olarak tespit edilmiştir. Kinolon direnci ile ilişkili qnrA geni E. coli, K. pneomoniae, K. oxytoca kökenlerinde sırasıyla %5.4, %0 ve %9.1, qnrB geni sırasıyla %17.5, %23.5, %22.7, qnrS geni ise sırasıyla %9.4, %16.1, %22.7 oranlarında saptanmıştır. Tüm izolatlar dikkate alındığında ertapanem direncinin %10.3, meropenem direncinin ise %9.7 olduğu saptanmıştır. Ancak karbapenem direnç genlerinden KPC-2 tespit edilmemiştir. Toplam 7 (%4.2) izolatta kolistin direnci saptanırken, kolistin direnci ile ilişkili mcr-1 genine rastlanmamıştır. Tüm izolatlar dikkate alındığında virülans genlerinden rmpA, wcaG ve magA gen oranları sırayla %6.7, %4.2 ve %1.2 olarak bulunmuştur. Sonuçlar: İdrar ve solunum yolu örneklerinden izole edilen K. pneomoniae, E. coli ve K. oxytoca kökenlerinde ampisilin, amoksisilin klavulonik asit, sefuroksim aksetil, seftazidim, seftriakson, sefepim, trimetoprim sulfametoksazol ve siprofloksasin gibi ajanlara karşı olan yüksek direnç oranları göz önünde bulundurulmalıdır. İzolatlarda yüksek siprofloksasin direnci ile kıyaslandığında daha düşük qnr direnç gen oranlarına rastlanmıştır. Ancak qnr pozitifliği saptanan izolatlarda yüksek siprofloksasin direnç oranları tespit edilmiştir. Karbapenem direnç genlerinden KPC-2'ye ve kolistin direnci ile ilişkili genlerden mcr-1 pozitivitesine rastlanmamıştır. Virulans genleri (wcaG, rmpA, magA) genel olarak düşük oranlarda saptanırken en düşük oranda saptanan gen magA olmuştur.

Özet (Çeviri)

Aim: We aimed to investigate the frequency of virulence genes (magA, rmpA, wcaG) associated with mucoidal phenotype, quinolone resistance genes (qnrA, qnrB, qnrS), carbepenem (KPC) and colistin (mcr-1) resistance genes in E. coli and Klebsiella strains isolated from urinary and respiratory tracts and to compare the antibiotic resistance profiles obtained with phenotypic methods. In addition, it is planned to compare the antibiotic resistance profiles of Syrian patients and Turkish patients in Hatay region which became an important refugee center after the Syrian war of 2011. Methods: The identification of bacteria and antibiotic susceptibility tests were determined by automated system and colistin resistance was determined by liquid microdilution method. Resistance and virulence genes in the isolates were investigated by multiplex PCR. Results: 127 of the isolates were urine and 37 were respiratory samples. High resistance to ampicillin, amoxicillin / clavulonic acid, cefuroxime axetil, ceftazidime, ceftriaxone, cefepime, trimethoprim / sulfamethoxazole and ciprofloxacin antibiotics of 74 E. coli, 68 K. pneomoniae and 22 K. oxytoca strains were detected. The lowest resistance was detected against colistin, ertapenem, meropenem and amikacin in all isolate species. The quinolone resistance of E. coli, K. pneomoniae, K. oxytoca strains was 66.2%, 52.9% and 59%, respectively. The qnrA gene associated with quinolone resistance in E. coli, K. pneomoniae, K. oxytoca strains was 5.4%, 0% and 9.1%, respectively, qnrB gene was 17.5%, 23.5%, 22.7%, qnrS gene was 9.4%, 16.1%, 22.7% respectively. When all isolates were considered, it was found that ertapanem resistance was 10.3% and meropenem resistance was 9.7%. However, KPC-2, one of the carbapenem resistance genes, was not detected. While colistin resistance was detected in 7 isolates (%4.2), no mcr-1 gene related to colistin resistance was found. Considering all isolates, rmpA, wcaG and magA gene ratios of virulence genes were found to be 6.7%, 4.2% and 1.2%, respectively. Conclusion: High resistance rates against agents such as ampicillin, amoxicillin clavulonic acid, cefuroxime axetil, ceftazidime, ceftriaxone, cefepime, trimethoprim sulfamethoxazole and ciprofloxacin should be considered in K. pneomoniae, E. coli and K. oxytoca strains isolated from urine and respiratory samples. Compared to high ciprofloxacin resistance in isolates, lower qnr resistance genes were found. However, high ciprofloxacin resistance rates were detected in isolates with qnr positivity. KPC-2, one of the carbapenem resistance genes, and mcr-1, one of the genes related to colistin resistance, were not detected. Virulence genes were generally detected at a low rates and the lowest rate was magA.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    515334

    Tekrarlayan idrar yolu enfeksiyonu olan çocukların kolon mikrobiyotasında yüksek virulans özelliğine sahip escherichia coli izolatlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of escherichia coli isolates with high virulence in colon microbiota of children with recurrent urinary tract i̇nfection

    DİLEK AKKURT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıPamukkale Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELÇUK YÜKSEL

  2. Tez No

    793392

    Hastanemiz yoğun bakım ünitelerinde mart 2019-mart 2020 ve nisan 2020-nisan 2021 dönemlerinde yatan hastalarda meydana gelen kan dolaşımı enfeksiyonlarında saptanan bakterilerin ve antibiyotik direnç profillerinin karşılaştırılması

    Başlık çevirisi yok

    SÜMEYYE BAYRAM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FUNDA ŞİMŞEK

  3. Tez No

    835657

    COVİD-19 pandemisi döneminde yoğun bakım enfeksiyonlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of intensive care infections during the COVİD-19 pandemic

    ÖZLEM KURKAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Anestezi ve ReanimasyonManisa Celal Bayar Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖNÜL TEZCAN KELEŞ

  4. Tez No

    526384

    Piyasada satışa sunulan farklı gıda örneklerinden izole edilen Rhizopus türlerinde endofungal bakterilerinvarlığının araştırılması

    Investigation of presence of endofungal bacteriain Rhizopus spp. isolated from the different sourceson market

    DERYA BİROL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEM ABACI GÜNYAR

  5. Tez No

    822340

    İnvaziv stenotrophomonas maltophilia infeksiyonları predispozan faktörlerinin ve mortalite belirteçlerinin değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    NİHAT ÖNÜR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SERHAT BİRENGEL

Geri Dön